Protein–RNA interactions for Protein: P01857

IGHG1, Immunoglobulin heavy constant gamma 1, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHG1P01857 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IGHG1P01857 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IGHG1P01857 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IGHG1P01857 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IGHG1P01857 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IGHG1P01857 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IGHG1P01857 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IGHG1P01857 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IGHG1P01857 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IGHG1P01857 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
IGHG1P01857 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IGHG1P01857 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IGHG1P01857 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IGHG1P01857 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IGHG1P01857 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IGHG1P01857 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IGHG1P01857 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IGHG1P01857 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IGHG1P01857 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IGHG1P01857 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IGHG1P01857 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IGHG1P01857 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IGHG1P01857 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IGHG1P01857 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IGHG1P01857 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IGHG1P01857 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IGHG1P01857 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IGHG1P01857 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IGHG1P01857 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IGHG1P01857 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IGHG1P01857 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IGHG1P01857 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IGHG1P01857 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IGHG1P01857 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IGHG1P01857 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IGHG1P01857 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IGHG1P01857 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IGHG1P01857 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IGHG1P01857 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IGHG1P01857 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IGHG1P01857 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IGHG1P01857 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IGHG1P01857 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IGHG1P01857 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
IGHG1P01857 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IGHG1P01857 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
IGHG1P01857 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IGHG1P01857 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
IGHG1P01857 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IGHG1P01857 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IGHG1P01857 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IGHG1P01857 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IGHG1P01857 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
IGHG1P01857 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IGHG1P01857 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IGHG1P01857 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IGHG1P01857 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IGHG1P01857 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IGHG1P01857 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IGHG1P01857 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IGHG1P01857 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IGHG1P01857 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IGHG1P01857 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IGHG1P01857 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IGHG1P01857 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IGHG1P01857 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IGHG1P01857 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IGHG1P01857 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IGHG1P01857 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IGHG1P01857 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IGHG1P01857 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IGHG1P01857 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
IGHG1P01857 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IGHG1P01857 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IGHG1P01857 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IGHG1P01857 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IGHG1P01857 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IGHG1P01857 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IGHG1P01857 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IGHG1P01857 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IGHG1P01857 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IGHG1P01857 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IGHG1P01857 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IGHG1P01857 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IGHG1P01857 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IGHG1P01857 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IGHG1P01857 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IGHG1P01857 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IGHG1P01857 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IGHG1P01857 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IGHG1P01857 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IGHG1P01857 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IGHG1P01857 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IGHG1P01857 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IGHG1P01857 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IGHG1P01857 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IGHG1P01857 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IGHG1P01857 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IGHG1P01857 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IGHG1P01857 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms