Protein–RNA interactions for Protein: O95352

ATG7, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme ATG7, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG7O95352 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ATG7O95352 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATG7O95352 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATG7O95352 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATG7O95352 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATG7O95352 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATG7O95352 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATG7O95352 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATG7O95352 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATG7O95352 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATG7O95352 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATG7O95352 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATG7O95352 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATG7O95352 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATG7O95352 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATG7O95352 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATG7O95352 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATG7O95352 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATG7O95352 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATG7O95352 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATG7O95352 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATG7O95352 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATG7O95352 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATG7O95352 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATG7O95352 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATG7O95352 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATG7O95352 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATG7O95352 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATG7O95352 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATG7O95352 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATG7O95352 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATG7O95352 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATG7O95352 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATG7O95352 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATG7O95352 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATG7O95352 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
ATG7O95352 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATG7O95352 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
ATG7O95352 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATG7O95352 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATG7O95352 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATG7O95352 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATG7O95352 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATG7O95352 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATG7O95352 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATG7O95352 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATG7O95352 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATG7O95352 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATG7O95352 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATG7O95352 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATG7O95352 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATG7O95352 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATG7O95352 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATG7O95352 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATG7O95352 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATG7O95352 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATG7O95352 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATG7O95352 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATG7O95352 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATG7O95352 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATG7O95352 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATG7O95352 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATG7O95352 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATG7O95352 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATG7O95352 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATG7O95352 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATG7O95352 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATG7O95352 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ATG7O95352 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATG7O95352 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATG7O95352 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATG7O95352 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATG7O95352 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATG7O95352 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ATG7O95352 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATG7O95352 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATG7O95352 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATG7O95352 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATG7O95352 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATG7O95352 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATG7O95352 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ATG7O95352 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATG7O95352 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ATG7O95352 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATG7O95352 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATG7O95352 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATG7O95352 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATG7O95352 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATG7O95352 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATG7O95352 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATG7O95352 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATG7O95352 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATG7O95352 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATG7O95352 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATG7O95352 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATG7O95352 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATG7O95352 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATG7O95352 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ATG7O95352 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATG7O95352 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms