Protein–RNA interactions for Protein: O75379

VAMP4, Vesicle-associated membrane protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP4O75379 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
VAMP4O75379 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
VAMP4O75379 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
VAMP4O75379 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
VAMP4O75379 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
VAMP4O75379 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
VAMP4O75379 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
VAMP4O75379 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
VAMP4O75379 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
VAMP4O75379 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
VAMP4O75379 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
VAMP4O75379 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
VAMP4O75379 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
VAMP4O75379 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
VAMP4O75379 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
VAMP4O75379 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
VAMP4O75379 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
VAMP4O75379 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
VAMP4O75379 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
VAMP4O75379 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
VAMP4O75379 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
VAMP4O75379 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
VAMP4O75379 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
VAMP4O75379 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
VAMP4O75379 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
VAMP4O75379 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
VAMP4O75379 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
VAMP4O75379 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
VAMP4O75379 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
VAMP4O75379 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
VAMP4O75379 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
VAMP4O75379 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
VAMP4O75379 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
VAMP4O75379 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
VAMP4O75379 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
VAMP4O75379 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
VAMP4O75379 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
VAMP4O75379 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
VAMP4O75379 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
VAMP4O75379 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
VAMP4O75379 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
VAMP4O75379 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
VAMP4O75379 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
VAMP4O75379 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
VAMP4O75379 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
VAMP4O75379 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
VAMP4O75379 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
VAMP4O75379 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
VAMP4O75379 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
VAMP4O75379 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
VAMP4O75379 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
VAMP4O75379 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
VAMP4O75379 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
VAMP4O75379 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
VAMP4O75379 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
VAMP4O75379 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
VAMP4O75379 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
VAMP4O75379 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
VAMP4O75379 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
VAMP4O75379 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
VAMP4O75379 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
VAMP4O75379 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
VAMP4O75379 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
VAMP4O75379 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
VAMP4O75379 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
VAMP4O75379 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
VAMP4O75379 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
VAMP4O75379 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
VAMP4O75379 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
VAMP4O75379 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
VAMP4O75379 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
VAMP4O75379 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
VAMP4O75379 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
VAMP4O75379 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
VAMP4O75379 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
VAMP4O75379 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
VAMP4O75379 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
VAMP4O75379 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
VAMP4O75379 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
VAMP4O75379 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
VAMP4O75379 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
VAMP4O75379 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
VAMP4O75379 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
VAMP4O75379 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
VAMP4O75379 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
VAMP4O75379 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
VAMP4O75379 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
VAMP4O75379 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
VAMP4O75379 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
VAMP4O75379 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
VAMP4O75379 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
VAMP4O75379 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
VAMP4O75379 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
VAMP4O75379 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
VAMP4O75379 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
VAMP4O75379 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
VAMP4O75379 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
VAMP4O75379 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
VAMP4O75379 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
VAMP4O75379 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms