Protein–RNA interactions for Protein: O75335

PPFIA4, Liprin-alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA4O75335 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PPFIA4O75335 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PPFIA4O75335 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PPFIA4O75335 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PPFIA4O75335 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PPFIA4O75335 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PPFIA4O75335 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PPFIA4O75335 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PPFIA4O75335 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PPFIA4O75335 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PPFIA4O75335 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PPFIA4O75335 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PPFIA4O75335 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PPFIA4O75335 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PPFIA4O75335 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PPFIA4O75335 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PPFIA4O75335 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PPFIA4O75335 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PPFIA4O75335 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PPFIA4O75335 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PPFIA4O75335 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PPFIA4O75335 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PPFIA4O75335 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PPFIA4O75335 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PPFIA4O75335 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PPFIA4O75335 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PPFIA4O75335 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PPFIA4O75335 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PPFIA4O75335 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PPFIA4O75335 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PPFIA4O75335 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PPFIA4O75335 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PPFIA4O75335 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PPFIA4O75335 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PPFIA4O75335 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PPFIA4O75335 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PPFIA4O75335 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
PPFIA4O75335 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
PPFIA4O75335 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PPFIA4O75335 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PPFIA4O75335 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PPFIA4O75335 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PPFIA4O75335 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PPFIA4O75335 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
PPFIA4O75335 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PPFIA4O75335 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PPFIA4O75335 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PPFIA4O75335 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PPFIA4O75335 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PPFIA4O75335 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PPFIA4O75335 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PPFIA4O75335 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PPFIA4O75335 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PPFIA4O75335 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PPFIA4O75335 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PPFIA4O75335 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PPFIA4O75335 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PPFIA4O75335 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PPFIA4O75335 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PPFIA4O75335 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PPFIA4O75335 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PPFIA4O75335 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PPFIA4O75335 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PPFIA4O75335 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PPFIA4O75335 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PPFIA4O75335 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PPFIA4O75335 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PPFIA4O75335 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PPFIA4O75335 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PPFIA4O75335 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
PPFIA4O75335 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PPFIA4O75335 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PPFIA4O75335 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PPFIA4O75335 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PPFIA4O75335 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PPFIA4O75335 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PPFIA4O75335 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PPFIA4O75335 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PPFIA4O75335 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PPFIA4O75335 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PPFIA4O75335 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PPFIA4O75335 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PPFIA4O75335 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PPFIA4O75335 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
PPFIA4O75335 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PPFIA4O75335 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PPFIA4O75335 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PPFIA4O75335 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PPFIA4O75335 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PPFIA4O75335 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PPFIA4O75335 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
PPFIA4O75335 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
PPFIA4O75335 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PPFIA4O75335 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PPFIA4O75335 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PPFIA4O75335 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PPFIA4O75335 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PPFIA4O75335 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PPFIA4O75335 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PPFIA4O75335 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms