Protein–RNA interactions for Protein: O60931

CTNS, Cystinosin, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNSO60931 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTNSO60931 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTNSO60931 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTNSO60931 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTNSO60931 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTNSO60931 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTNSO60931 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTNSO60931 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTNSO60931 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CTNSO60931 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTNSO60931 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CTNSO60931 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTNSO60931 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CTNSO60931 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTNSO60931 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTNSO60931 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTNSO60931 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTNSO60931 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTNSO60931 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTNSO60931 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTNSO60931 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTNSO60931 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTNSO60931 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTNSO60931 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTNSO60931 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTNSO60931 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTNSO60931 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTNSO60931 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTNSO60931 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTNSO60931 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTNSO60931 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTNSO60931 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTNSO60931 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTNSO60931 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTNSO60931 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTNSO60931 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CTNSO60931 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTNSO60931 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTNSO60931 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTNSO60931 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CTNSO60931 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTNSO60931 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTNSO60931 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CTNSO60931 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CTNSO60931 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTNSO60931 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTNSO60931 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTNSO60931 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CTNSO60931 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTNSO60931 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTNSO60931 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTNSO60931 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTNSO60931 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTNSO60931 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTNSO60931 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTNSO60931 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTNSO60931 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CTNSO60931 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTNSO60931 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTNSO60931 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTNSO60931 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTNSO60931 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTNSO60931 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CTNSO60931 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTNSO60931 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTNSO60931 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CTNSO60931 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTNSO60931 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTNSO60931 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CTNSO60931 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTNSO60931 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTNSO60931 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTNSO60931 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTNSO60931 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTNSO60931 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTNSO60931 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTNSO60931 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CTNSO60931 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CTNSO60931 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CTNSO60931 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CTNSO60931 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
CTNSO60931 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CTNSO60931 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CTNSO60931 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CTNSO60931 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CTNSO60931 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CTNSO60931 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CTNSO60931 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTNSO60931 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTNSO60931 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CTNSO60931 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTNSO60931 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTNSO60931 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTNSO60931 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTNSO60931 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTNSO60931 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTNSO60931 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTNSO60931 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CTNSO60931 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CTNSO60931 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms