Protein–RNA interactions for Protein: O60706

ABCC9, ATP-binding cassette sub-family C member 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC9O60706 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.48■■■■□ 3.75
ABCC9O60706 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC38.48■■■■□ 3.75
ABCC9O60706 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
ABCC9O60706 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
ABCC9O60706 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
ABCC9O60706 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
ABCC9O60706 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
ABCC9O60706 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC38.47■■■■□ 3.75
ABCC9O60706 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
ABCC9O60706 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC38.47■■■■□ 3.75
ABCC9O60706 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC38.47■■■■□ 3.75
ABCC9O60706 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC38.47■■■■□ 3.75
ABCC9O60706 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
ABCC9O60706 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC38.47■■■■□ 3.75
ABCC9O60706 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC38.47■■■■□ 3.75
ABCC9O60706 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.47■■■■□ 3.75
ABCC9O60706 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC38.47■■■■□ 3.75
ABCC9O60706 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC38.47■■■■□ 3.75
ABCC9O60706 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC38.47■■■■□ 3.75
ABCC9O60706 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
ABCC9O60706 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC38.47■■■■□ 3.75
ABCC9O60706 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
ABCC9O60706 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC38.47■■■■□ 3.75
ABCC9O60706 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
ABCC9O60706 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
ABCC9O60706 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
ABCC9O60706 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC38.46■■■■□ 3.75
ABCC9O60706 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC38.46■■■■□ 3.75
ABCC9O60706 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC38.46■■■■□ 3.75
ABCC9O60706 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC38.45■■■■□ 3.75
ABCC9O60706 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
ABCC9O60706 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC38.45■■■■□ 3.75
ABCC9O60706 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC38.45■■■■□ 3.75
ABCC9O60706 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC38.45■■■■□ 3.75
ABCC9O60706 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC38.45■■■■□ 3.75
ABCC9O60706 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC38.45■■■■□ 3.75
ABCC9O60706 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.45■■■■□ 3.75
ABCC9O60706 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC38.45■■■■□ 3.75
ABCC9O60706 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC38.45■■■■□ 3.75
ABCC9O60706 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
ABCC9O60706 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
ABCC9O60706 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.74
ABCC9O60706 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.74
ABCC9O60706 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
ABCC9O60706 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC38.44■■■■□ 3.74
ABCC9O60706 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC38.44■■■■□ 3.74
ABCC9O60706 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.44■■■■□ 3.74
ABCC9O60706 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.44■■■■□ 3.74
ABCC9O60706 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC38.44■■■■□ 3.74
ABCC9O60706 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
ABCC9O60706 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC38.43■■■■□ 3.74
ABCC9O60706 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
ABCC9O60706 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
ABCC9O60706 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC38.43■■■■□ 3.74
ABCC9O60706 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC38.42■■■■□ 3.74
ABCC9O60706 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
ABCC9O60706 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
ABCC9O60706 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
ABCC9O60706 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
ABCC9O60706 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
ABCC9O60706 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC38.42■■■■□ 3.74
ABCC9O60706 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
ABCC9O60706 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
ABCC9O60706 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
ABCC9O60706 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC38.41■■■■□ 3.74
ABCC9O60706 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
ABCC9O60706 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
ABCC9O60706 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
ABCC9O60706 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.41■■■■□ 3.74
ABCC9O60706 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
ABCC9O60706 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC38.41■■■■□ 3.74
ABCC9O60706 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC38.41■■■■□ 3.74
ABCC9O60706 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC38.41■■■■□ 3.74
ABCC9O60706 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
ABCC9O60706 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC38.41■■■■□ 3.74
ABCC9O60706 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.41■■■■□ 3.74
ABCC9O60706 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
ABCC9O60706 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC38.41■■■■□ 3.74
ABCC9O60706 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
ABCC9O60706 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC38.4■■■■□ 3.74
ABCC9O60706 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
ABCC9O60706 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC38.4■■■■□ 3.74
ABCC9O60706 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC38.4■■■■□ 3.74
ABCC9O60706 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC38.4■■■■□ 3.74
ABCC9O60706 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC38.4■■■■□ 3.74
ABCC9O60706 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC38.4■■■■□ 3.74
ABCC9O60706 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
ABCC9O60706 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
ABCC9O60706 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC38.39■■■■□ 3.74
ABCC9O60706 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC38.39■■■■□ 3.74
ABCC9O60706 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.39■■■■□ 3.74
ABCC9O60706 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
ABCC9O60706 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
ABCC9O60706 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.39■■■■□ 3.74
ABCC9O60706 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
ABCC9O60706 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC38.38■■■■□ 3.74
ABCC9O60706 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.74
ABCC9O60706 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC38.38■■■■□ 3.74
ABCC9O60706 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC38.38■■■■□ 3.74
ABCC9O60706 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC38.38■■■■□ 3.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms