Protein–RNA interactions for Protein: O15360

FANCA, Fanconi anemia group A protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCAO15360 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
FANCAO15360 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
FANCAO15360 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
FANCAO15360 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
FANCAO15360 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
FANCAO15360 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
FANCAO15360 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
FANCAO15360 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
FANCAO15360 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
FANCAO15360 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
FANCAO15360 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
FANCAO15360 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
FANCAO15360 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
FANCAO15360 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
FANCAO15360 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
FANCAO15360 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
FANCAO15360 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
FANCAO15360 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
FANCAO15360 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
FANCAO15360 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
FANCAO15360 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
FANCAO15360 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
FANCAO15360 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
FANCAO15360 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
FANCAO15360 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
FANCAO15360 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
FANCAO15360 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
FANCAO15360 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
FANCAO15360 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
FANCAO15360 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
FANCAO15360 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
FANCAO15360 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
FANCAO15360 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
FANCAO15360 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.27
FANCAO15360 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
FANCAO15360 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
FANCAO15360 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
FANCAO15360 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
FANCAO15360 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
FANCAO15360 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
FANCAO15360 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
FANCAO15360 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
FANCAO15360 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
FANCAO15360 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
FANCAO15360 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
FANCAO15360 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
FANCAO15360 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
FANCAO15360 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
FANCAO15360 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
FANCAO15360 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
FANCAO15360 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
FANCAO15360 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
FANCAO15360 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC29.19■■■□□ 2.26
FANCAO15360 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
FANCAO15360 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
FANCAO15360 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC29.19■■■□□ 2.26
FANCAO15360 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
FANCAO15360 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
FANCAO15360 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
FANCAO15360 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
FANCAO15360 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC29.19■■■□□ 2.26
FANCAO15360 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
FANCAO15360 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
FANCAO15360 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
FANCAO15360 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
FANCAO15360 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
FANCAO15360 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
FANCAO15360 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
FANCAO15360 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
FANCAO15360 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
FANCAO15360 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
FANCAO15360 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
FANCAO15360 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
FANCAO15360 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
FANCAO15360 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
FANCAO15360 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
FANCAO15360 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
FANCAO15360 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
FANCAO15360 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
FANCAO15360 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
FANCAO15360 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
FANCAO15360 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
FANCAO15360 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
FANCAO15360 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
FANCAO15360 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
FANCAO15360 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
FANCAO15360 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
FANCAO15360 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.17■■■□□ 2.26
FANCAO15360 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
FANCAO15360 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
FANCAO15360 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
FANCAO15360 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
FANCAO15360 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
FANCAO15360 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
FANCAO15360 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
FANCAO15360 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
FANCAO15360 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.17■■■□□ 2.26
FANCAO15360 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
FANCAO15360 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
FANCAO15360 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms