Protein–RNA interactions for Protein: O15228

GNPAT, Dihydroxyacetone phosphate acyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 680 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPATO15228 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GNPATO15228 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GNPATO15228 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GNPATO15228 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GNPATO15228 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
GNPATO15228 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GNPATO15228 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GNPATO15228 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GNPATO15228 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GNPATO15228 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GNPATO15228 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GNPATO15228 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GNPATO15228 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GNPATO15228 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GNPATO15228 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GNPATO15228 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GNPATO15228 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GNPATO15228 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GNPATO15228 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GNPATO15228 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GNPATO15228 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GNPATO15228 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GNPATO15228 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GNPATO15228 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GNPATO15228 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GNPATO15228 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GNPATO15228 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GNPATO15228 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GNPATO15228 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GNPATO15228 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
GNPATO15228 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
GNPATO15228 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GNPATO15228 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GNPATO15228 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GNPATO15228 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GNPATO15228 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GNPATO15228 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GNPATO15228 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GNPATO15228 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
GNPATO15228 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GNPATO15228 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GNPATO15228 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GNPATO15228 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GNPATO15228 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GNPATO15228 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GNPATO15228 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GNPATO15228 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GNPATO15228 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GNPATO15228 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GNPATO15228 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GNPATO15228 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
GNPATO15228 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GNPATO15228 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GNPATO15228 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
GNPATO15228 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GNPATO15228 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GNPATO15228 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GNPATO15228 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GNPATO15228 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GNPATO15228 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GNPATO15228 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GNPATO15228 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GNPATO15228 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GNPATO15228 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
GNPATO15228 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GNPATO15228 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GNPATO15228 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GNPATO15228 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GNPATO15228 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GNPATO15228 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GNPATO15228 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GNPATO15228 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GNPATO15228 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GNPATO15228 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GNPATO15228 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GNPATO15228 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GNPATO15228 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GNPATO15228 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GNPATO15228 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GNPATO15228 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GNPATO15228 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GNPATO15228 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GNPATO15228 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GNPATO15228 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
GNPATO15228 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
GNPATO15228 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
GNPATO15228 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
GNPATO15228 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GNPATO15228 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
GNPATO15228 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GNPATO15228 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GNPATO15228 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GNPATO15228 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GNPATO15228 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GNPATO15228 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GNPATO15228 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GNPATO15228 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GNPATO15228 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GNPATO15228 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GNPATO15228 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms