Protein–RNA interactions for Protein: O15061

SYNM, Synemin, humanhuman

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNMO15061 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SYNMO15061 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SYNMO15061 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SYNMO15061 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SYNMO15061 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SYNMO15061 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SYNMO15061 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
SYNMO15061 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SYNMO15061 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SYNMO15061 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
SYNMO15061 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SYNMO15061 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SYNMO15061 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SYNMO15061 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SYNMO15061 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SYNMO15061 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SYNMO15061 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SYNMO15061 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SYNMO15061 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SYNMO15061 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SYNMO15061 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SYNMO15061 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
SYNMO15061 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SYNMO15061 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SYNMO15061 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
SYNMO15061 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
SYNMO15061 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
SYNMO15061 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
SYNMO15061 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
SYNMO15061 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
SYNMO15061 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
SYNMO15061 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SYNMO15061 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SYNMO15061 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SYNMO15061 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SYNMO15061 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SYNMO15061 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SYNMO15061 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SYNMO15061 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SYNMO15061 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SYNMO15061 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SYNMO15061 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
SYNMO15061 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SYNMO15061 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SYNMO15061 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SYNMO15061 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SYNMO15061 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SYNMO15061 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SYNMO15061 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SYNMO15061 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SYNMO15061 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SYNMO15061 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SYNMO15061 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SYNMO15061 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SYNMO15061 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
SYNMO15061 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SYNMO15061 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SYNMO15061 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SYNMO15061 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SYNMO15061 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SYNMO15061 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SYNMO15061 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SYNMO15061 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SYNMO15061 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SYNMO15061 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SYNMO15061 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
SYNMO15061 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SYNMO15061 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
SYNMO15061 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SYNMO15061 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SYNMO15061 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SYNMO15061 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SYNMO15061 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SYNMO15061 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SYNMO15061 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SYNMO15061 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SYNMO15061 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SYNMO15061 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SYNMO15061 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SYNMO15061 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
SYNMO15061 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SYNMO15061 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SYNMO15061 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
SYNMO15061 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SYNMO15061 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SYNMO15061 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SYNMO15061 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SYNMO15061 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SYNMO15061 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SYNMO15061 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SYNMO15061 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SYNMO15061 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SYNMO15061 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SYNMO15061 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SYNMO15061 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SYNMO15061 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SYNMO15061 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SYNMO15061 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SYNMO15061 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SYNMO15061 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms