Protein–RNA interactions for Protein: O00559

EBAG9, Receptor-binding cancer antigen expressed on SiSo cells, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBAG9O00559 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
EBAG9O00559 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
EBAG9O00559 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
EBAG9O00559 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
EBAG9O00559 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
EBAG9O00559 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
EBAG9O00559 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
EBAG9O00559 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
EBAG9O00559 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
EBAG9O00559 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
EBAG9O00559 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
EBAG9O00559 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
EBAG9O00559 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
EBAG9O00559 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
EBAG9O00559 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
EBAG9O00559 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
EBAG9O00559 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
EBAG9O00559 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
EBAG9O00559 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
EBAG9O00559 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
EBAG9O00559 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
EBAG9O00559 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
EBAG9O00559 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
EBAG9O00559 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
EBAG9O00559 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
EBAG9O00559 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
EBAG9O00559 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
EBAG9O00559 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
EBAG9O00559 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
EBAG9O00559 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
EBAG9O00559 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
EBAG9O00559 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
EBAG9O00559 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
EBAG9O00559 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
EBAG9O00559 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
EBAG9O00559 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
EBAG9O00559 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
EBAG9O00559 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
EBAG9O00559 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
EBAG9O00559 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
EBAG9O00559 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
EBAG9O00559 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
EBAG9O00559 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
EBAG9O00559 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
EBAG9O00559 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
EBAG9O00559 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
EBAG9O00559 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
EBAG9O00559 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
EBAG9O00559 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
EBAG9O00559 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
EBAG9O00559 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
EBAG9O00559 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
EBAG9O00559 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
EBAG9O00559 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
EBAG9O00559 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
EBAG9O00559 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
EBAG9O00559 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
EBAG9O00559 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
EBAG9O00559 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
EBAG9O00559 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
EBAG9O00559 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
EBAG9O00559 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
EBAG9O00559 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
EBAG9O00559 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
EBAG9O00559 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
EBAG9O00559 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
EBAG9O00559 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
EBAG9O00559 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
EBAG9O00559 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
EBAG9O00559 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
EBAG9O00559 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
EBAG9O00559 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
EBAG9O00559 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
EBAG9O00559 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
EBAG9O00559 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
EBAG9O00559 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
EBAG9O00559 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
EBAG9O00559 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
EBAG9O00559 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
EBAG9O00559 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
EBAG9O00559 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
EBAG9O00559 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
EBAG9O00559 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
EBAG9O00559 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
EBAG9O00559 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
EBAG9O00559 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
EBAG9O00559 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
EBAG9O00559 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
EBAG9O00559 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
EBAG9O00559 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
EBAG9O00559 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
EBAG9O00559 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
EBAG9O00559 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
EBAG9O00559 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
EBAG9O00559 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
EBAG9O00559 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
EBAG9O00559 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
EBAG9O00559 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
EBAG9O00559 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
EBAG9O00559 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms