Protein–RNA interactions for Protein: O00411

POLRMT, DNA-directed RNA polymerase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLRMTO00411 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
POLRMTO00411 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
POLRMTO00411 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
POLRMTO00411 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
POLRMTO00411 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
POLRMTO00411 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
POLRMTO00411 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
POLRMTO00411 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
POLRMTO00411 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
POLRMTO00411 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
POLRMTO00411 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
POLRMTO00411 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
POLRMTO00411 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
POLRMTO00411 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
POLRMTO00411 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
POLRMTO00411 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
POLRMTO00411 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
POLRMTO00411 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
POLRMTO00411 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
POLRMTO00411 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
POLRMTO00411 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
POLRMTO00411 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
POLRMTO00411 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
POLRMTO00411 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
POLRMTO00411 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
POLRMTO00411 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
POLRMTO00411 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
POLRMTO00411 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
POLRMTO00411 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
POLRMTO00411 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
POLRMTO00411 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
POLRMTO00411 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
POLRMTO00411 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
POLRMTO00411 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
POLRMTO00411 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
POLRMTO00411 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
POLRMTO00411 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
POLRMTO00411 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
POLRMTO00411 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
POLRMTO00411 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
POLRMTO00411 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
POLRMTO00411 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
POLRMTO00411 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
POLRMTO00411 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
POLRMTO00411 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
POLRMTO00411 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
POLRMTO00411 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
POLRMTO00411 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
POLRMTO00411 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
POLRMTO00411 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
POLRMTO00411 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
POLRMTO00411 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
POLRMTO00411 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
POLRMTO00411 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
POLRMTO00411 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
POLRMTO00411 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
POLRMTO00411 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
POLRMTO00411 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
POLRMTO00411 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
POLRMTO00411 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
POLRMTO00411 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
POLRMTO00411 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
POLRMTO00411 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
POLRMTO00411 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
POLRMTO00411 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
POLRMTO00411 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
POLRMTO00411 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
POLRMTO00411 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
POLRMTO00411 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
POLRMTO00411 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
POLRMTO00411 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
POLRMTO00411 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
POLRMTO00411 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
POLRMTO00411 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
POLRMTO00411 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
POLRMTO00411 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
POLRMTO00411 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
POLRMTO00411 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
POLRMTO00411 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
POLRMTO00411 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
POLRMTO00411 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
POLRMTO00411 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
POLRMTO00411 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
POLRMTO00411 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
POLRMTO00411 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
POLRMTO00411 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
POLRMTO00411 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
POLRMTO00411 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
POLRMTO00411 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
POLRMTO00411 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
POLRMTO00411 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
POLRMTO00411 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
POLRMTO00411 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
POLRMTO00411 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
POLRMTO00411 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
POLRMTO00411 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
POLRMTO00411 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
POLRMTO00411 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
POLRMTO00411 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
POLRMTO00411 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms