Protein–RNA interactions for Protein: A6NKD9

CCDC85C, Coiled-coil domain-containing protein 85C, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85CA6NKD9 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC85CA6NKD9 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC85CA6NKD9 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC85CA6NKD9 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC85CA6NKD9 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC85CA6NKD9 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC85CA6NKD9 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC85CA6NKD9 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC85CA6NKD9 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC85CA6NKD9 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC85CA6NKD9 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC85CA6NKD9 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC85CA6NKD9 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC85CA6NKD9 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC85CA6NKD9 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC85CA6NKD9 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC85CA6NKD9 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC85CA6NKD9 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC85CA6NKD9 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC85CA6NKD9 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC85CA6NKD9 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC85CA6NKD9 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC85CA6NKD9 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC85CA6NKD9 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC85CA6NKD9 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC85CA6NKD9 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC85CA6NKD9 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC85CA6NKD9 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC85CA6NKD9 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC85CA6NKD9 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC85CA6NKD9 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC85CA6NKD9 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC85CA6NKD9 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC85CA6NKD9 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC85CA6NKD9 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC85CA6NKD9 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC85CA6NKD9 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC85CA6NKD9 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC85CA6NKD9 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC85CA6NKD9 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC85CA6NKD9 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC85CA6NKD9 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC85CA6NKD9 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC85CA6NKD9 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC85CA6NKD9 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC85CA6NKD9 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC85CA6NKD9 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC85CA6NKD9 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC85CA6NKD9 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC85CA6NKD9 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC85CA6NKD9 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC85CA6NKD9 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC85CA6NKD9 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC85CA6NKD9 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC85CA6NKD9 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC85CA6NKD9 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC85CA6NKD9 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC85CA6NKD9 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC85CA6NKD9 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC85CA6NKD9 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC85CA6NKD9 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC85CA6NKD9 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC85CA6NKD9 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC85CA6NKD9 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC85CA6NKD9 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC85CA6NKD9 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC85CA6NKD9 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC85CA6NKD9 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC85CA6NKD9 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC85CA6NKD9 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC85CA6NKD9 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC85CA6NKD9 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC85CA6NKD9 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC85CA6NKD9 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC85CA6NKD9 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC85CA6NKD9 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC85CA6NKD9 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC85CA6NKD9 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC85CA6NKD9 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC85CA6NKD9 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC85CA6NKD9 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC85CA6NKD9 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC85CA6NKD9 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC85CA6NKD9 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC85CA6NKD9 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC85CA6NKD9 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC85CA6NKD9 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC85CA6NKD9 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC85CA6NKD9 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC85CA6NKD9 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC85CA6NKD9 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC85CA6NKD9 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC85CA6NKD9 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC85CA6NKD9 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC85CA6NKD9 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC85CA6NKD9 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC85CA6NKD9 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC85CA6NKD9 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC85CA6NKD9 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC85CA6NKD9 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms