Protein–RNA interactions for Protein: A6NDR6

MEIS3P1, Putative homeobox protein Meis3-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3P1A6NDR6 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MEIS3P1A6NDR6 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MEIS3P1A6NDR6 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MEIS3P1A6NDR6 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MEIS3P1A6NDR6 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
MEIS3P1A6NDR6 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MEIS3P1A6NDR6 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MEIS3P1A6NDR6 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MEIS3P1A6NDR6 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MEIS3P1A6NDR6 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MEIS3P1A6NDR6 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MEIS3P1A6NDR6 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MEIS3P1A6NDR6 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MEIS3P1A6NDR6 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MEIS3P1A6NDR6 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MEIS3P1A6NDR6 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MEIS3P1A6NDR6 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MEIS3P1A6NDR6 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MEIS3P1A6NDR6 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MEIS3P1A6NDR6 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MEIS3P1A6NDR6 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MEIS3P1A6NDR6 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MEIS3P1A6NDR6 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MEIS3P1A6NDR6 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MEIS3P1A6NDR6 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MEIS3P1A6NDR6 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MEIS3P1A6NDR6 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MEIS3P1A6NDR6 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MEIS3P1A6NDR6 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MEIS3P1A6NDR6 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MEIS3P1A6NDR6 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MEIS3P1A6NDR6 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MEIS3P1A6NDR6 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MEIS3P1A6NDR6 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MEIS3P1A6NDR6 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MEIS3P1A6NDR6 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MEIS3P1A6NDR6 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MEIS3P1A6NDR6 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MEIS3P1A6NDR6 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MEIS3P1A6NDR6 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MEIS3P1A6NDR6 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MEIS3P1A6NDR6 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MEIS3P1A6NDR6 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MEIS3P1A6NDR6 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MEIS3P1A6NDR6 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MEIS3P1A6NDR6 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MEIS3P1A6NDR6 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MEIS3P1A6NDR6 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MEIS3P1A6NDR6 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MEIS3P1A6NDR6 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MEIS3P1A6NDR6 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MEIS3P1A6NDR6 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MEIS3P1A6NDR6 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MEIS3P1A6NDR6 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MEIS3P1A6NDR6 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MEIS3P1A6NDR6 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MEIS3P1A6NDR6 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MEIS3P1A6NDR6 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MEIS3P1A6NDR6 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MEIS3P1A6NDR6 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MEIS3P1A6NDR6 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MEIS3P1A6NDR6 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MEIS3P1A6NDR6 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MEIS3P1A6NDR6 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MEIS3P1A6NDR6 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MEIS3P1A6NDR6 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MEIS3P1A6NDR6 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MEIS3P1A6NDR6 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MEIS3P1A6NDR6 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
MEIS3P1A6NDR6 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MEIS3P1A6NDR6 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MEIS3P1A6NDR6 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MEIS3P1A6NDR6 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MEIS3P1A6NDR6 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MEIS3P1A6NDR6 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MEIS3P1A6NDR6 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MEIS3P1A6NDR6 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MEIS3P1A6NDR6 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MEIS3P1A6NDR6 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MEIS3P1A6NDR6 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
MEIS3P1A6NDR6 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
MEIS3P1A6NDR6 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MEIS3P1A6NDR6 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
MEIS3P1A6NDR6 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
MEIS3P1A6NDR6 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MEIS3P1A6NDR6 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MEIS3P1A6NDR6 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MEIS3P1A6NDR6 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MEIS3P1A6NDR6 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MEIS3P1A6NDR6 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MEIS3P1A6NDR6 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MEIS3P1A6NDR6 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MEIS3P1A6NDR6 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MEIS3P1A6NDR6 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MEIS3P1A6NDR6 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MEIS3P1A6NDR6 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MEIS3P1A6NDR6 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MEIS3P1A6NDR6 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MEIS3P1A6NDR6 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MEIS3P1A6NDR6 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms