Protein–RNA interactions for Protein: A6NCW7

USP17L4, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L4A6NCW7 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP17L4A6NCW7 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP17L4A6NCW7 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP17L4A6NCW7 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP17L4A6NCW7 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP17L4A6NCW7 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP17L4A6NCW7 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP17L4A6NCW7 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP17L4A6NCW7 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP17L4A6NCW7 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP17L4A6NCW7 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP17L4A6NCW7 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP17L4A6NCW7 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP17L4A6NCW7 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP17L4A6NCW7 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP17L4A6NCW7 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
USP17L4A6NCW7 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP17L4A6NCW7 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP17L4A6NCW7 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP17L4A6NCW7 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP17L4A6NCW7 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP17L4A6NCW7 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP17L4A6NCW7 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP17L4A6NCW7 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP17L4A6NCW7 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP17L4A6NCW7 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP17L4A6NCW7 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP17L4A6NCW7 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP17L4A6NCW7 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP17L4A6NCW7 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP17L4A6NCW7 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP17L4A6NCW7 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP17L4A6NCW7 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP17L4A6NCW7 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP17L4A6NCW7 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP17L4A6NCW7 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP17L4A6NCW7 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP17L4A6NCW7 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP17L4A6NCW7 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP17L4A6NCW7 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP17L4A6NCW7 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP17L4A6NCW7 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP17L4A6NCW7 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
USP17L4A6NCW7 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP17L4A6NCW7 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP17L4A6NCW7 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP17L4A6NCW7 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP17L4A6NCW7 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
USP17L4A6NCW7 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP17L4A6NCW7 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP17L4A6NCW7 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP17L4A6NCW7 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
USP17L4A6NCW7 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
USP17L4A6NCW7 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP17L4A6NCW7 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP17L4A6NCW7 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP17L4A6NCW7 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP17L4A6NCW7 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP17L4A6NCW7 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
USP17L4A6NCW7 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP17L4A6NCW7 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP17L4A6NCW7 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP17L4A6NCW7 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP17L4A6NCW7 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP17L4A6NCW7 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP17L4A6NCW7 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP17L4A6NCW7 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
USP17L4A6NCW7 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP17L4A6NCW7 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP17L4A6NCW7 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP17L4A6NCW7 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP17L4A6NCW7 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP17L4A6NCW7 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP17L4A6NCW7 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP17L4A6NCW7 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP17L4A6NCW7 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP17L4A6NCW7 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP17L4A6NCW7 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
USP17L4A6NCW7 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP17L4A6NCW7 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
USP17L4A6NCW7 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP17L4A6NCW7 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
USP17L4A6NCW7 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP17L4A6NCW7 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP17L4A6NCW7 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP17L4A6NCW7 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
USP17L4A6NCW7 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP17L4A6NCW7 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP17L4A6NCW7 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP17L4A6NCW7 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP17L4A6NCW7 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP17L4A6NCW7 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP17L4A6NCW7 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP17L4A6NCW7 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP17L4A6NCW7 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP17L4A6NCW7 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP17L4A6NCW7 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
USP17L4A6NCW7 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP17L4A6NCW7 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP17L4A6NCW7 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms