Protein–RNA interactions for Protein: A5PKW4

PSD, PH and SEC7 domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSDA5PKW4 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PSDA5PKW4 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PSDA5PKW4 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PSDA5PKW4 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PSDA5PKW4 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PSDA5PKW4 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PSDA5PKW4 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PSDA5PKW4 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PSDA5PKW4 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PSDA5PKW4 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PSDA5PKW4 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PSDA5PKW4 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PSDA5PKW4 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PSDA5PKW4 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PSDA5PKW4 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PSDA5PKW4 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PSDA5PKW4 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PSDA5PKW4 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PSDA5PKW4 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PSDA5PKW4 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
PSDA5PKW4 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PSDA5PKW4 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PSDA5PKW4 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PSDA5PKW4 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PSDA5PKW4 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
PSDA5PKW4 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PSDA5PKW4 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PSDA5PKW4 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PSDA5PKW4 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
PSDA5PKW4 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PSDA5PKW4 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PSDA5PKW4 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PSDA5PKW4 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PSDA5PKW4 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PSDA5PKW4 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PSDA5PKW4 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PSDA5PKW4 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PSDA5PKW4 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PSDA5PKW4 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PSDA5PKW4 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PSDA5PKW4 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PSDA5PKW4 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PSDA5PKW4 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PSDA5PKW4 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PSDA5PKW4 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PSDA5PKW4 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PSDA5PKW4 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PSDA5PKW4 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PSDA5PKW4 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PSDA5PKW4 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PSDA5PKW4 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PSDA5PKW4 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PSDA5PKW4 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PSDA5PKW4 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PSDA5PKW4 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
PSDA5PKW4 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PSDA5PKW4 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PSDA5PKW4 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PSDA5PKW4 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PSDA5PKW4 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PSDA5PKW4 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PSDA5PKW4 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PSDA5PKW4 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PSDA5PKW4 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PSDA5PKW4 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PSDA5PKW4 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PSDA5PKW4 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PSDA5PKW4 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PSDA5PKW4 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PSDA5PKW4 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
PSDA5PKW4 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PSDA5PKW4 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
PSDA5PKW4 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
PSDA5PKW4 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
PSDA5PKW4 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PSDA5PKW4 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
PSDA5PKW4 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PSDA5PKW4 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PSDA5PKW4 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PSDA5PKW4 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PSDA5PKW4 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PSDA5PKW4 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PSDA5PKW4 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
PSDA5PKW4 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PSDA5PKW4 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PSDA5PKW4 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PSDA5PKW4 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PSDA5PKW4 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PSDA5PKW4 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PSDA5PKW4 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PSDA5PKW4 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PSDA5PKW4 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PSDA5PKW4 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
PSDA5PKW4 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PSDA5PKW4 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PSDA5PKW4 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PSDA5PKW4 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PSDA5PKW4 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
PSDA5PKW4 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PSDA5PKW4 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms