Protein–RNA interactions for Protein: A5A3E0

POTEF, POTE ankyrin domain family member F, humanhuman

Predictions only

Length 1,075 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POTEFA5A3E0 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
POTEFA5A3E0 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
POTEFA5A3E0 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
POTEFA5A3E0 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
POTEFA5A3E0 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
POTEFA5A3E0 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
POTEFA5A3E0 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
POTEFA5A3E0 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
POTEFA5A3E0 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
POTEFA5A3E0 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
POTEFA5A3E0 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
POTEFA5A3E0 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
POTEFA5A3E0 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
POTEFA5A3E0 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
POTEFA5A3E0 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
POTEFA5A3E0 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
POTEFA5A3E0 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
POTEFA5A3E0 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
POTEFA5A3E0 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
POTEFA5A3E0 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
POTEFA5A3E0 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
POTEFA5A3E0 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
POTEFA5A3E0 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
POTEFA5A3E0 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
POTEFA5A3E0 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
POTEFA5A3E0 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
POTEFA5A3E0 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
POTEFA5A3E0 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
POTEFA5A3E0 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
POTEFA5A3E0 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
POTEFA5A3E0 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
POTEFA5A3E0 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
POTEFA5A3E0 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
POTEFA5A3E0 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
POTEFA5A3E0 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
POTEFA5A3E0 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
POTEFA5A3E0 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
POTEFA5A3E0 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
POTEFA5A3E0 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
POTEFA5A3E0 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
POTEFA5A3E0 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
POTEFA5A3E0 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
POTEFA5A3E0 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
POTEFA5A3E0 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
POTEFA5A3E0 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
POTEFA5A3E0 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
POTEFA5A3E0 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
POTEFA5A3E0 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
POTEFA5A3E0 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
POTEFA5A3E0 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
POTEFA5A3E0 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
POTEFA5A3E0 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
POTEFA5A3E0 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
POTEFA5A3E0 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
POTEFA5A3E0 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
POTEFA5A3E0 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
POTEFA5A3E0 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
POTEFA5A3E0 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
POTEFA5A3E0 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
POTEFA5A3E0 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
POTEFA5A3E0 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
POTEFA5A3E0 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
POTEFA5A3E0 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
POTEFA5A3E0 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
POTEFA5A3E0 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
POTEFA5A3E0 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
POTEFA5A3E0 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
POTEFA5A3E0 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
POTEFA5A3E0 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
POTEFA5A3E0 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
POTEFA5A3E0 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
POTEFA5A3E0 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
POTEFA5A3E0 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
POTEFA5A3E0 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
POTEFA5A3E0 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
POTEFA5A3E0 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
POTEFA5A3E0 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
POTEFA5A3E0 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
POTEFA5A3E0 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
POTEFA5A3E0 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
POTEFA5A3E0 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
POTEFA5A3E0 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
POTEFA5A3E0 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
POTEFA5A3E0 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
POTEFA5A3E0 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
POTEFA5A3E0 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
POTEFA5A3E0 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
POTEFA5A3E0 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
POTEFA5A3E0 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
POTEFA5A3E0 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
POTEFA5A3E0 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
POTEFA5A3E0 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
POTEFA5A3E0 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
POTEFA5A3E0 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
POTEFA5A3E0 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
POTEFA5A3E0 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
POTEFA5A3E0 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
POTEFA5A3E0 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
POTEFA5A3E0 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
POTEFA5A3E0 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms