Protein–RNA interactions for Protein: A4UGR9

XIRP2, Xin actin-binding repeat-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 3,374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XIRP2A4UGR9 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
XIRP2A4UGR9 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
XIRP2A4UGR9 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
XIRP2A4UGR9 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
XIRP2A4UGR9 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
XIRP2A4UGR9 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
XIRP2A4UGR9 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
XIRP2A4UGR9 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
XIRP2A4UGR9 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
XIRP2A4UGR9 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
XIRP2A4UGR9 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
XIRP2A4UGR9 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
XIRP2A4UGR9 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
XIRP2A4UGR9 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
XIRP2A4UGR9 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
XIRP2A4UGR9 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
XIRP2A4UGR9 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
XIRP2A4UGR9 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
XIRP2A4UGR9 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
XIRP2A4UGR9 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
XIRP2A4UGR9 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
XIRP2A4UGR9 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
XIRP2A4UGR9 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
XIRP2A4UGR9 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
XIRP2A4UGR9 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
XIRP2A4UGR9 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
XIRP2A4UGR9 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
XIRP2A4UGR9 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
XIRP2A4UGR9 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
XIRP2A4UGR9 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
XIRP2A4UGR9 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
XIRP2A4UGR9 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
XIRP2A4UGR9 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
XIRP2A4UGR9 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
XIRP2A4UGR9 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
XIRP2A4UGR9 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
XIRP2A4UGR9 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
XIRP2A4UGR9 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
XIRP2A4UGR9 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
XIRP2A4UGR9 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
XIRP2A4UGR9 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
XIRP2A4UGR9 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
XIRP2A4UGR9 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
XIRP2A4UGR9 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
XIRP2A4UGR9 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
XIRP2A4UGR9 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
XIRP2A4UGR9 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
XIRP2A4UGR9 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
XIRP2A4UGR9 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
XIRP2A4UGR9 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
XIRP2A4UGR9 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
XIRP2A4UGR9 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
XIRP2A4UGR9 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
XIRP2A4UGR9 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
XIRP2A4UGR9 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
XIRP2A4UGR9 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
XIRP2A4UGR9 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
XIRP2A4UGR9 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
XIRP2A4UGR9 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
XIRP2A4UGR9 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
XIRP2A4UGR9 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
XIRP2A4UGR9 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
XIRP2A4UGR9 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
XIRP2A4UGR9 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
XIRP2A4UGR9 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
XIRP2A4UGR9 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
XIRP2A4UGR9 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
XIRP2A4UGR9 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
XIRP2A4UGR9 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
XIRP2A4UGR9 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
XIRP2A4UGR9 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
XIRP2A4UGR9 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
XIRP2A4UGR9 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
XIRP2A4UGR9 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
XIRP2A4UGR9 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
XIRP2A4UGR9 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
XIRP2A4UGR9 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
XIRP2A4UGR9 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
XIRP2A4UGR9 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
XIRP2A4UGR9 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
XIRP2A4UGR9 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
XIRP2A4UGR9 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
XIRP2A4UGR9 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
XIRP2A4UGR9 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
XIRP2A4UGR9 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
XIRP2A4UGR9 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
XIRP2A4UGR9 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
XIRP2A4UGR9 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
XIRP2A4UGR9 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
XIRP2A4UGR9 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
XIRP2A4UGR9 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
XIRP2A4UGR9 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
XIRP2A4UGR9 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
XIRP2A4UGR9 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
XIRP2A4UGR9 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
XIRP2A4UGR9 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
XIRP2A4UGR9 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
XIRP2A4UGR9 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
XIRP2A4UGR9 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
XIRP2A4UGR9 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms