Protein–RNA interactions for Protein: A2IDD5

CCDC78, Coiled-coil domain-containing protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC78A2IDD5 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC78A2IDD5 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC78A2IDD5 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC78A2IDD5 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC78A2IDD5 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC78A2IDD5 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC78A2IDD5 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC78A2IDD5 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC78A2IDD5 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC78A2IDD5 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC78A2IDD5 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC78A2IDD5 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC78A2IDD5 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC78A2IDD5 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC78A2IDD5 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC78A2IDD5 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC78A2IDD5 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC78A2IDD5 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC78A2IDD5 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC78A2IDD5 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC78A2IDD5 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC78A2IDD5 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC78A2IDD5 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC78A2IDD5 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC78A2IDD5 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC78A2IDD5 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC78A2IDD5 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC78A2IDD5 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC78A2IDD5 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC78A2IDD5 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC78A2IDD5 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC78A2IDD5 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC78A2IDD5 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC78A2IDD5 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC78A2IDD5 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC78A2IDD5 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC78A2IDD5 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC78A2IDD5 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC78A2IDD5 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC78A2IDD5 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC78A2IDD5 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC78A2IDD5 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC78A2IDD5 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC78A2IDD5 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC78A2IDD5 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC78A2IDD5 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC78A2IDD5 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC78A2IDD5 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC78A2IDD5 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC78A2IDD5 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC78A2IDD5 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC78A2IDD5 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC78A2IDD5 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC78A2IDD5 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC78A2IDD5 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC78A2IDD5 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC78A2IDD5 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC78A2IDD5 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC78A2IDD5 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC78A2IDD5 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC78A2IDD5 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC78A2IDD5 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC78A2IDD5 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC78A2IDD5 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC78A2IDD5 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC78A2IDD5 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC78A2IDD5 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC78A2IDD5 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC78A2IDD5 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC78A2IDD5 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC78A2IDD5 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CCDC78A2IDD5 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CCDC78A2IDD5 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CCDC78A2IDD5 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CCDC78A2IDD5 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CCDC78A2IDD5 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CCDC78A2IDD5 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CCDC78A2IDD5 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CCDC78A2IDD5 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC78A2IDD5 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC78A2IDD5 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC78A2IDD5 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC78A2IDD5 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC78A2IDD5 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC78A2IDD5 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC78A2IDD5 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC78A2IDD5 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC78A2IDD5 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC78A2IDD5 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC78A2IDD5 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC78A2IDD5 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC78A2IDD5 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC78A2IDD5 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC78A2IDD5 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC78A2IDD5 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC78A2IDD5 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC78A2IDD5 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC78A2IDD5 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC78A2IDD5 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC78A2IDD5 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms