Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ13

SHOC2, Leucine-rich repeat protein SHOC-2, humanhuman

Predictions only

Length 582 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHOC2Q9UQ13 ZNF114P1-201ENST00000453500 292 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SHOC2Q9UQ13 AL049548.1-201ENST00000458194 385 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
SHOC2Q9UQ13 RPL21P71-201ENST00000465598 459 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SHOC2Q9UQ13 AC104689.1-201ENST00000473356 768 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SHOC2Q9UQ13 RN7SL826P-201ENST00000479724 288 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SHOC2Q9UQ13 NDUFB5P1-201ENST00000508134 564 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SHOC2Q9UQ13 AC091965.2-201ENST00000512324 613 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SHOC2Q9UQ13 AC068880.2-201ENST00000521016 362 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
SHOC2Q9UQ13 AC011586.1-201ENST00000521055 458 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
SHOC2Q9UQ13 LINC01608-201ENST00000523557 544 ntTSL 4 BASIC4.9□□□□□ -1.63
SHOC2Q9UQ13 AC021006.3-201ENST00000530771 192 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SHOC2Q9UQ13 OR7K1P-201ENST00000546439 926 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SHOC2Q9UQ13 AC010196.1-201ENST00000550014 450 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
SHOC2Q9UQ13 AC129510.2-201ENST00000582774 345 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
SHOC2Q9UQ13 AC073544.2-201ENST00000601155 540 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SHOC2Q9UQ13 PSMA6P4-201ENST00000603247 718 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SHOC2Q9UQ13 AC020910.3-201ENST00000603701 874 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SHOC2Q9UQ13 AP001521.2-201ENST00000608772 546 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SHOC2Q9UQ13 RDM1-215ENST00000612980 501 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
SHOC2Q9UQ13 CCL14-204ENST00000622526 472 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
SHOC2Q9UQ13 AC005086.4-201ENST00000623065 213 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SHOC2Q9UQ13 CR381572.2-201ENST00000624852 397 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SHOC2Q9UQ13 AC090582.1-201ENST00000636321 199 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SHOC2Q9UQ13 AL928596.1-201ENST00000636738 632 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
SHOC2Q9UQ13 SCN1A-220ENST00000641603 12506 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SHOC2Q9UQ13 MTRNR2L11-201ENST00000604646 1552 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.63
SHOC2Q9UQ13 SAMMSON-226ENST00000642089 1582 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SHOC2Q9UQ13 BCLAF1-207ENST00000527759 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
SHOC2Q9UQ13 DYNC2H1-201ENST00000334267 2984 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
SHOC2Q9UQ13 AC092079.1-201ENST00000558620 1985 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SHOC2Q9UQ13 ZNF534-204ENST00000433050 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
SHOC2Q9UQ13 AL157756.1-201ENST00000532515 2859 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
SHOC2Q9UQ13 STAG2-203ENST00000371145 4393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
SHOC2Q9UQ13 Y_RNA.25-201ENST00000362528 102 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SHOC2Q9UQ13 SNAPC3-201ENST00000380799 753 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SHOC2Q9UQ13 RPL23AP29-201ENST00000397284 453 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SHOC2Q9UQ13 ZNF705D-201ENST00000400078 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SHOC2Q9UQ13 USP9YP33-201ENST00000412220 421 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SHOC2Q9UQ13 COX6B1P1-201ENST00000415962 213 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SHOC2Q9UQ13 AP000550.2-201ENST00000417463 774 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SHOC2Q9UQ13 AL672277.1-201ENST00000420865 588 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SHOC2Q9UQ13 AC104777.1-203ENST00000423428 554 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SHOC2Q9UQ13 Z74021.1-201ENST00000423610 407 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SHOC2Q9UQ13 AL590762.4-201ENST00000425885 253 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SHOC2Q9UQ13 NPM1P24-201ENST00000428039 894 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SHOC2Q9UQ13 SCP2-206ENST00000430330 938 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SHOC2Q9UQ13 CCNB1IP1P2-201ENST00000432876 818 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SHOC2Q9UQ13 AC010881.1-201ENST00000433830 235 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SHOC2Q9UQ13 AC023590.1-204ENST00000434023 431 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SHOC2Q9UQ13 AP000552.3-201ENST00000434730 775 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SHOC2Q9UQ13 B3GNT2P1-201ENST00000434960 952 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SHOC2Q9UQ13 USP9YP35-201ENST00000435696 412 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SHOC2Q9UQ13 AL445644.1-201ENST00000436524 751 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SHOC2Q9UQ13 AL357140.2-201ENST00000445884 440 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SHOC2Q9UQ13 AL591623.2-201ENST00000449978 222 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SHOC2Q9UQ13 FGF14-AS1-202ENST00000451630 321 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SHOC2Q9UQ13 RPL10P17-201ENST00000453852 316 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SHOC2Q9UQ13 AC093110.1-201ENST00000456363 602 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SHOC2Q9UQ13 DEFB109F-201ENST00000491870 277 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SHOC2Q9UQ13 HMGB1P28-201ENST00000507778 552 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SHOC2Q9UQ13 AL671862.1-201ENST00000515851 349 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SHOC2Q9UQ13 AC022784.7-201ENST00000520017 651 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SHOC2Q9UQ13 SLC2A13P1-201ENST00000531560 322 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SHOC2Q9UQ13 RFPL1S-203ENST00000539579 330 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SHOC2Q9UQ13 MFAP5-211ENST00000540087 492 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
SHOC2Q9UQ13 LINC00871-201ENST00000555246 408 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SHOC2Q9UQ13 AC012170.2-201ENST00000560380 667 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SHOC2Q9UQ13 DISC1FP1-201ENST00000561596 545 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SHOC2Q9UQ13 AC093249.4-201ENST00000564755 259 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SHOC2Q9UQ13 AC007599.2-201ENST00000573040 493 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SHOC2Q9UQ13 MIR4436B2-201ENST00000581415 91 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SHOC2Q9UQ13 MIR4436B1-201ENST00000583272 91 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SHOC2Q9UQ13 AL109935.2-201ENST00000587737 395 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SHOC2Q9UQ13 AC087385.3-201ENST00000620477 187 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SHOC2Q9UQ13 OR51G1-201ENST00000623849 966 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SHOC2Q9UQ13 AC120349.2-201ENST00000625002 298 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SHOC2Q9UQ13 VIPR1-AS1-223ENST00000627073 451 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SHOC2Q9UQ13 AC026634.1-201ENST00000634369 198 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SHOC2Q9UQ13 AC127502.3-201ENST00000636170 1206 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SHOC2Q9UQ13 C2orf83-206ENST00000642055 453 ntAPPRIS P3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SHOC2Q9UQ13 AC099063.3-201ENST00000642066 185 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SHOC2Q9UQ13 TLK1P1-201ENST00000456760 2440 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SHOC2Q9UQ13 SOBP-204ENST00000618129 1550 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
SHOC2Q9UQ13 CCSER2-210ENST00000543283 5888 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SHOC2Q9UQ13 ZC3H14-206ENST00000406216 1341 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SHOC2Q9UQ13 AC234781.1-202ENST00000412436 1329 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SHOC2Q9UQ13 RAB23-201ENST00000317483 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
SHOC2Q9UQ13 DLX6-AS1-201ENST00000430027 15364 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SHOC2Q9UQ13 TAS2R30-201ENST00000539585 1687 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SHOC2Q9UQ13 CCNT2-201ENST00000264157 6917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
SHOC2Q9UQ13 BCLAF1P2-201ENST00000624956 2609 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SHOC2Q9UQ13 PSG1-204ENST00000436291 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
SHOC2Q9UQ13 CENPE-208ENST00000611174 8260 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SHOC2Q9UQ13 GPR85-201ENST00000297146 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
SHOC2Q9UQ13 OR6K3-201ENST00000368145 1844 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
SHOC2Q9UQ13 LGI1-228ENST00000637689 1802 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
SHOC2Q9UQ13 KIF3A-203ENST00000403231 2181 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
SHOC2Q9UQ13 FCHSD2-205ENST00000409853 1867 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
SHOC2Q9UQ13 RC3H1-202ENST00000367694 3775 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
SHOC2Q9UQ13 DEFB129-201ENST00000246105 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.6 ms