Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 KCNMA1-AS1-202ENST00000429850 3566 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 KIAA1109-201ENST00000264501 15896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 RNU6-82P-201ENST00000363970 107 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.339-201ENST00000365325 102 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 SNORD42.2-201ENST00000365570 69 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 COX7A2-201ENST00000370081 914 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 LCN1P2-201ENST00000372030 223 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 RNU6-946P-201ENST00000383878 107 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.445-201ENST00000384168 102 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 AL359715.1-201ENST00000404330 555 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 AL133260.1-201ENST00000405720 405 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 RPL5P18-201ENST00000406671 891 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 RNA5SP111-201ENST00000411386 101 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 OFD1P1Y-201ENST00000411756 1225 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 TMSB10P1-201ENST00000415070 132 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 AC007349.3-201ENST00000415356 872 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 AL590705.3-201ENST00000416066 474 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 AL139095.3-201ENST00000419672 1203 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 AL050320.1-201ENST00000420044 446 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 AL137014.1-201ENST00000420490 1226 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 AC099677.1-201ENST00000420575 175 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 AC064875.1-202ENST00000421112 561 ntTSL 4 BASIC4.85□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 BX276092.7-201ENST00000433410 623 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 RPS3AP52-201ENST00000435639 297 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 AC005077.3-202ENST00000437494 300 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 LIN28AP2-201ENST00000445283 458 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 AL355537.1-201ENST00000446589 450 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 AC020550.1-201ENST00000447385 163 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 MYL6P1-201ENST00000449877 453 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 LINC00571-203ENST00000454060 525 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 AC010631.1-201ENST00000474150 156 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 CREM-230ENST00000474931 626 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 RN7SL727P-201ENST00000482164 296 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 AC004453.1-201ENST00000487895 408 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 AC005741.1-201ENST00000511094 432 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 AC010260.1-201ENST00000511484 664 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 ERLIN2-210ENST00000523107 771 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 AP002833.1-201ENST00000530572 566 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 AP001107.4-201ENST00000533576 539 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 LINC02390-201ENST00000541404 560 ntTSL 4 BASIC4.85□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 AP002383.3-201ENST00000545958 593 ntTSL 4 BASIC4.85□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 LINC02308-201ENST00000555001 637 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 AP001021.1-201ENST00000577704 244 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 AC011476.3-203ENST00000586961 346 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 AC093074.1-201ENST00000590280 556 ntTSL 4 BASIC4.85□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 LINC01928-201ENST00000591029 504 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 AC010649.1-203ENST00000592230 454 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 AC011516.1-201ENST00000599129 180 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 SCGB2B3P-201ENST00000599388 409 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 ANKRD20A19P-203ENST00000602724 295 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 SRGAP2D-201ENST00000605551 1021 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 AC116312.1-201ENST00000606841 314 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 WDR11-AS1-204ENST00000608667 522 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 TTC23L-208ENST00000610313 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 Metazoa_SRP.199-201ENST00000615501 281 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 AL354718.2-201ENST00000618030 371 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 AC072062.1-209ENST00000627336 772 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 SGIP1-204ENST00000371039 4080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 SCAMP1-206ENST00000618166 1358 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 AC092376.2-201ENST00000622621 4116 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 SLC4A4-202ENST00000340595 7640 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 C6orf10-203ENST00000442822 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 RXFP1-206ENST00000460056 2735 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 AC011900.1-201ENST00000446838 2999 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 GUCY2C-201ENST00000261170 3844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 FAM114A2-201ENST00000351797 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 PRPF4B-201ENST00000337659 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 NFX1-201ENST00000318524 3513 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 RAB23-201ENST00000317483 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 CLRN1-AS1-201ENST00000465576 2045 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 CYP3A7-201ENST00000336374 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 PICALM-201ENST00000356360 1958 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 API5-210ENST00000534600 1760 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 CRB1-203ENST00000367400 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 MTCO1P24-201ENST00000515438 1558 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 TESPA1-210ENST00000531122 1517 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 SOS1-201ENST00000395038 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 EEF1A1P24-201ENST00000451469 1378 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 PTPN3-202ENST00000374541 6703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 ZNF615-201ENST00000376716 4048 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 OR10A7-201ENST00000326258 951 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 AL121886.1-201ENST00000358609 435 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.146-201ENST00000363549 102 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 SNORD8-201ENST00000363915 110 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 RN7SKP37-201ENST00000364494 296 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 CARD16-202ENST00000375706 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 RNU6-701P-201ENST00000384059 107 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 SNORD116-29-201ENST00000384516 83 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 RNU6-738P-201ENST00000384531 106 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 TRAV13-2-201ENST00000390439 410 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 RNU6-550P-201ENST00000391057 101 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 RNY4P36-201ENST00000391116 96 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 MIR548K-201ENST00000408406 116 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 SF3B1-202ENST00000409915 600 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 AC108059.1-201ENST00000411629 725 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 MS4A6A-202ENST00000420732 863 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 AL139396.1-201ENST00000421137 167 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 EEF1GP7-201ENST00000422983 703 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 AL590399.2-201ENST00000427536 309 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 AC011998.2-201ENST00000430884 473 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
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