Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYG4

BBS9, Protein PTHB1, humanhuman

Predictions only

Length 887 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS9Q3SYG4 AP003781.1-201ENST00000543403 404 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
BBS9Q3SYG4 AC027287.2-201ENST00000547559 592 ntTSL 4 BASIC5.7□□□□□ -1.5
BBS9Q3SYG4 AC090109.1-201ENST00000548885 819 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
BBS9Q3SYG4 AC026401.1-201ENST00000549756 530 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
BBS9Q3SYG4 AC008149.1-201ENST00000551844 525 ntTSL 4 BASIC5.7□□□□□ -1.5
BBS9Q3SYG4 AL390334.1-201ENST00000556395 450 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
BBS9Q3SYG4 FRMD6-AS2-201ENST00000556617 548 ntTSL 4 BASIC5.7□□□□□ -1.5
BBS9Q3SYG4 AC090607.4-201ENST00000558192 369 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
BBS9Q3SYG4 AC068722.1-202ENST00000559600 655 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
BBS9Q3SYG4 AC018552.1-201ENST00000562099 811 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
BBS9Q3SYG4 AC019322.1-201ENST00000571869 389 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
BBS9Q3SYG4 LINC01899-201ENST00000580323 312 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
BBS9Q3SYG4 TTN-AS1-228ENST00000589234 751 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
BBS9Q3SYG4 AC090948.2-201ENST00000607363 564 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
BBS9Q3SYG4 AC138393.3-201ENST00000618397 573 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
BBS9Q3SYG4 PLCE1-AS2-213ENST00000620469 432 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
BBS9Q3SYG4 PISRT1-201ENST00000626175 531 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
BBS9Q3SYG4 AC215522.3-201ENST00000635602 354 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
BBS9Q3SYG4 MIR1321-201ENST00000637766 79 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
BBS9Q3SYG4 C2orf83-206ENST00000642055 453 ntAPPRIS P3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
BBS9Q3SYG4 LRP1B-201ENST00000389484 16535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
BBS9Q3SYG4 KMO-203ENST00000366558 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
BBS9Q3SYG4 R3HDM1-204ENST00000410054 4442 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
BBS9Q3SYG4 KAT6B-201ENST00000287239 8287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
BBS9Q3SYG4 BICRAL-201ENST00000314073 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
BBS9Q3SYG4 TEX11-201ENST00000344304 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
BBS9Q3SYG4 CDK15-204ENST00000450471 3659 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
BBS9Q3SYG4 ADAMDEC1-204ENST00000522298 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
BBS9Q3SYG4 KCNJ1-204ENST00000392665 4074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
BBS9Q3SYG4 HYKK-206ENST00000569878 4097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
BBS9Q3SYG4 GABRG2-203ENST00000414552 3927 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
BBS9Q3SYG4 CLDN12-203ENST00000394605 3488 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
BBS9Q3SYG4 FNIP1-201ENST00000307954 6366 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
BBS9Q3SYG4 KRTAP15-1-201ENST00000334067 671 ntAPPRIS P1 BASIC5.69□□□□□ -1.5
BBS9Q3SYG4 LINC02384-201ENST00000360485 471 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
BBS9Q3SYG4 MT-ND3-201ENST00000361227 346 ntAPPRIS P1 BASIC5.69□□□□□ -1.5
BBS9Q3SYG4 RNU6-441P-201ENST00000384545 106 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
BBS9Q3SYG4 EIF5P1-201ENST00000400019 1231 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
BBS9Q3SYG4 AL356057.2-201ENST00000403318 432 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
BBS9Q3SYG4 HMGB1P17-201ENST00000403495 628 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
BBS9Q3SYG4 AL356776.1-201ENST00000406574 447 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
BBS9Q3SYG4 AC012499.1-201ENST00000412133 741 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
BBS9Q3SYG4 RPS20P15-201ENST00000412792 311 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
BBS9Q3SYG4 RPSAP35-201ENST00000413753 818 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
BBS9Q3SYG4 AC079809.1-201ENST00000415468 276 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
BBS9Q3SYG4 RPS3AP9-201ENST00000417027 792 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
BBS9Q3SYG4 SDCBP-203ENST00000424270 1277 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
BBS9Q3SYG4 AC018832.1-201ENST00000428171 566 ntTSL 4 BASIC5.69□□□□□ -1.5
BBS9Q3SYG4 BX323845.3-201ENST00000428215 527 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
BBS9Q3SYG4 C1orf140-201ENST00000434398 645 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
BBS9Q3SYG4 RPL23AP16-201ENST00000441715 421 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
BBS9Q3SYG4 GAS5-218ENST00000448718 565 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
BBS9Q3SYG4 AC107072.1-201ENST00000449007 110 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
BBS9Q3SYG4 SPIN4-AS1-201ENST00000451979 426 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
BBS9Q3SYG4 BX322784.1-201ENST00000455793 1077 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
BBS9Q3SYG4 AC026410.2-201ENST00000460281 156 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
BBS9Q3SYG4 RBM43P1-201ENST00000476891 1081 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
BBS9Q3SYG4 CASP12-210ENST00000494737 961 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
BBS9Q3SYG4 HMGN1P12-201ENST00000499125 195 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
BBS9Q3SYG4 ENSA-211ENST00000503345 793 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
BBS9Q3SYG4 ADGRL3-AS1-202ENST00000504135 542 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
BBS9Q3SYG4 AC018710.1-201ENST00000506509 158 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
BBS9Q3SYG4 LINC02200-202ENST00000508879 615 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
BBS9Q3SYG4 AC011405.1-204ENST00000512875 731 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
BBS9Q3SYG4 AC097460.1-201ENST00000514624 590 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
BBS9Q3SYG4 RNU2-46P-201ENST00000517038 113 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
BBS9Q3SYG4 AC005740.3-201ENST00000520882 344 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
BBS9Q3SYG4 TRIM51DP-201ENST00000529746 596 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
BBS9Q3SYG4 KCTD21-AS1-206ENST00000532831 856 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
BBS9Q3SYG4 CYCSP28-201ENST00000534284 321 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
BBS9Q3SYG4 AL512310.1-201ENST00000548639 172 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
BBS9Q3SYG4 AC079905.1-201ENST00000549280 475 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
BBS9Q3SYG4 CYCSP38-201ENST00000559840 322 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
BBS9Q3SYG4 SLC12A1-210ENST00000561031 735 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
BBS9Q3SYG4 AC090312.1-201ENST00000580637 348 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
BBS9Q3SYG4 AC073091.2-201ENST00000603205 907 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
BBS9Q3SYG4 PSMA6P4-201ENST00000603247 718 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
BBS9Q3SYG4 AC103792.1-201ENST00000603591 919 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
BBS9Q3SYG4 AC023813.4-201ENST00000607580 580 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
BBS9Q3SYG4 AL445264.1-201ENST00000621719 171 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
BBS9Q3SYG4 AC009268.2-201ENST00000621925 457 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
BBS9Q3SYG4 LINC00976-202ENST00000628064 534 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
BBS9Q3SYG4 AC006206.1-201ENST00000544842 3387 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
BBS9Q3SYG4 DDHD2-202ENST00000517385 4113 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
BBS9Q3SYG4 AC022893.1-201ENST00000517664 3549 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
BBS9Q3SYG4 LINC02355-201ENST00000503100 2520 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
BBS9Q3SYG4 RBMX-203ENST00000431446 2004 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
BBS9Q3SYG4 CFAP70-201ENST00000310715 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
BBS9Q3SYG4 STAMBPL1-202ENST00000371924 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
BBS9Q3SYG4 SLC4A7-206ENST00000428386 7385 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
BBS9Q3SYG4 RIMS2-205ENST00000436393 4384 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
BBS9Q3SYG4 MROH9-202ENST00000367759 3165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
BBS9Q3SYG4 GABRA3-201ENST00000370314 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
BBS9Q3SYG4 AC138409.2-201ENST00000514048 5001 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
BBS9Q3SYG4 BRIP1-202ENST00000577598 3969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
BBS9Q3SYG4 OR56A3-201ENST00000329564 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.68□□□□□ -1.5
BBS9Q3SYG4 PLET1-201ENST00000338832 1215 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
BBS9Q3SYG4 RNA5SP273-201ENST00000362484 113 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
BBS9Q3SYG4 RN7SKP275-201ENST00000364626 301 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
BBS9Q3SYG4 RNA5SP30-201ENST00000365552 115 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.1 ms