Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 AC020893.1-201ENST00000502452 580 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
RTL8BQ17RB0 FTH1P24-201ENST00000503502 462 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
RTL8BQ17RB0 RNU4ATAC3P-201ENST00000516699 126 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
RTL8BQ17RB0 TBCA-206ENST00000518338 551 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
RTL8BQ17RB0 IGKV2-23-201ENST00000518729 323 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
RTL8BQ17RB0 AC090541.1-201ENST00000519803 467 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
RTL8BQ17RB0 TPT1-AS1-216ENST00000522845 403 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
RTL8BQ17RB0 HIGD1AP5-201ENST00000529959 259 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
RTL8BQ17RB0 SAMD15-202ENST00000533095 412 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
RTL8BQ17RB0 AC073530.1-201ENST00000535917 775 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
RTL8BQ17RB0 LINC00519-201ENST00000557518 682 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
RTL8BQ17RB0 AC022523.3-201ENST00000559643 410 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
RTL8BQ17RB0 HSPE1P5-201ENST00000561489 272 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
RTL8BQ17RB0 AC127502.1-204ENST00000564861 618 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
RTL8BQ17RB0 AC007493.1-202ENST00000567899 517 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
RTL8BQ17RB0 AL133383.1-201ENST00000569292 901 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
RTL8BQ17RB0 AC093330.1-201ENST00000583326 568 ntTSL 4 BASIC2.9□□□□□ -1.95
RTL8BQ17RB0 SLC14A2-AS1-203ENST00000592286 528 ntTSL 4 BASIC2.9□□□□□ -1.95
RTL8BQ17RB0 LINC00347-205ENST00000597518 868 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
RTL8BQ17RB0 AC084373.1-201ENST00000603311 235 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
RTL8BQ17RB0 LINC00343-210ENST00000608220 806 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
RTL8BQ17RB0 AL391497.1-201ENST00000608671 547 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
RTL8BQ17RB0 AC244517.5-201ENST00000624139 722 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
RTL8BQ17RB0 CGA-204ENST00000627148 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
RTL8BQ17RB0 LINC01002-206ENST00000631772 539 ntTSL 4 BASIC2.9□□□□□ -1.95
RTL8BQ17RB0 FOXP2-227ENST00000638397 240 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
RTL8BQ17RB0 OR8B2-202ENST00000641451 1056 ntAPPRIS P1 BASIC2.9□□□□□ -1.95
RTL8BQ17RB0 AC073073.2-201ENST00000609827 2578 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
RTL8BQ17RB0 AC007656.2-201ENST00000624902 4547 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
RTL8BQ17RB0 LINC01416-201ENST00000563553 2310 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
RTL8BQ17RB0 AL133383.2-201ENST00000622958 2336 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
RTL8BQ17RB0 ZNF266-204ENST00000590306 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
RTL8BQ17RB0 LINC01192-202ENST00000470546 1519 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
RTL8BQ17RB0 AC068647.1-201ENST00000489539 2265 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RTL8BQ17RB0 IQCH-201ENST00000335894 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
RTL8BQ17RB0 SYTL2-203ENST00000359152 4123 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
RTL8BQ17RB0 SKINT1L-201ENST00000401057 817 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RTL8BQ17RB0 LSM5-205ENST00000409952 687 ntTSL 4 BASIC2.89□□□□□ -1.95
RTL8BQ17RB0 LSM5-206ENST00000409987 504 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
RTL8BQ17RB0 RNU2-37P-201ENST00000410695 177 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RTL8BQ17RB0 DPP10-AS3-201ENST00000417844 665 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
RTL8BQ17RB0 RPS15AP6-201ENST00000420703 385 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RTL8BQ17RB0 ARF4P2-201ENST00000430209 526 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RTL8BQ17RB0 AL645931.1-201ENST00000439737 410 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RTL8BQ17RB0 AC245517.2-201ENST00000442890 346 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RTL8BQ17RB0 AL357552.1-201ENST00000445254 415 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RTL8BQ17RB0 AC022336.1-201ENST00000475510 337 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RTL8BQ17RB0 TMED11P-201ENST00000479478 690 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RTL8BQ17RB0 AC078817.1-201ENST00000492623 435 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RTL8BQ17RB0 OR5H4P-201ENST00000510851 923 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RTL8BQ17RB0 AC026402.1-201ENST00000513642 170 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RTL8BQ17RB0 FABP5P12-201ENST00000515543 389 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RTL8BQ17RB0 SNORA70.19-201ENST00000516717 90 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RTL8BQ17RB0 RANP9-201ENST00000519957 271 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RTL8BQ17RB0 FBXO3-AS1-202ENST00000533046 386 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
RTL8BQ17RB0 AC013437.1-201ENST00000549878 414 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
RTL8BQ17RB0 DUXAP6-201ENST00000553858 601 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RTL8BQ17RB0 AL160191.1-201ENST00000555480 566 ntTSL 4 BASIC2.89□□□□□ -1.95
RTL8BQ17RB0 RN7SL703P-201ENST00000578485 302 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RTL8BQ17RB0 AC087399.1-201ENST00000579769 573 ntTSL 4 BASIC2.89□□□□□ -1.95
RTL8BQ17RB0 AC107982.3-201ENST00000584957 985 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RTL8BQ17RB0 AL451086.1-201ENST00000605596 223 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RTL8BQ17RB0 AP003117.2-201ENST00000606010 545 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RTL8BQ17RB0 RNU1-30P-201ENST00000606575 163 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RTL8BQ17RB0 AC027045.1-201ENST00000609065 202 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
RTL8BQ17RB0 PTPN22-207ENST00000528414 3424 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
RTL8BQ17RB0 ATP2B1-203ENST00000393164 3127 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
RTL8BQ17RB0 PARP15-206ENST00000493645 1311 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
RTL8BQ17RB0 KIAA1841-202ENST00000356719 2149 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
RTL8BQ17RB0 C6orf10-204ENST00000447241 2148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
RTL8BQ17RB0 PPP1R12A-204ENST00000546369 2977 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
RTL8BQ17RB0 DMD-203ENST00000357033 13956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
RTL8BQ17RB0 CD86-203ENST00000393627 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
RTL8BQ17RB0 DFNB59-201ENST00000375129 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
RTL8BQ17RB0 TRGV11-201ENST00000390340 463 ntAPPRIS P1 BASIC2.88□□□□□ -1.95
RTL8BQ17RB0 RN7SKP263-201ENST00000411194 309 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RTL8BQ17RB0 MTND4P22-201ENST00000413116 1169 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RTL8BQ17RB0 AC009502.1-203ENST00000416861 496 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
RTL8BQ17RB0 AC090952.1-201ENST00000424242 446 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
RTL8BQ17RB0 AC004975.1-201ENST00000428733 208 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RTL8BQ17RB0 AC074367.1-201ENST00000438685 1125 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RTL8BQ17RB0 DIAPH2-AS1-202ENST00000445414 606 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
RTL8BQ17RB0 NEGR1-IT1-201ENST00000453121 534 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
RTL8BQ17RB0 AL450344.1-201ENST00000456018 639 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
RTL8BQ17RB0 AC010401.1-201ENST00000463867 348 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RTL8BQ17RB0 TRBV8-2-201ENST00000475637 270 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RTL8BQ17RB0 PLAC8-205ENST00000509973 489 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
RTL8BQ17RB0 NPM1P41-201ENST00000512920 831 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RTL8BQ17RB0 AL389895.1-201ENST00000554127 252 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RTL8BQ17RB0 AC009558.2-201ENST00000558258 396 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
RTL8BQ17RB0 AC009019.1-202ENST00000568410 405 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
RTL8BQ17RB0 AC003687.1-201ENST00000578040 427 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
RTL8BQ17RB0 MIR5047-201ENST00000579212 100 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RTL8BQ17RB0 TTN-AS1-222ENST00000587576 399 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
RTL8BQ17RB0 ZEB2-AS1-204ENST00000595109 855 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
RTL8BQ17RB0 MIR7851-201ENST00000610611 160 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RTL8BQ17RB0 AC139769.3-201ENST00000618383 175 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RTL8BQ17RB0 MIR4278-201ENST00000636094 69 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RTL8BQ17RB0 MFSD8-233ENST00000641482 4860 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RTL8BQ17RB0 LINC01085-201ENST00000502759 1984 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.7 ms