Protein–RNA interactions for Protein: Q16658

FSCN1, Fascin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSCN1Q16658 AC008687.2-201ENST00000597865 520 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
FSCN1Q16658 AL590392.1-201ENST00000604960 446 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
FSCN1Q16658 AC106028.5-201ENST00000610332 395 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
FSCN1Q16658 AL121873.1-201ENST00000616013 524 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
FSCN1Q16658 AC079906.1-201ENST00000621214 815 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
FSCN1Q16658 MIR6830-201ENST00000636015 70 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
FSCN1Q16658 ZNF836-204ENST00000597252 3209 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
FSCN1Q16658 PHTF2-208ENST00000450574 2516 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
FSCN1Q16658 ZNF678-201ENST00000343776 8556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
FSCN1Q16658 CDC42BPA-204ENST00000366767 9320 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
FSCN1Q16658 ZNF418-205ENST00000595830 3543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
FSCN1Q16658 ZC3H12B-201ENST00000338957 7256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
FSCN1Q16658 AASDH-201ENST00000205214 3590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
FSCN1Q16658 ENPP3-201ENST00000357639 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
FSCN1Q16658 PLCXD3-201ENST00000328457 7538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
FSCN1Q16658 AP000473.2-201ENST00000602659 1537 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
FSCN1Q16658 CEP162-207ENST00000617909 5095 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
FSCN1Q16658 OTC-201ENST00000039007 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
FSCN1Q16658 OFD1P5Y-201ENST00000447585 2590 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
FSCN1Q16658 PRUNE2-207ENST00000428286 12437 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
FSCN1Q16658 AC025574.1-201ENST00000554784 1653 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
FSCN1Q16658 SPART-202ENST00000438666 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
FSCN1Q16658 MID2-202ENST00000443968 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
FSCN1Q16658 RPL21P132-201ENST00000331267 462 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
FSCN1Q16658 AKAP14-201ENST00000334356 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
FSCN1Q16658 RNA5SP447-201ENST00000363749 119 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
FSCN1Q16658 RNU6-660P-201ENST00000364566 109 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
FSCN1Q16658 LINC00474-201ENST00000374014 769 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
FSCN1Q16658 RNA5SP397-201ENST00000391323 118 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
FSCN1Q16658 MTCO3P31-201ENST00000405526 789 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
FSCN1Q16658 NCSTNP1-201ENST00000406229 144 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
FSCN1Q16658 MAST4-207ENST00000407621 559 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
FSCN1Q16658 Y_RNA.619-201ENST00000410951 90 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
FSCN1Q16658 PRELID3BP11-201ENST00000414230 479 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
FSCN1Q16658 MTCO1P21-201ENST00000416634 589 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
FSCN1Q16658 RPEP3-201ENST00000425462 676 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
FSCN1Q16658 NPM1P24-201ENST00000428039 894 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
FSCN1Q16658 AC010881.1-201ENST00000433830 235 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
FSCN1Q16658 B3GNT2P1-201ENST00000434960 952 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
FSCN1Q16658 AC006511.1-201ENST00000470614 315 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
FSCN1Q16658 AC013828.1-201ENST00000481845 158 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
FSCN1Q16658 BTBD11-206ENST00000494235 811 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
FSCN1Q16658 AC084117.1-201ENST00000496975 270 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
FSCN1Q16658 AC092608.1-201ENST00000503505 267 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
FSCN1Q16658 AC006499.5-201ENST00000505037 514 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
FSCN1Q16658 AC091868.1-201ENST00000508746 304 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
FSCN1Q16658 AC010625.1-201ENST00000511296 403 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
FSCN1Q16658 MTCYBP43-201ENST00000513621 740 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
FSCN1Q16658 AC084838.1-201ENST00000532973 312 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
FSCN1Q16658 PRB1-204ENST00000546254 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
FSCN1Q16658 AC124784.1-201ENST00000552426 571 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
FSCN1Q16658 AP001029.2-202ENST00000588197 739 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
FSCN1Q16658 AC020914.6-201ENST00000594327 272 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
FSCN1Q16658 AC024075.3-201ENST00000601687 453 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
FSCN1Q16658 AC004987.4-201ENST00000603383 338 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
FSCN1Q16658 AC018695.5-201ENST00000605872 315 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
FSCN1Q16658 AC024560.3-201ENST00000608482 349 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
FSCN1Q16658 AC012360.2-201ENST00000609349 391 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
FSCN1Q16658 AC104073.3-201ENST00000610942 955 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
FSCN1Q16658 IL33-205ENST00000611532 757 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
FSCN1Q16658 AL590240.3-201ENST00000621416 943 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
FSCN1Q16658 AC079228.1-201ENST00000624774 1049 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
FSCN1Q16658 AC092184.1-201ENST00000625042 715 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
FSCN1Q16658 AC006927.3-201ENST00000638789 384 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
FSCN1Q16658 DNAH14-208ENST00000430092 13763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
FSCN1Q16658 PARD3B-212ENST00000613457 7559 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
FSCN1Q16658 WAC-209ENST00000428935 1320 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
FSCN1Q16658 AC108751.5-201ENST00000492880 1336 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
FSCN1Q16658 AC093775.1-201ENST00000624154 1868 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
FSCN1Q16658 AL442639.1-201ENST00000625030 1899 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
FSCN1Q16658 PIK3C3-201ENST00000262039 9443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
FSCN1Q16658 ZNF611-201ENST00000319783 3153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
FSCN1Q16658 AL592148.3-201ENST00000608771 2646 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
FSCN1Q16658 LIMA1-212ENST00000552491 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
FSCN1Q16658 ATP8A2P3-201ENST00000426792 1536 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
FSCN1Q16658 KDM3B-209ENST00000542866 3634 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
FSCN1Q16658 USP9YP4-201ENST00000424401 1745 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
FSCN1Q16658 HUWE1-214ENST00000612484 14311 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
FSCN1Q16658 C5orf42-201ENST00000425232 11199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
FSCN1Q16658 SENP1-205ENST00000549595 1932 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
FSCN1Q16658 DDX20-202ENST00000475700 4332 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
FSCN1Q16658 U3.23-201ENST00000391132 200 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
FSCN1Q16658 PRRC2CP1-201ENST00000404428 159 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
FSCN1Q16658 CEBPZOS-205ENST00000406711 687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
FSCN1Q16658 AL354726.1-201ENST00000411981 402 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
FSCN1Q16658 RPL12P9-201ENST00000412942 488 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
FSCN1Q16658 MTCYBP38-201ENST00000417160 1123 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
FSCN1Q16658 LINC00993-201ENST00000420453 540 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
FSCN1Q16658 AC009237.2-201ENST00000421358 284 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
FSCN1Q16658 AC009965.2-201ENST00000425328 970 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
FSCN1Q16658 RPS3AP44-201ENST00000425466 790 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
FSCN1Q16658 AL732292.1-201ENST00000426692 226 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
FSCN1Q16658 OFD1P12Y-201ENST00000427963 1207 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
FSCN1Q16658 MTND2P20-201ENST00000440805 661 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
FSCN1Q16658 RPL7AP61-201ENST00000443410 636 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
FSCN1Q16658 AC092155.1-201ENST00000444672 573 ntTSL 4 BASIC5.37□□□□□ -1.55
FSCN1Q16658 SLC31A1P1-201ENST00000451221 567 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
FSCN1Q16658 RPL18AP17-201ENST00000455326 198 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
FSCN1Q16658 ARPC3P2-201ENST00000457786 533 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
FSCN1Q16658 AL035454.1-201ENST00000470758 433 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.5 ms