Protein–RNA interactions for Protein: Q16656

NRF1, Nuclear respiratory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRF1Q16656 AL391261.4-201ENST00000616012 481 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 RDM1-221ENST00000617591 432 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 AP003072.4-201ENST00000624580 310 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 AL356094.1-201ENST00000624663 1212 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 METTL8-218ENST00000638989 876 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 METTL8-219ENST00000640734 726 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 TLR10-206ENST00000508334 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 AC097512.1-201ENST00000511453 1309 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 PSMA5-201ENST00000271308 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 MS4A14-201ENST00000300187 2997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 CCDC110-202ENST00000393540 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 AC096656.1-201ENST00000623826 1364 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 FLG-AS1-205ENST00000445097 2857 ntTSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 RNF6P1-201ENST00000444889 1784 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 DPP10-204ENST00000409163 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 MACF1-201ENST00000289893 19141 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 MTUS1-228ENST00000544260 3650 ntTSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 ETV1-203ENST00000403527 3363 ntTSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 AC024341.1-201ENST00000526444 1552 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 RN7SKP280-201ENST00000364196 304 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 CD84-204ENST00000368048 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 CD84-205ENST00000368051 965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 C9orf92-201ENST00000380683 359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 MIR554-201ENST00000384874 96 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 AL117339.2-201ENST00000430475 180 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 IGKV1OR9-2-201ENST00000431378 277 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 AL031663.1-201ENST00000437445 219 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 AL360089.1-201ENST00000442260 436 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 Z95327.1-201ENST00000446082 482 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 AL162151.2-201ENST00000448875 158 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 NDUFS5P3-201ENST00000450668 321 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 AL365318.1-201ENST00000453128 705 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 CD200R1-205ENST00000490004 778 ntTSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 NIPA2P2-201ENST00000496376 1083 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 IGKV3OR22-2-201ENST00000517943 313 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 AL451137.1-201ENST00000523363 443 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 THEM7P-202ENST00000525689 764 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 GCSAML-207ENST00000527541 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 C11orf65-206ENST00000529391 973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 AC079598.1-201ENST00000548691 554 ntTSL 4 BASIC3.61□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 PPFIA2-AS1-210ENST00000553197 875 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 LINC02316-201ENST00000553346 768 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 LINC02303-202ENST00000554711 531 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 MIR4716-201ENST00000579628 84 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 AC026620.1-201ENST00000584815 326 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 AC115085.1-201ENST00000588924 229 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 ZRANB2-AS2-212ENST00000590186 686 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 AC011477.2-201ENST00000590697 921 ntTSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 AP001172.1-201ENST00000602921 581 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 LINC00310-206ENST00000609947 892 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 uc_338.32-201ENST00000615087 172 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 MIR1264-201ENST00000616374 69 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 FZD3-201ENST00000240093 13736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 LGI1-210ENST00000629035 2251 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 SYNE1-201ENST00000341594 26584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 THOC1-221ENST00000631280 2011 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 HERC4-204ENST00000395198 4445 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 KNTC1-201ENST00000333479 6975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 RABGAP1L-202ENST00000325589 1880 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 TTC21B-AS1-201ENST00000440322 2260 ntTSL 4 BASIC3.6□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 GEN1-201ENST00000317402 9854 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 RIOK3P1-201ENST00000418778 1528 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 AL589745.1-201ENST00000421190 3336 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 ZNF266-204ENST00000590306 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 OR8G1-201ENST00000341493 936 ntAPPRIS P1 BASIC3.6□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 PKIB-202ENST00000354275 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 CXorf66-201ENST00000370540 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 CTNNAL1-203ENST00000374594 824 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 SEC61A2-203ENST00000379017 600 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 OR51F1-201ENST00000380383 960 ntAPPRIS P5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 RNU6-317P-201ENST00000384031 107 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 TAF9BP2-201ENST00000400856 499 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 RN7SKP285-201ENST00000410137 318 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 SNORA57.3-201ENST00000411095 141 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 OR8G2P-201ENST00000412796 908 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 AC105402.1-201ENST00000413336 545 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 AC095032.2-201ENST00000414923 418 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 AC092155.1-202ENST00000416111 932 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 AC073069.1-201ENST00000428657 441 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 AC073508.1-201ENST00000428866 656 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 AC016912.1-201ENST00000432241 545 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 ARHGEF7-AS1-201ENST00000435037 321 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 TBCAP1-201ENST00000436520 327 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 AC009950.1-206ENST00000445199 517 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 MTND2P30-201ENST00000456663 382 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 MTND6P6-201ENST00000478031 263 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 AC123768.1-201ENST00000486285 432 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 TPT1P3-201ENST00000492841 512 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 AC034234.1-201ENST00000502993 465 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 LINC02430-201ENST00000504755 476 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 LINC01088-203ENST00000507476 785 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 AC025768.1-201ENST00000510057 267 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 AC090819.1-201ENST00000523800 1111 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 OR5AP1P-201ENST00000529730 940 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 AC073862.1-201ENST00000537998 409 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 DAZAP2-209ENST00000549732 601 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 LINC02277-201ENST00000553386 453 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 AC007424.1-203ENST00000554613 687 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 AL355922.1-201ENST00000555624 337 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 AC084757.1-201ENST00000559987 490 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 162.5 ms