Protein–RNA interactions for Protein: Q13946

PDE7A, High affinity cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 7A, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE7AQ13946 MYSM1-203ENST00000472487 7785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.78
PDE7AQ13946 PCDH11X-206ENST00000373097 9146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.78
PDE7AQ13946 LINC01505-206ENST00000637046 4266 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.78
PDE7AQ13946 RNU5B-4P-201ENST00000363508 111 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
PDE7AQ13946 RNA5SP513-201ENST00000364648 118 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
PDE7AQ13946 RNA5SP366-201ENST00000365454 123 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
PDE7AQ13946 AL161909.1-201ENST00000397390 712 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
PDE7AQ13946 RN7SKP182-201ENST00000410772 298 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
PDE7AQ13946 AC069282.1-201ENST00000411911 526 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
PDE7AQ13946 AC011933.1-201ENST00000413334 321 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
PDE7AQ13946 RPL31P2-201ENST00000413849 377 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
PDE7AQ13946 AC010163.2-201ENST00000416341 381 ntTSL 2 BASIC3.9□□□□□ -1.79
PDE7AQ13946 AL158840.1-202ENST00000425754 694 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
PDE7AQ13946 NANOGP6-201ENST00000429190 847 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
PDE7AQ13946 FTH1P6-201ENST00000430768 320 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
PDE7AQ13946 AC011742.1-201ENST00000431448 434 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
PDE7AQ13946 LINC01826-201ENST00000432894 584 ntTSL 4 BASIC3.9□□□□□ -1.79
PDE7AQ13946 CKS1BP5-201ENST00000434172 273 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
PDE7AQ13946 USP9YP7-201ENST00000436723 430 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
PDE7AQ13946 TPTE2P3-201ENST00000441562 1189 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
PDE7AQ13946 AL590399.6-201ENST00000446396 307 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
PDE7AQ13946 AL121718.1-201ENST00000449463 387 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
PDE7AQ13946 USP9YP32-201ENST00000452432 430 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
PDE7AQ13946 HCG17-214ENST00000453558 732 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
PDE7AQ13946 LINC01878-202ENST00000453965 405 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
PDE7AQ13946 AC116533.1-201ENST00000459748 321 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
PDE7AQ13946 XACT-201ENST00000468762 497 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
PDE7AQ13946 AC011276.1-201ENST00000469688 323 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
PDE7AQ13946 RPS26P15-201ENST00000488067 348 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
PDE7AQ13946 AF213884.1-201ENST00000488102 463 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
PDE7AQ13946 RNF138P1-201ENST00000502765 546 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
PDE7AQ13946 AC016065.2-201ENST00000514530 444 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
PDE7AQ13946 AC112198.4-201ENST00000515450 351 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
PDE7AQ13946 RNU7-143P-201ENST00000516781 65 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
PDE7AQ13946 AC064807.2-201ENST00000521188 672 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
PDE7AQ13946 AP001207.1-201ENST00000524051 481 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
PDE7AQ13946 AP003066.2-201ENST00000529375 555 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
PDE7AQ13946 AC068339.2-201ENST00000534395 618 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
PDE7AQ13946 PRH1-206ENST00000543626 710 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
PDE7AQ13946 PSMB7P1-201ENST00000556349 514 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
PDE7AQ13946 AC126365.2-201ENST00000580630 379 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
PDE7AQ13946 MSMB-201ENST00000581478 386 ntTSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
PDE7AQ13946 DSCR9-205ENST00000585273 751 ntTSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
PDE7AQ13946 AC007993.3-202ENST00000585329 725 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
PDE7AQ13946 AC105094.2-203ENST00000590357 555 ntTSL 4 BASIC3.9□□□□□ -1.79
PDE7AQ13946 ZNF616-203ENST00000597013 577 ntTSL 4 BASIC3.9□□□□□ -1.79
PDE7AQ13946 AC002487.1-201ENST00000604565 994 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
PDE7AQ13946 AC233309.1-201ENST00000619522 751 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
PDE7AQ13946 C8orf89-203ENST00000625134 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
PDE7AQ13946 MACF1-231ENST00000564288 24828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
PDE7AQ13946 LRRC9-202ENST00000445360 4717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
PDE7AQ13946 AC068254.2-201ENST00000623938 3577 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
PDE7AQ13946 GDAP2-202ENST00000369443 8828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.9□□□□□ -1.79
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PDE7AQ13946 LINC01102-204ENST00000451400 3778 ntTSL 2 BASIC3.9□□□□□ -1.79
PDE7AQ13946 SPAM1-205ENST00000439500 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
PDE7AQ13946 AC116667.1-201ENST00000604855 2072 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
PDE7AQ13946 POSTN-202ENST00000379743 3196 ntTSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
PDE7AQ13946 ADGRG2-205ENST00000357991 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
PDE7AQ13946 ANKRD36C-202ENST00000456556 5428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
PDE7AQ13946 MRPL42-206ENST00000549982 15582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
PDE7AQ13946 NPFFR2-203ENST00000358749 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
PDE7AQ13946 RC3H2-203ENST00000373670 9248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
PDE7AQ13946 CDKL3-209ENST00000523054 1775 ntTSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
PDE7AQ13946 PCDH15-234ENST00000622048 6820 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
PDE7AQ13946 AL589745.1-201ENST00000421190 3336 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
PDE7AQ13946 LINC02120-201ENST00000505518 2008 ntTSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
PDE7AQ13946 EFHC1-205ENST00000538167 5308 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
PDE7AQ13946 OR1L1-201ENST00000309623 933 ntAPPRIS P1 BASIC3.89□□□□□ -1.79
PDE7AQ13946 OR1L1-202ENST00000373686 1083 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
PDE7AQ13946 TMEM225-201ENST00000375026 1107 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
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PDE7AQ13946 AL355379.1-201ENST00000405542 640 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
PDE7AQ13946 RNU4-25P-201ENST00000410569 230 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
PDE7AQ13946 RNA5SP39-201ENST00000411245 120 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
PDE7AQ13946 AC004552.1-201ENST00000419089 348 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
PDE7AQ13946 FNDC1-IT1-201ENST00000419703 516 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
PDE7AQ13946 RPS12P5-201ENST00000423449 371 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
PDE7AQ13946 RAB3GAP1-202ENST00000425393 1139 ntTSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
PDE7AQ13946 LINC01598-201ENST00000432067 460 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
PDE7AQ13946 B3GNT2P1-201ENST00000434960 952 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
PDE7AQ13946 AC006011.1-201ENST00000442758 349 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
PDE7AQ13946 AC105271.1-201ENST00000442876 497 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
PDE7AQ13946 Z99714.1-201ENST00000450463 807 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
PDE7AQ13946 RN7SL303P-201ENST00000469773 251 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
PDE7AQ13946 RPS26P3-201ENST00000470205 348 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
PDE7AQ13946 AC090543.2-201ENST00000483963 348 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
PDE7AQ13946 AC004057.1-201ENST00000485827 348 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
PDE7AQ13946 MGAT4A-209ENST00000495056 683 ntTSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
PDE7AQ13946 AC026414.1-201ENST00000504046 698 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
PDE7AQ13946 AC093864.1-201ENST00000504555 745 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
PDE7AQ13946 LINC02230-201ENST00000511174 301 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
PDE7AQ13946 AC018797.3-201ENST00000513388 1241 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
PDE7AQ13946 AC104057.1-201ENST00000515547 497 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
PDE7AQ13946 Vault.1-201ENST00000516474 102 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
PDE7AQ13946 AC087623.1-201ENST00000533301 377 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
PDE7AQ13946 AC004217.2-201ENST00000547401 751 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
PDE7AQ13946 AC068643.2-202ENST00000552759 622 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
PDE7AQ13946 ETFRF1-202ENST00000553788 708 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
PDE7AQ13946 PCLAF-203ENST00000558008 766 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
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