Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 SEC23A-215ENST00000625395 261 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
PTCH1Q13635 EPHA7-202ENST00000369303 6588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
PTCH1Q13635 OR5B12-202ENST00000641921 1807 ntAPPRIS P1 BASIC4.92□□□□□ -1.62
PTCH1Q13635 MMS22L-202ENST00000369251 3949 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
PTCH1Q13635 ATP2B1-203ENST00000393164 3127 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
PTCH1Q13635 THNSL1-201ENST00000376356 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
PTCH1Q13635 CLHC1-201ENST00000401408 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
PTCH1Q13635 ZBED6-202ENST00000550078 12481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
PTCH1Q13635 SRP72P2-201ENST00000344851 1979 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
PTCH1Q13635 ADGRL2-203ENST00000370713 5382 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
PTCH1Q13635 PARP8-211ENST00000505554 3825 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
PTCH1Q13635 CASC1-203ENST00000395987 2363 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
PTCH1Q13635 ZNF280C-201ENST00000370978 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
PTCH1Q13635 GABRG2-217ENST00000639384 5360 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
PTCH1Q13635 ADGRG2-206ENST00000360279 4702 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
PTCH1Q13635 DEFB128-201ENST00000334391 373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
PTCH1Q13635 AL034403.1-201ENST00000399414 885 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
PTCH1Q13635 AL024507.1-201ENST00000412741 274 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
PTCH1Q13635 AC099060.1-201ENST00000427806 448 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
PTCH1Q13635 LINC01935-201ENST00000431897 437 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
PTCH1Q13635 AL359878.2-201ENST00000435531 407 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
PTCH1Q13635 AC069277.2-201ENST00000454211 432 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
PTCH1Q13635 C1DP3-201ENST00000455013 423 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
PTCH1Q13635 MDM4-213ENST00000507825 481 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
PTCH1Q13635 GYPA-211ENST00000535709 695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
PTCH1Q13635 UBE2NP1-201ENST00000545592 458 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
PTCH1Q13635 AL133370.2-201ENST00000619934 439 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
PTCH1Q13635 AC125613.1-204ENST00000636224 1248 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
PTCH1Q13635 OR8D1-202ENST00000641015 8286 ntAPPRIS P1 BASIC4.91□□□□□ -1.62
PTCH1Q13635 FIGNL1-212ENST00000613602 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
PTCH1Q13635 GPR18-203ENST00000397473 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
PTCH1Q13635 OR2AT4-203ENST00000641541 8795 ntAPPRIS P1 BASIC4.91□□□□□ -1.62
PTCH1Q13635 AGTR2-201ENST00000371906 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
PTCH1Q13635 VPS13C-202ENST00000261517 13400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
PTCH1Q13635 UBA5-201ENST00000264991 2850 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
PTCH1Q13635 BX323014.1-201ENST00000412876 237 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
PTCH1Q13635 AL138962.1-201ENST00000417987 411 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
PTCH1Q13635 COTL1P1-201ENST00000422309 375 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
PTCH1Q13635 MTND2P11-201ENST00000423638 648 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
PTCH1Q13635 AC104170.2-201ENST00000424246 678 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.62
PTCH1Q13635 AC069360.1-201ENST00000503469 431 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.62
PTCH1Q13635 RHOBTB3-204ENST00000504179 883 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
PTCH1Q13635 PTGES3P3-201ENST00000511479 482 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
PTCH1Q13635 RN7SKP209-201ENST00000516888 304 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
PTCH1Q13635 A2ML1-AS1-201ENST00000537288 452 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.62
PTCH1Q13635 AC090503.2-201ENST00000551135 981 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.62
PTCH1Q13635 MIR4276-201ENST00000584832 70 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
PTCH1Q13635 AC019131.2-201ENST00000609071 870 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
PTCH1Q13635 MIR4727-201ENST00000622232 55 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
PTCH1Q13635 STAU2-201ENST00000355780 4061 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
PTCH1Q13635 IQGAP2-202ENST00000379730 5442 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
PTCH1Q13635 ZC3H14-206ENST00000406216 1341 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
PTCH1Q13635 GALNT3-202ENST00000409882 2107 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
PTCH1Q13635 PRKACB-219ENST00000614872 4306 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
PTCH1Q13635 SPINK1-201ENST00000296695 542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
PTCH1Q13635 RNU6-386P-201ENST00000362650 107 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PTCH1Q13635 RNA5SP296-201ENST00000410523 111 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PTCH1Q13635 FRMPD3-AS1-201ENST00000415252 457 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
PTCH1Q13635 C21orf91-OT1-202ENST00000430815 717 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
PTCH1Q13635 AL359706.1-201ENST00000437748 315 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
PTCH1Q13635 HNRNPDLP3-201ENST00000456745 380 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PTCH1Q13635 GTPBP8-204ENST00000467752 686 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
PTCH1Q13635 LINC01327-201ENST00000498413 535 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
PTCH1Q13635 AC135457.1-201ENST00000503553 664 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
PTCH1Q13635 AC105924.1-201ENST00000504057 339 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
PTCH1Q13635 IL7R-204ENST00000506850 1004 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
PTCH1Q13635 snoU109.6-201ENST00000516831 118 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PTCH1Q13635 AC136777.1-201ENST00000517765 369 ntTSL 4 BASIC4.89□□□□□ -1.63
PTCH1Q13635 AC005476.1-201ENST00000554427 397 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PTCH1Q13635 AC023908.1-201ENST00000559899 567 ntTSL 4 BASIC4.89□□□□□ -1.63
PTCH1Q13635 AL451007.1-201ENST00000595491 289 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PTCH1Q13635 AP002967.1-201ENST00000624203 539 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PTCH1Q13635 LINC02393-202ENST00000614177 1993 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
PTCH1Q13635 AL353784.1-201ENST00000422842 2300 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
PTCH1Q13635 OBSCN-205ENST00000422127 24060 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
PTCH1Q13635 SAGE2P-201ENST00000420011 2126 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PTCH1Q13635 FPGT-TNNI3K-202ENST00000370895 7566 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
PTCH1Q13635 MAPK10-353ENST00000641803 8483 ntAPPRIS P2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
PTCH1Q13635 LRRC49-222ENST00000560158 1898 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
PTCH1Q13635 UBE2D2-201ENST00000253815 444 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
PTCH1Q13635 AL357075.1-201ENST00000404107 726 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PTCH1Q13635 U3.39-201ENST00000408569 239 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PTCH1Q13635 MTCYBP7-201ENST00000419540 1134 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PTCH1Q13635 AC008065.1-201ENST00000428525 348 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PTCH1Q13635 AL392003.1-201ENST00000434394 243 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PTCH1Q13635 AL020998.1-201ENST00000444923 229 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
PTCH1Q13635 RPS29P31-201ENST00000446147 164 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PTCH1Q13635 CCRL1P1-201ENST00000449542 1053 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PTCH1Q13635 RN7SL594P-201ENST00000470590 287 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PTCH1Q13635 AC083800.1-201ENST00000490594 246 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
PTCH1Q13635 AC006445.1-201ENST00000491925 405 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PTCH1Q13635 AC093523.1-201ENST00000503268 499 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
PTCH1Q13635 IGKV2-26-201ENST00000518305 343 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PTCH1Q13635 AL360157.1-201ENST00000565962 87 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PTCH1Q13635 AC006023.1-201ENST00000603944 259 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PTCH1Q13635 ACTR3BP1-201ENST00000605584 1247 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PTCH1Q13635 AC127502.3-201ENST00000636170 1206 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PTCH1Q13635 STEAP2-203ENST00000394622 6612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
PTCH1Q13635 ABI3BP-206ENST00000471714 6783 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
PTCH1Q13635 ANGPTL1-202ENST00000367629 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
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