Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 ZNF700-202ENST00000482090 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 ZNF849P-201ENST00000594711 1566 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 UGT8-202ENST00000394511 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 SLC17A4-203ENST00000439485 3699 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 AC110597.3-202ENST00000583493 3289 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 AC105074.1-201ENST00000623380 3095 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 RAPH1-203ENST00000374493 3909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 IQCH-206ENST00000546225 3112 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 STON1-GTF2A1L-203ENST00000402114 3790 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 IL23R-202ENST00000395227 1459 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 CLEC4A-201ENST00000229332 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 OR1E2-201ENST00000248384 972 ntAPPRIS P1 BASIC4.14□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 MDM2-203ENST00000299252 966 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 CSN3-201ENST00000304954 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 DNAJC12-202ENST00000339758 1064 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 NAMPT-202ENST00000354289 1213 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 MIR448-201ENST00000362131 111 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 RNA5SP52-201ENST00000362448 134 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 SLAMF6-201ENST00000368055 730 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 STON1-GTF2A1L-202ENST00000394754 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 AC112721.2-201ENST00000409910 541 ntTSL 4 BASIC4.14□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 VN1R51P-201ENST00000411675 945 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 CBLL1-202ENST00000415884 804 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 GRM7-AS3-203ENST00000424366 486 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 AC009299.3-203ENST00000435692 1096 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 AC092809.1-201ENST00000441469 474 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 AC009987.1-201ENST00000446888 806 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 RPL5P30-201ENST00000465511 891 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 AC027701.1-201ENST00000520155 823 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 AC010306.1-201ENST00000523223 1117 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 THEM7P-202ENST00000525689 764 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 AC073525.1-202ENST00000550049 732 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 SNHG14-221ENST00000554726 1116 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 AC012409.1-201ENST00000560176 358 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 HYKK-203ENST00000563233 734 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 AC106785.1-201ENST00000565935 262 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 MTND6P33-201ENST00000571794 183 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 LINC02079-201ENST00000582518 294 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 DSCR9-205ENST00000585273 751 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 AC022916.3-201ENST00000592961 742 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 AC133552.5-201ENST00000604266 540 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 PLSCR2-206ENST00000610787 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 AL050303.3-201ENST00000613704 284 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 ALG13-230ENST00000623189 458 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 AF067845.5-201ENST00000633906 437 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 AK9-201ENST00000285397 2566 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 DOCK7-218ENST00000635123 6297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 AC104446.1-201ENST00000613728 1321 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 AL627171.1-201ENST00000618845 1308 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 DDX18P3-201ENST00000404856 2007 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 NOL8P1-201ENST00000508336 3529 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 RMDN2-204ENST00000406384 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 ERBB4-203ENST00000402597 11699 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 MGA-207ENST00000566586 14439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 THOC1-221ENST00000631280 2011 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 PPBP-201ENST00000296028 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 RNU5E-10P-201ENST00000363506 118 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 RNU6-1339P-201ENST00000363574 91 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 DNASE2B-202ENST00000370665 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 RNU6-298P-201ENST00000390888 96 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 RNU6-932P-201ENST00000391108 106 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 SPRR2A-201ENST00000392653 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 OR6C4-201ENST00000394256 1046 ntAPPRIS P1 BASIC4.13□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 SFR1P2-201ENST00000421841 730 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 AL080313.1-201ENST00000434947 405 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 AL590867.3-201ENST00000436953 438 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 AC092170.1-201ENST00000440211 356 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 AC004854.1-201ENST00000440356 349 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 AP001432.1-201ENST00000440629 520 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 AC009263.1-201ENST00000441193 1239 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 HSFY3P-201ENST00000444242 1191 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 PLCE1-AS2-205ENST00000453183 427 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
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CDH18Q13634 AC010683.1-201ENST00000473673 378 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 UBA52P3-201ENST00000491303 382 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 GTF2IP9-201ENST00000502460 301 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 PGRMC2-203ENST00000503588 818 ntTSL 4 BASIC4.13□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 AC104108.1-201ENST00000509930 412 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 AC008494.2-201ENST00000514544 370 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 AC110760.3-202ENST00000515177 371 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 AC097535.1-201ENST00000515263 332 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 AF186190.1-201ENST00000517470 480 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 AC010376.1-201ENST00000522101 334 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 AP003733.3-201ENST00000524942 788 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 ATF7IP2-206ENST00000543967 998 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 AC090985.1-201ENST00000554440 480 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 MIR4512-201ENST00000583257 77 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 CXXC1P1-203ENST00000589302 746 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 PCNAP1-202ENST00000595299 752 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 AL592436.1-201ENST00000605135 558 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 AL355816.2-201ENST00000610049 647 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 RPS4Y1-201ENST00000250784 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 ENOX2-202ENST00000370927 3788 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 AL391684.1-201ENST00000416191 2998 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 AC004852.2-204ENST00000614137 1370 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 FAM35A-202ENST00000298786 3614 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 NSRP1P1-201ENST00000444067 1693 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 ASAH1-265ENST00000637922 2297 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 NCOA1-203ENST00000395856 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
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