Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 NDUFA5P12-201ENST00000503796 343 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
NEUROD1Q13562 MRPS33P2-201ENST00000507850 322 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
NEUROD1Q13562 AC027308.1-201ENST00000517993 110 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
NEUROD1Q13562 HIPK3-204ENST00000525975 3668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
NEUROD1Q13562 SDHAF2-208ENST00000543265 438 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
NEUROD1Q13562 LINC02311-202ENST00000556819 477 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
NEUROD1Q13562 AP005059.1-201ENST00000578391 456 ntTSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
NEUROD1Q13562 AC008738.1-201ENST00000590117 375 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
NEUROD1Q13562 BMS1P7-201ENST00000602440 1052 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
NEUROD1Q13562 AC055764.2-201ENST00000610089 670 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
NEUROD1Q13562 AP002799.1-201ENST00000623552 423 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
NEUROD1Q13562 BCLAF1P2-201ENST00000624956 2609 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
NEUROD1Q13562 WDR75-207ENST00000631047 270 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
NEUROD1Q13562 DARS-AS1-230ENST00000631306 530 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
NEUROD1Q13562 AC215522.3-201ENST00000635602 354 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
NEUROD1Q13562 MYOCOS-203ENST00000637303 564 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
NEUROD1Q13562 WISP3-211ENST00000639360 1026 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
NEUROD1Q13562 RGS13-204ENST00000543215 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
NEUROD1Q13562 EEF1A1P36-201ENST00000427807 1351 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
NEUROD1Q13562 SMAD4-202ENST00000398417 8495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
NEUROD1Q13562 FAM135A-210ENST00000505868 5173 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
NEUROD1Q13562 CNTN1-202ENST00000348761 3328 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
NEUROD1Q13562 AP002001.2-201ENST00000529025 1469 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
NEUROD1Q13562 RGS5-212ENST00000618415 5812 ntTSL 4 BASIC7.3□□□□□ -1.24
NEUROD1Q13562 CTAGE5-210ENST00000553728 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
NEUROD1Q13562 RNF145-201ENST00000274542 3364 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
NEUROD1Q13562 LRIT3-201ENST00000327908 3781 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
NEUROD1Q13562 GABPB1-204ENST00000396464 1401 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
NEUROD1Q13562 OR2AP1-201ENST00000321688 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
NEUROD1Q13562 RNA5SP123-201ENST00000363244 119 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
NEUROD1Q13562 Y_RNA.372-201ENST00000365599 102 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
NEUROD1Q13562 AL158837.1-201ENST00000417644 452 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
NEUROD1Q13562 CYP1B1-AS1-202ENST00000427168 484 ntTSL 4 BASIC7.3□□□□□ -1.24
NEUROD1Q13562 RBMY2QP-201ENST00000429799 1147 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
NEUROD1Q13562 AC092427.1-201ENST00000439177 601 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
NEUROD1Q13562 ANKRD30BP3-201ENST00000444850 1070 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
NEUROD1Q13562 AC114877.1-201ENST00000446601 582 ntTSL 4 BASIC7.3□□□□□ -1.24
NEUROD1Q13562 AC096554.1-201ENST00000458182 529 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
NEUROD1Q13562 ANK3-207ENST00000460468 677 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
NEUROD1Q13562 TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 488 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
NEUROD1Q13562 AC022272.1-201ENST00000503478 777 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
NEUROD1Q13562 AC025459.1-201ENST00000504072 156 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
NEUROD1Q13562 AC016933.1-201ENST00000504735 539 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
NEUROD1Q13562 RPL37-204ENST00000508493 553 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
NEUROD1Q13562 ATP1B1P1-201ENST00000509767 915 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
NEUROD1Q13562 COX6B1P5-201ENST00000509843 249 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
NEUROD1Q13562 AC008728.1-201ENST00000512730 691 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
NEUROD1Q13562 RN7SKP260-201ENST00000516907 149 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
NEUROD1Q13562 TBCA-203ENST00000517679 545 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
NEUROD1Q13562 AC139497.1-201ENST00000524042 501 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
NEUROD1Q13562 AC013509.1-201ENST00000524269 339 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
NEUROD1Q13562 AC068993.2-201ENST00000546563 395 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
NEUROD1Q13562 AC091534.1-202ENST00000549953 468 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
NEUROD1Q13562 NDUFB4P11-201ENST00000560510 395 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
NEUROD1Q13562 AC010761.5-201ENST00000579468 287 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
NEUROD1Q13562 AC005304.3-201ENST00000581533 511 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
NEUROD1Q13562 AL121989.1-201ENST00000585888 746 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
NEUROD1Q13562 AL157938.2-201ENST00000587264 894 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
NEUROD1Q13562 AC005498.1-201ENST00000592125 465 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
NEUROD1Q13562 OR7A8P-201ENST00000595427 913 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
NEUROD1Q13562 L34079.2-201ENST00000597119 561 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
NEUROD1Q13562 SEPT7P9-203ENST00000604116 343 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
NEUROD1Q13562 AC002553.4-201ENST00000616896 331 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
NEUROD1Q13562 AC015722.2-201ENST00000622210 551 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
NEUROD1Q13562 OR5T1-201ENST00000641368 1118 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
NEUROD1Q13562 SLC24A2-202ENST00000341998 10749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
NEUROD1Q13562 PDE4D-205ENST00000360047 3122 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
NEUROD1Q13562 KATNAL1-201ENST00000380615 7551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
NEUROD1Q13562 GTDC1-203ENST00000392867 2408 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
NEUROD1Q13562 VDAC3-201ENST00000022615 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
NEUROD1Q13562 SLCO1A2-212ENST00000458504 2008 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
NEUROD1Q13562 ZBED6-202ENST00000550078 12481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
NEUROD1Q13562 AC007342.5-201ENST00000571340 2142 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
NEUROD1Q13562 GRID2-208ENST00000611049 4844 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
NEUROD1Q13562 MUM1L1-202ENST00000357175 4173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
NEUROD1Q13562 Z94721.2-201ENST00000609590 5310 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
NEUROD1Q13562 AC092447.5-201ENST00000429367 2741 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
NEUROD1Q13562 PLCB1-211ENST00000617005 6458 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
NEUROD1Q13562 OR8H2-201ENST00000313503 3088 ntAPPRIS P2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
NEUROD1Q13562 ZNF468-203ENST00000595646 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
NEUROD1Q13562 RNMT-202ENST00000383314 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
NEUROD1Q13562 GPX8-203ENST00000503787 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
NEUROD1Q13562 LTN1-202ENST00000389194 7749 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
NEUROD1Q13562 NAMPT-202ENST00000354289 1213 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
NEUROD1Q13562 OR51A7-201ENST00000359350 1048 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
NEUROD1Q13562 KRTAP27-1-201ENST00000382835 682 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
NEUROD1Q13562 MIR105-2-201ENST00000385083 81 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
NEUROD1Q13562 NCSTNP1-201ENST00000406229 144 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
NEUROD1Q13562 METTL5-204ENST00000409340 472 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
NEUROD1Q13562 AF186996.5-201ENST00000418098 904 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
NEUROD1Q13562 AF228730.4-201ENST00000421457 183 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
NEUROD1Q13562 AL589986.2-201ENST00000429352 397 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
NEUROD1Q13562 AL354936.1-201ENST00000441521 649 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
NEUROD1Q13562 AC025428.1-201ENST00000444137 403 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
NEUROD1Q13562 EIF4EBP2P1-201ENST00000450009 343 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
NEUROD1Q13562 RPL5P24-201ENST00000463742 885 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
NEUROD1Q13562 RPS4XP15-201ENST00000489210 795 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
NEUROD1Q13562 CASP12-210ENST00000494737 961 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
NEUROD1Q13562 SLIT2-IT1-201ENST00000515882 601 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
NEUROD1Q13562 Y_RNA.701-201ENST00000516812 110 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.7 ms