Protein–RNA interactions for Protein: Q13492

PICALM, Phosphatidylinositol-binding clathrin assembly protein, humanhuman

Predictions only

Length 652 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PICALMQ13492 AL023881.1-201ENST00000621088 301 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
PICALMQ13492 FAM157B-203ENST00000639350 358 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
PICALMQ13492 SLC5A12-202ENST00000396005 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
PICALMQ13492 AL672167.1-204ENST00000641875 3017 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
PICALMQ13492 GPATCH2L-214ENST00000621494 12396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
PICALMQ13492 AL360270.1-201ENST00000440689 2359 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
PICALMQ13492 VIRMA-201ENST00000297591 6528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
PICALMQ13492 DYTN-201ENST00000452335 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
PICALMQ13492 ZNF876P-202ENST00000398732 1485 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
PICALMQ13492 CNTD1-205ENST00000588527 1308 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
PICALMQ13492 AK9-201ENST00000285397 2566 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
PICALMQ13492 PCDH9-203ENST00000456367 5072 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
PICALMQ13492 Z95327.2-201ENST00000414579 1873 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
PICALMQ13492 CENPE-202ENST00000380026 8241 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
PICALMQ13492 NXPH1-205ENST00000602349 1953 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
PICALMQ13492 PHACTR2P1-201ENST00000605639 1414 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
PICALMQ13492 OR56B2P-201ENST00000317102 954 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
PICALMQ13492 RNU6-251P-201ENST00000363235 104 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
PICALMQ13492 RNU5D-1-201ENST00000363299 116 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
PICALMQ13492 RNU1-83P-201ENST00000363426 164 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
PICALMQ13492 CARD6-202ENST00000381677 1094 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
PICALMQ13492 AL138749.1-201ENST00000397864 791 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
PICALMQ13492 AL583835.1-201ENST00000399570 407 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
PICALMQ13492 RN7SKP247-201ENST00000411094 308 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
PICALMQ13492 RPS24P7-201ENST00000416921 246 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
PICALMQ13492 RPS3AP9-201ENST00000417027 792 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
PICALMQ13492 AC073136.2-201ENST00000417282 849 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
PICALMQ13492 AC004448.2-201ENST00000422360 586 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
PICALMQ13492 GTF3AP5-201ENST00000442645 697 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
PICALMQ13492 TAB3-AS2-201ENST00000445240 292 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
PICALMQ13492 AC114755.5-201ENST00000447760 831 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
PICALMQ13492 LINC02032-201ENST00000490465 391 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
PICALMQ13492 AC091951.3-201ENST00000504093 246 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
PICALMQ13492 AC010255.1-201ENST00000504829 731 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
PICALMQ13492 AC087241.1-201ENST00000508615 429 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
PICALMQ13492 PLAC8-205ENST00000509973 489 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
PICALMQ13492 SLIT2-IT1-201ENST00000515882 601 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
PICALMQ13492 AP003730.1-201ENST00000524605 285 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
PICALMQ13492 PTP4A1P6-201ENST00000531034 478 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
PICALMQ13492 CYCSP28-201ENST00000534284 321 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
PICALMQ13492 AC005832.3-201ENST00000537929 631 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
PICALMQ13492 AC068643.2-201ENST00000547418 852 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
PICALMQ13492 AC009097.3-201ENST00000563557 1018 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
PICALMQ13492 MIR4458-201ENST00000578872 75 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
PICALMQ13492 PSMD5-AS1-203ENST00000589026 525 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
PICALMQ13492 AC010503.3-201ENST00000594355 540 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
PICALMQ13492 AC098617.1-216ENST00000602099 708 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
PICALMQ13492 GAS5-AS1-201ENST00000602767 694 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
PICALMQ13492 AC090181.2-201ENST00000602975 672 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
PICALMQ13492 AC025588.2-201ENST00000604851 466 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
PICALMQ13492 AC092954.1-201ENST00000609121 445 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
PICALMQ13492 AC092106.3-201ENST00000611308 722 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
PICALMQ13492 C1orf185-204ENST00000612209 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
PICALMQ13492 AC131238.1-201ENST00000617135 328 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
PICALMQ13492 AC008147.4-201ENST00000617570 1204 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
PICALMQ13492 AC009159.2-201ENST00000617603 606 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
PICALMQ13492 AP000676.4-201ENST00000624659 623 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
PICALMQ13492 AC140479.6-201ENST00000633535 357 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
PICALMQ13492 LINC01709-202ENST00000635702 1204 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
PICALMQ13492 ARHGAP21-218ENST00000636789 4210 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
PICALMQ13492 KLHL4-202ENST00000373119 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
PICALMQ13492 PTPN13-209ENST00000511467 8076 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
PICALMQ13492 PAPOLA-202ENST00000392990 2588 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
PICALMQ13492 FSBP-203ENST00000611249 2181 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
PICALMQ13492 LINC02432-202ENST00000509161 2839 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
PICALMQ13492 TRIM77-201ENST00000398290 1353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
PICALMQ13492 MAP3K19-203ENST00000375845 4369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
PICALMQ13492 UGT2B7-201ENST00000305231 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
PICALMQ13492 GMNC-201ENST00000442080 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
PICALMQ13492 C6-201ENST00000263413 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
PICALMQ13492 SCAF11-212ENST00000549162 3934 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
PICALMQ13492 SCN11A-202ENST00000444237 5729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
PICALMQ13492 CACNB4-233ENST00000636773 4143 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
PICALMQ13492 AC011978.2-201ENST00000569835 2054 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
PICALMQ13492 ATRX-202ENST00000395603 10218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
PICALMQ13492 WDR63-203ENST00000370596 2905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
PICALMQ13492 OR4F6-201ENST00000328882 1238 ntAPPRIS P1 BASIC5.25□□□□□ -1.57
PICALMQ13492 OR5K1-201ENST00000332650 1097 ntAPPRIS P1 BASIC5.25□□□□□ -1.57
PICALMQ13492 C11orf74-202ENST00000347206 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
PICALMQ13492 RNU6-1243P-201ENST00000364028 107 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
PICALMQ13492 SNORA57.1-201ENST00000391227 145 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
PICALMQ13492 RNA5SP80-201ENST00000410475 111 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
PICALMQ13492 AC096632.1-201ENST00000427395 310 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
PICALMQ13492 AC241644.1-201ENST00000431525 446 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
PICALMQ13492 TRAPPC2P9-201ENST00000434556 343 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
PICALMQ13492 AC002465.1-201ENST00000436097 349 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
PICALMQ13492 UBE2V1P3-201ENST00000439651 417 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
PICALMQ13492 TPTE2P3-201ENST00000441562 1189 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
PICALMQ13492 AP000146.1-202ENST00000441666 441 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
PICALMQ13492 AL162386.2-201ENST00000442428 457 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
PICALMQ13492 AL513412.1-201ENST00000445708 553 ntTSL 4 BASIC5.25□□□□□ -1.57
PICALMQ13492 AC108515.1-201ENST00000517407 525 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
PICALMQ13492 BAALC-AS1-205ENST00000521102 613 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
PICALMQ13492 AP000790.1-201ENST00000528891 737 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
PICALMQ13492 AC095350.2-201ENST00000544034 201 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
PICALMQ13492 AL132657.2-201ENST00000564417 358 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
PICALMQ13492 AC138915.2-201ENST00000569776 97 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
PICALMQ13492 AC133065.1-201ENST00000572017 575 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
PICALMQ13492 AC002094.2-201ENST00000577850 1121 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
PICALMQ13492 AC090371.2-203ENST00000578782 473 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 126.1 ms