Protein–RNA interactions for Protein: P49454

CENPF, Centromere protein F, humanhuman

Predictions only

Length 3,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPFP49454 GEN1-202ENST00000381254 6367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
CENPFP49454 AC005332.5-201ENST00000591222 2919 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CENPFP49454 AL158212.2-201ENST00000369391 460 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CENPFP49454 AC008154.2-201ENST00000420268 414 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CENPFP49454 C14orf105-204ENST00000526336 598 ntTSL 4 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CENPFP49454 ELOCP29-201ENST00000588193 334 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CENPFP49454 AP001043.1-201ENST00000626259 773 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CENPFP49454 DARS-AS1-230ENST00000631306 530 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CENPFP49454 ZNF382-201ENST00000292928 8329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
CENPFP49454 ZNF260-204ENST00000592282 5055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
CENPFP49454 TET2-202ENST00000305737 9233 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
CENPFP49454 CPS1-203ENST00000430249 5698 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
CENPFP49454 AL589684.1-201ENST00000445974 507 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CENPFP49454 NPM1P39-201ENST00000449818 867 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CENPFP49454 BTG4P1-201ENST00000510421 183 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CENPFP49454 AC131254.2-201ENST00000521908 550 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CENPFP49454 AC009271.1-202ENST00000588803 492 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CENPFP49454 AC064859.1-201ENST00000624741 174 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CENPFP49454 AC243829.7-201ENST00000633081 225 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CENPFP49454 AL732372.2-225ENST00000642124 456 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CENPFP49454 AL078595.2-201ENST00000605309 1780 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CENPFP49454 CCDC82-201ENST00000278520 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.84
CENPFP49454 DNAJC10-208ENST00000537515 1669 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
CENPFP49454 Z83839.2-201ENST00000436294 274 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.84
CENPFP49454 RPL7P47-201ENST00000497299 556 ntBASIC3.59□□□□□ -1.84
CENPFP49454 ORC3-202ENST00000392844 2512 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
CENPFP49454 BTG4-203ENST00000525791 1394 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
CENPFP49454 NMD3P1-201ENST00000439704 1488 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CENPFP49454 MTFR1-203ENST00000458689 2500 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
CENPFP49454 MRPL50P2-201ENST00000416821 482 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CENPFP49454 AC233981.1-201ENST00000423224 461 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CENPFP49454 VN1R48P-201ENST00000448149 1036 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CENPFP49454 HCG17-214ENST00000453558 732 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CENPFP49454 NPM1P17-201ENST00000479221 602 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CENPFP49454 USP9YP2-201ENST00000504503 1000 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CENPFP49454 USP9YP1-201ENST00000513521 1002 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CENPFP49454 AP002004.1-207ENST00000531371 526 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
CENPFP49454 UBTFL9-201ENST00000534504 1148 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CENPFP49454 AC015849.2-201ENST00000605738 409 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CENPFP49454 LINC00484-204ENST00000439438 454 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CENPFP49454 AL357552.1-201ENST00000445254 415 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CENPFP49454 AC009365.2-201ENST00000453078 799 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CENPFP49454 snoU13.23-201ENST00000458863 104 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CENPFP49454 AC133134.1-201ENST00000466800 359 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CENPFP49454 FCF1P3-201ENST00000496394 590 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CENPFP49454 AC092120.1-201ENST00000562211 420 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CENPFP49454 AL513302.2-201ENST00000562313 1842 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CENPFP49454 MTCO1P9-201ENST00000505577 1534 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CENPFP49454 C1orf105-201ENST00000367725 888 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CENPFP49454 CBX1P4-201ENST00000439415 457 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CENPFP49454 PRR16-203ENST00000446965 1152 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
CENPFP49454 AC117440.1-201ENST00000474107 571 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CENPFP49454 UBL5P3-201ENST00000475112 231 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CENPFP49454 LEKR1-206ENST00000483177 546 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CENPFP49454 SNHG1-205ENST00000537869 1038 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CENPFP49454 LINC00944-202ENST00000540684 888 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
CENPFP49454 AC099792.1-203ENST00000634701 2183 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CENPFP49454 ZBTB6-201ENST00000373659 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
CENPFP49454 AC092435.3-201ENST00000565538 3654 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CENPFP49454 TNRC6B-202ENST00000335727 17933 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
CENPFP49454 GTPBP10-201ENST00000222511 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
CENPFP49454 CNTN3-201ENST00000263665 4948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
CENPFP49454 SLC5A12-202ENST00000396005 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
CENPFP49454 SNORA70B-201ENST00000384210 135 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CENPFP49454 snoU13.15-201ENST00000459407 104 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CENPFP49454 RN7SL594P-201ENST00000470590 287 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CENPFP49454 AC026888.1-201ENST00000553348 559 ntTSL 4 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CENPFP49454 AC026462.2-201ENST00000565771 286 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CENPFP49454 LINC01255-206ENST00000591431 441 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CENPFP49454 AC241585.2-209ENST00000638217 143 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CENPFP49454 AC138409.2-201ENST00000514048 5001 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CENPFP49454 KIN-201ENST00000379562 6348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
CENPFP49454 MIR887-201ENST00000401258 79 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CENPFP49454 MYL8P-204ENST00000431574 518 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CENPFP49454 AC019227.1-201ENST00000526902 510 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CENPFP49454 AC012146.1-201ENST00000571138 462 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CENPFP49454 AL592295.2-201ENST00000612578 206 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CENPFP49454 uc_338.25-201ENST00000613756 156 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CENPFP49454 MEG8-222ENST00000637332 1237 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CENPFP49454 KC6-201ENST00000592302 1713 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
CENPFP49454 SYNJ2BP-201ENST00000256366 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
CENPFP49454 AC011124.1-201ENST00000521221 1762 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CENPFP49454 ZSCAN4-202ENST00000612521 1979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CENPFP49454 MEIS1-209ENST00000488550 5111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
CENPFP49454 LINC00301-201ENST00000320202 852 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CENPFP49454 AL354977.2-201ENST00000430387 728 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CENPFP49454 IFNA11P-201ENST00000446352 526 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CENPFP49454 LINC02283-201ENST00000511634 474 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CENPFP49454 AC034159.1-201ENST00000513885 583 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CENPFP49454 AC009812.2-201ENST00000517657 457 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CENPFP49454 LINC02055-204ENST00000521034 432 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CENPFP49454 MRPS35P3-201ENST00000603189 709 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CENPFP49454 OR6R2P-201ENST00000609216 300 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CENPFP49454 NSD1-204ENST00000439151 12892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
CENPFP49454 DDR2-202ENST00000367922 10160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
CENPFP49454 AC097504.1-201ENST00000515103 2415 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CENPFP49454 PLCL1-203ENST00000437704 5979 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
CENPFP49454 AL354766.2-201ENST00000414085 423 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CENPFP49454 RPL7P12-201ENST00000446719 750 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CENPFP49454 snoU13.26-201ENST00000459452 105 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.9 ms