Protein–RNA interactions for Protein: V9GYD0

ARL2-SNX15, ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15V9GYD0 RICTOR-201ENST00000296782 7505 ntTSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
ARL2-SNX15V9GYD0 APC-201ENST00000257430 10701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
ARL2-SNX15V9GYD0 GRAMD1C-202ENST00000440446 3475 ntTSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
ARL2-SNX15V9GYD0 FILIP1L-206ENST00000471562 2854 ntTSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
ARL2-SNX15V9GYD0 GMFB-208ENST00000554908 6721 ntTSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
ARL2-SNX15V9GYD0 CHD9-203ENST00000447540 11509 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
ARL2-SNX15V9GYD0 SCN1A-219ENST00000641575 12874 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.6□□□□□ -1.99
ARL2-SNX15V9GYD0 PRIM2-202ENST00000370687 909 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
ARL2-SNX15V9GYD0 CARD6-202ENST00000381677 1094 ntTSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
ARL2-SNX15V9GYD0 SNORA46-201ENST00000384762 135 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
ARL2-SNX15V9GYD0 MIR30B-201ENST00000384850 88 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
ARL2-SNX15V9GYD0 PDC-201ENST00000391997 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
ARL2-SNX15V9GYD0 RPL5P19-201ENST00000404228 893 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
ARL2-SNX15V9GYD0 RNA5SP317-201ENST00000410176 116 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
ARL2-SNX15V9GYD0 RNA5SP311-201ENST00000411290 116 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
ARL2-SNX15V9GYD0 AL024509.3-201ENST00000413898 745 ntTSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
ARL2-SNX15V9GYD0 RPL26P29-201ENST00000415623 438 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
ARL2-SNX15V9GYD0 AC079790.1-201ENST00000420365 507 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
ARL2-SNX15V9GYD0 AL589765.2-201ENST00000420382 424 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
ARL2-SNX15V9GYD0 AL513365.2-201ENST00000423060 529 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
ARL2-SNX15V9GYD0 TRIAP1P1-201ENST00000427062 225 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
ARL2-SNX15V9GYD0 OR2B8P-201ENST00000432841 938 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
ARL2-SNX15V9GYD0 AL353613.1-201ENST00000443163 530 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
ARL2-SNX15V9GYD0 AC115115.1-201ENST00000449927 248 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
ARL2-SNX15V9GYD0 AL138737.1-201ENST00000456896 1252 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
ARL2-SNX15V9GYD0 RPS20P21-201ENST00000466859 343 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
ARL2-SNX15V9GYD0 AC108860.1-201ENST00000484521 383 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
ARL2-SNX15V9GYD0 TPT1P3-201ENST00000492841 512 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
ARL2-SNX15V9GYD0 RN7SKP34-201ENST00000516142 244 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
ARL2-SNX15V9GYD0 RNA5SP315-201ENST00000516340 116 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
ARL2-SNX15V9GYD0 RNA5SP312-201ENST00000517068 116 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC01030-201ENST00000517505 738 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
ARL2-SNX15V9GYD0 AC034205.1-201ENST00000520621 638 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
ARL2-SNX15V9GYD0 OR56A5-202ENST00000532411 942 ntAPPRIS P1 BASIC2.6□□□□□ -1.99
ARL2-SNX15V9GYD0 OR8X1P-201ENST00000534542 869 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
ARL2-SNX15V9GYD0 AC007424.1-205ENST00000552615 579 ntTSL 4 BASIC2.6□□□□□ -1.99
ARL2-SNX15V9GYD0 AL445363.2-202ENST00000555361 435 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
ARL2-SNX15V9GYD0 AL161804.1-201ENST00000555600 708 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
ARL2-SNX15V9GYD0 AC051619.2-201ENST00000559063 397 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC2194-201ENST00000567127 454 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
ARL2-SNX15V9GYD0 AC099793.1-201ENST00000567538 285 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
ARL2-SNX15V9GYD0 AC007493.1-202ENST00000567899 517 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
ARL2-SNX15V9GYD0 AL591516.1-201ENST00000611326 274 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
ARL2-SNX15V9GYD0 C8orf89-201ENST00000613105 495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
ARL2-SNX15V9GYD0 MLECP1-201ENST00000615893 709 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
ARL2-SNX15V9GYD0 TMEM212-205ENST00000619900 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
ARL2-SNX15V9GYD0 AL356490.1-201ENST00000623079 479 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
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ARL2-SNX15V9GYD0 POSTN-203ENST00000379747 3373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
ARL2-SNX15V9GYD0 NR3C1-212ENST00000504572 3389 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
ARL2-SNX15V9GYD0 RNMT-203ENST00000543302 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
ARL2-SNX15V9GYD0 CCDC30-212ENST00000507855 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC00690-201ENST00000429949 1365 ntTSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
ARL2-SNX15V9GYD0 AL353743.1-202ENST00000431724 1695 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
ARL2-SNX15V9GYD0 OR6C2-203ENST00000641516 1682 ntAPPRIS P1 BASIC2.6□□□□□ -1.99
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ARL2-SNX15V9GYD0 OR4S2-202ENST00000641692 2211 ntAPPRIS P1 BASIC2.59□□□□□ -1.99
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ARL2-SNX15V9GYD0 FAM222A-AS1-202ENST00000541460 751 ntTSL 4 BASIC2.59□□□□□ -1.99
ARL2-SNX15V9GYD0 AC023034.1-202ENST00000558153 684 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
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ARL2-SNX15V9GYD0 ZRANB2-AS2-213ENST00000591654 719 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
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ARL2-SNX15V9GYD0 AC005962.2-201ENST00000611427 652 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
ARL2-SNX15V9GYD0 MIR6716-201ENST00000613413 80 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
ARL2-SNX15V9GYD0 RDM1-221ENST00000617591 432 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
ARL2-SNX15V9GYD0 ZRANB2-AS2-221ENST00000624050 629 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
ARL2-SNX15V9GYD0 AC073172.1-201ENST00000636967 851 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
ARL2-SNX15V9GYD0 AC009452.1-201ENST00000640823 606 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
ARL2-SNX15V9GYD0 C9orf153-204ENST00000613665 1738 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.59□□□□□ -2
ARL2-SNX15V9GYD0 PKN2-AS1-202ENST00000458097 3542 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -2
ARL2-SNX15V9GYD0 FGF14-201ENST00000376131 12882 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
ARL2-SNX15V9GYD0 DOCK7-204ENST00000454575 6985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
ARL2-SNX15V9GYD0 KCNRG-201ENST00000312942 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
ARL2-SNX15V9GYD0 AL353743.4-201ENST00000422653 1547 ntBASIC2.58□□□□□ -2
ARL2-SNX15V9GYD0 EVI2A-202ENST00000461237 1540 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC2.58□□□□□ -2
ARL2-SNX15V9GYD0 SPRR2C-201ENST00000290702 219 ntBASIC2.58□□□□□ -2
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