Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

Predictions only

Length 750 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 ATP5F1P4-201ENST00000397288 746 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CCDC142Q17RM4 NCSTNP1-201ENST00000406229 144 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CCDC142Q17RM4 RPS16P5-201ENST00000406501 404 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CCDC142Q17RM4 AL590084.1-201ENST00000407885 387 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CCDC142Q17RM4 AC004014.1-201ENST00000413406 538 ntTSL 4 BASIC5.03□□□□□ -1.6
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CCDC142Q17RM4 RPS27AP7-201ENST00000422792 455 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
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CCDC142Q17RM4 H2AFZP6-201ENST00000444403 394 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
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CCDC142Q17RM4 AL138830.2-202ENST00000446358 786 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
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CCDC142Q17RM4 AP001596.1-202ENST00000452460 644 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
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CCDC142Q17RM4 AL034349.1-201ENST00000458367 549 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CCDC142Q17RM4 LINC00888-204ENST00000487386 421 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CCDC142Q17RM4 FCF1P3-201ENST00000496394 590 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CCDC142Q17RM4 RPL37P25-201ENST00000507308 276 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
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CCDC142Q17RM4 AC008574.1-201ENST00000514240 433 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
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CCDC142Q17RM4 AP002812.2-201ENST00000525594 585 ntTSL 4 BASIC5.03□□□□□ -1.6
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CCDC142Q17RM4 LINC00301-204ENST00000532591 470 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CCDC142Q17RM4 AP000916.1-201ENST00000533869 835 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CCDC142Q17RM4 AC109462.2-201ENST00000558730 763 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
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CCDC142Q17RM4 LINC02562-201ENST00000561705 785 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
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CCDC142Q17RM4 MTND1P32-201ENST00000433043 938 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CCDC142Q17RM4 AL359265.2-201ENST00000434367 631 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CCDC142Q17RM4 AC000041.1-201ENST00000439655 175 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CCDC142Q17RM4 TDGF1P1-201ENST00000445734 527 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CCDC142Q17RM4 SPANXN4-202ENST00000446864 431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
CCDC142Q17RM4 TMSB4X-204ENST00000451311 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
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CCDC142Q17RM4 CYCSP34-201ENST00000458172 304 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
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CCDC142Q17RM4 AC004069.2-201ENST00000505438 1114 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CCDC142Q17RM4 AC111000.3-201ENST00000508057 576 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CCDC142Q17RM4 AC091180.4-201ENST00000511322 245 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
CCDC142Q17RM4 AC016550.2-202ENST00000511940 581 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
CCDC142Q17RM4 AC074344.1-201ENST00000512823 224 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CCDC142Q17RM4 AC093879.2-201ENST00000513645 427 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
CCDC142Q17RM4 PRELID3BP4-201ENST00000515476 571 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CCDC142Q17RM4 OR4V1P-201ENST00000525394 1140 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
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