Protein–RNA interactions for Protein: Q14938

NFIX, Nuclear factor 1 X-type, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIXQ14938 AC003092.1-202ENST00000438538 743 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
NFIXQ14938 H2AFZP5-201ENST00000446960 382 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
NFIXQ14938 AC091770.1-201ENST00000456513 373 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
NFIXQ14938 FPGT-203ENST00000467578 601 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
NFIXQ14938 RPL21P126-201ENST00000470049 478 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
NFIXQ14938 AP000852.1-201ENST00000472460 573 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
NFIXQ14938 FAM104B-204ENST00000472571 1109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
NFIXQ14938 AC098583.1-201ENST00000480875 255 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
NFIXQ14938 Y_RNA.701-201ENST00000516812 110 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
NFIXQ14938 Y_RNA.719-201ENST00000517156 106 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
NFIXQ14938 CARD16-203ENST00000525374 503 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
NFIXQ14938 MIR100HG-221ENST00000534297 572 ntTSL 4 BASIC5.91□□□□□ -1.46
NFIXQ14938 AC008126.1-201ENST00000549019 480 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
NFIXQ14938 CASC16-202ENST00000563844 610 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
NFIXQ14938 AC106785.1-201ENST00000565935 262 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
NFIXQ14938 AC022662.1-201ENST00000580252 331 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
NFIXQ14938 AC011477.5-201ENST00000586571 259 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
NFIXQ14938 AL157786.1-204ENST00000594870 506 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
NFIXQ14938 AC092316.1-201ENST00000598703 297 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
NFIXQ14938 AC020910.1-201ENST00000599404 413 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
NFIXQ14938 AL390208.1-201ENST00000605885 644 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
NFIXQ14938 AC005021.1-201ENST00000608730 355 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
NFIXQ14938 OR8G7P-201ENST00000616658 848 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
NFIXQ14938 AL445567.2-201ENST00000618935 498 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
NFIXQ14938 USP12-203ENST00000620323 349 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
NFIXQ14938 AP005019.3-201ENST00000620418 560 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
NFIXQ14938 SEC23A-215ENST00000625395 261 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
NFIXQ14938 U3.53-201ENST00000628922 216 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
NFIXQ14938 AC104118.1-201ENST00000607625 1589 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
NFIXQ14938 NME8-203ENST00000440017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
NFIXQ14938 AFF2-201ENST00000286437 12280 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
NFIXQ14938 LINC01844-201ENST00000432677 2237 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
NFIXQ14938 FAM111B-206ENST00000620384 3405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
NFIXQ14938 ZNF93-201ENST00000343769 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
NFIXQ14938 FRMD6-205ENST00000554167 4176 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
NFIXQ14938 PEX5L-202ENST00000392649 8540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
NFIXQ14938 AC087359.1-201ENST00000508335 1740 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
NFIXQ14938 ETV1-208ENST00000420159 6231 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
NFIXQ14938 AP001267.1-201ENST00000531742 2074 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
NFIXQ14938 LINC02355-201ENST00000503100 2520 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
NFIXQ14938 KMT5B-215ENST00000615954 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
NFIXQ14938 AC064875.1-201ENST00000425974 1942 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
NFIXQ14938 KCNJ16-204ENST00000585558 4014 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
NFIXQ14938 EDA2R-203ENST00000396050 3429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
NFIXQ14938 PFKFB2-202ENST00000367080 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
NFIXQ14938 DNAH8-201ENST00000327475 14360 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
NFIXQ14938 EDDM3A-201ENST00000326842 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
NFIXQ14938 OR5AK2-201ENST00000326855 996 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
NFIXQ14938 OR6C70-201ENST00000327335 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
NFIXQ14938 OR51A7-201ENST00000359350 1048 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
NFIXQ14938 C1orf105-203ENST00000367727 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
NFIXQ14938 APOA2-201ENST00000367990 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
NFIXQ14938 AL034376.1-201ENST00000380106 484 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
NFIXQ14938 CARD6-202ENST00000381677 1094 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
NFIXQ14938 Y_RNA.578-201ENST00000390903 88 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
NFIXQ14938 AC025750.1-201ENST00000399891 379 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
NFIXQ14938 RN7SKP16-201ENST00000410180 299 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
NFIXQ14938 GPS2P1-201ENST00000411761 986 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
NFIXQ14938 AC009237.5-201ENST00000414271 501 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
NFIXQ14938 AC104389.1-201ENST00000418080 522 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
NFIXQ14938 BTF3L4P3-201ENST00000418879 476 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
NFIXQ14938 AL354941.1-201ENST00000438600 464 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
NFIXQ14938 PTGES3P1-201ENST00000439531 483 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
NFIXQ14938 AL162419.1-201ENST00000440674 873 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
NFIXQ14938 AL360089.1-201ENST00000442260 436 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
NFIXQ14938 AL139120.1-201ENST00000443652 358 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
NFIXQ14938 NFU1P2-201ENST00000448700 469 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
NFIXQ14938 RN7SL303P-201ENST00000469773 251 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
NFIXQ14938 RPS4XP6-201ENST00000477670 797 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
NFIXQ14938 RPL7P42-201ENST00000481005 679 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
NFIXQ14938 RPL21P47-201ENST00000483696 477 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
NFIXQ14938 AC084024.2-201ENST00000503480 791 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
NFIXQ14938 AC016559.2-201ENST00000510759 359 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
NFIXQ14938 AC092440.1-201ENST00000512563 571 ntTSL 4 BASIC5.9□□□□□ -1.46
NFIXQ14938 AC005150.1-201ENST00000512831 628 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
NFIXQ14938 IGLVIV-65-201ENST00000517313 360 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
NFIXQ14938 RBPMS-207ENST00000519647 780 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
NFIXQ14938 AP002812.2-201ENST00000525594 585 ntTSL 4 BASIC5.9□□□□□ -1.46
NFIXQ14938 AC022509.2-201ENST00000540392 699 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
NFIXQ14938 VDAC1P8-204ENST00000589489 997 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
NFIXQ14938 AC008946.1-201ENST00000599756 421 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
NFIXQ14938 BNIP3P9-201ENST00000603714 553 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
NFIXQ14938 ARF4P1-201ENST00000605447 541 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
NFIXQ14938 ZYXP1-201ENST00000617638 118 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
NFIXQ14938 AP000843.1-201ENST00000624880 701 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
NFIXQ14938 AC215522.3-201ENST00000635602 354 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
NFIXQ14938 AC024614.3-201ENST00000637860 256 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
NFIXQ14938 VCAN-203ENST00000343200 9455 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
NFIXQ14938 AC245100.2-201ENST00000454544 1679 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
NFIXQ14938 NLRP11-202ENST00000589824 3231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
NFIXQ14938 RGSL1-201ENST00000294854 3696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
NFIXQ14938 SLC10A7-203ENST00000432059 3747 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
NFIXQ14938 KCNC4-201ENST00000369787 18750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
NFIXQ14938 AC004817.4-201ENST00000602396 3625 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
NFIXQ14938 SGIP1-203ENST00000371037 7768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
NFIXQ14938 SOCS5P3-201ENST00000425115 1576 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
NFIXQ14938 EDA2R-202ENST00000374719 3418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
NFIXQ14938 LINC02060-201ENST00000506041 1626 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
NFIXQ14938 CACNB4-221ENST00000636130 7748 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
NFIXQ14938 AADAT-202ENST00000353187 2101 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.1 ms