Protein–RNA interactions for Protein: Q13424

SNTA1, Alpha-1-syntrophin, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTA1Q13424 C12orf45-204ENST00000552951 23529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
SNTA1Q13424 TPRG1-201ENST00000345063 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
SNTA1Q13424 AL390862.1-201ENST00000635467 1469 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SNTA1Q13424 PLCB1-233ENST00000637919 5074 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
SNTA1Q13424 FANCI-202ENST00000310775 4743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
SNTA1Q13424 ADGRL3-215ENST00000512091 12636 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
SNTA1Q13424 RAG2-209ENST00000618712 2818 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.26□□□□□ -1.73
SNTA1Q13424 MARCH1-201ENST00000274056 5367 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.26□□□□□ -1.73
SNTA1Q13424 RNU1-20P-201ENST00000363314 162 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SNTA1Q13424 SNORD113.2-201ENST00000364166 89 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SNTA1Q13424 PMS1-202ENST00000374826 948 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
SNTA1Q13424 Y_RNA.465-201ENST00000384293 102 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SNTA1Q13424 AL049697.2-201ENST00000403708 294 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SNTA1Q13424 AL049765.1-201ENST00000416237 573 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
SNTA1Q13424 AC119751.6-201ENST00000416712 186 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SNTA1Q13424 TRGV6-201ENST00000417928 299 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SNTA1Q13424 AC019050.1-201ENST00000418508 492 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SNTA1Q13424 AC245028.1-201ENST00000423259 256 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SNTA1Q13424 ARL6IP1P2-201ENST00000431356 563 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SNTA1Q13424 AL157359.2-201ENST00000440372 784 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
SNTA1Q13424 TRIM31-AS1-204ENST00000440874 549 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
SNTA1Q13424 AC009263.1-201ENST00000441193 1239 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SNTA1Q13424 RPL23AP76-201ENST00000441860 458 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SNTA1Q13424 HMGB1P48-201ENST00000446155 598 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SNTA1Q13424 AL357514.1-201ENST00000446322 488 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
SNTA1Q13424 LINC01813-201ENST00000451034 712 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
SNTA1Q13424 RPS27AP8-201ENST00000452665 445 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SNTA1Q13424 AC073387.1-201ENST00000453261 709 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SNTA1Q13424 AL391704.1-202ENST00000453889 874 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
SNTA1Q13424 ASH1L-IT1-201ENST00000458371 448 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
SNTA1Q13424 RN7SL41P-201ENST00000476144 297 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SNTA1Q13424 RPS3AP43-201ENST00000479743 781 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SNTA1Q13424 OR2A20P-203ENST00000498397 1268 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SNTA1Q13424 RPF2P2-201ENST00000504693 896 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SNTA1Q13424 AC021146.8-201ENST00000507455 733 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SNTA1Q13424 RNU6-759P-201ENST00000516740 103 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SNTA1Q13424 AC087855.1-201ENST00000518178 430 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
SNTA1Q13424 AC120193.1-201ENST00000518988 741 ntTSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
SNTA1Q13424 IGHVIII-38-1-201ENST00000521454 282 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SNTA1Q13424 AC090819.1-201ENST00000523800 1111 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SNTA1Q13424 AP003400.1-201ENST00000528319 231 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
SNTA1Q13424 NAV2-AS3-201ENST00000534036 598 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
SNTA1Q13424 LINC01493-203ENST00000534756 509 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
SNTA1Q13424 AC093012.1-203ENST00000548437 450 ntTSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
SNTA1Q13424 AC068875.1-201ENST00000561054 463 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
SNTA1Q13424 AC138305.2-201ENST00000561595 556 ntTSL 4 BASIC4.26□□□□□ -1.73
SNTA1Q13424 AC009142.1-202ENST00000562565 563 ntTSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
SNTA1Q13424 AC100872.1-201ENST00000577765 501 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
SNTA1Q13424 MIR4700-201ENST00000578311 74 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SNTA1Q13424 AL133338.2-201ENST00000604292 736 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SNTA1Q13424 AC019193.2-201ENST00000610012 634 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SNTA1Q13424 AC116447.1-201ENST00000613153 453 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SNTA1Q13424 AC145207.9-201ENST00000623802 325 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SNTA1Q13424 U3.53-201ENST00000628922 216 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SNTA1Q13424 AF001550.2-201ENST00000636643 217 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SNTA1Q13424 MNDA-201ENST00000368141 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
SNTA1Q13424 POSTN-210ENST00000541481 3113 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
SNTA1Q13424 AL049737.1-201ENST00000413920 1403 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SNTA1Q13424 AC021755.1-201ENST00000559747 1447 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SNTA1Q13424 RASGRP1-209ENST00000559830 1910 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
SNTA1Q13424 NR3C1-206ENST00000424646 4591 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
SNTA1Q13424 ATP2C1-212ENST00000507488 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
SNTA1Q13424 AL445437.1-201ENST00000623157 3087 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SNTA1Q13424 PSG6-202ENST00000292125 1391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
SNTA1Q13424 ASAH2-201ENST00000329428 2184 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
SNTA1Q13424 KCNRG-201ENST00000312942 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
SNTA1Q13424 ALG14-201ENST00000370205 9367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
SNTA1Q13424 VPS13C-202ENST00000261517 13400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
SNTA1Q13424 AC100871.1-201ENST00000507871 1456 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
SNTA1Q13424 RBMS1-202ENST00000392753 3781 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
SNTA1Q13424 AC009229.4-201ENST00000623854 1947 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
SNTA1Q13424 AL133412.1-201ENST00000380194 2992 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
SNTA1Q13424 LRIT3-202ENST00000594814 3566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
SNTA1Q13424 ATG12-208ENST00000509910 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
SNTA1Q13424 CFHR1-201ENST00000320493 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
SNTA1Q13424 RNF133-201ENST00000340112 1445 ntAPPRIS P1 BASIC4.25□□□□□ -1.73
SNTA1Q13424 CXADR-205ENST00000400169 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
SNTA1Q13424 AL080315.1-201ENST00000406055 466 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
SNTA1Q13424 RNU6-77P-201ENST00000410554 91 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
SNTA1Q13424 RN7SKP106-201ENST00000410832 272 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
SNTA1Q13424 AC004552.1-201ENST00000419089 348 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
SNTA1Q13424 AL365203.2-201ENST00000423444 196 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
SNTA1Q13424 SMG1P1-206ENST00000431681 2913 ntTSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
SNTA1Q13424 ZMYM4-AS1-201ENST00000432683 459 ntTSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
SNTA1Q13424 LINC01680-201ENST00000434983 299 ntTSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
SNTA1Q13424 DIAPH3-AS1-203ENST00000435636 467 ntTSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
SNTA1Q13424 AC023669.2-201ENST00000436266 239 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
SNTA1Q13424 AC019330.1-202ENST00000440609 504 ntTSL 4 BASIC4.25□□□□□ -1.73
SNTA1Q13424 ELOCP10-201ENST00000440624 327 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
SNTA1Q13424 AC093639.1-201ENST00000441026 473 ntTSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
SNTA1Q13424 AC118469.1-201ENST00000442943 488 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
SNTA1Q13424 LINC00363-201ENST00000443228 210 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
SNTA1Q13424 AL451164.2-201ENST00000445932 597 ntTSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
SNTA1Q13424 AC104306.1-201ENST00000449702 371 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
SNTA1Q13424 AC079776.3-201ENST00000450665 370 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
SNTA1Q13424 LINC01825-201ENST00000452381 850 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
SNTA1Q13424 LINC01150-201ENST00000455671 315 ntTSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
SNTA1Q13424 AC123023.1-201ENST00000455974 555 ntTSL 4 BASIC4.25□□□□□ -1.73
SNTA1Q13424 PDCD10-206ENST00000470131 1026 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
SNTA1Q13424 RPS26P3-201ENST00000470205 348 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 150.2 ms