Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 OR56B2P-201ENST00000317102 954 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CHAF1AQ13111 AC004057.1-202ENST00000356247 284 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CHAF1AQ13111 OR5AC2-201ENST00000358642 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CHAF1AQ13111 POLR1D-202ENST00000399696 668 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CHAF1AQ13111 SFR1P1-201ENST00000403720 688 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CHAF1AQ13111 LIPN-201ENST00000404459 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
CHAF1AQ13111 FCF1P5-201ENST00000406490 482 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CHAF1AQ13111 MTATP6P20-201ENST00000414147 562 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CHAF1AQ13111 RPL23AP38-201ENST00000423801 469 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CHAF1AQ13111 RPL30P3-201ENST00000424262 333 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CHAF1AQ13111 GRM7-AS3-203ENST00000424366 486 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CHAF1AQ13111 AC006333.1-202ENST00000440504 555 ntTSL 4 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CHAF1AQ13111 AL162419.1-201ENST00000440674 873 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
CHAF1AQ13111 BMS1P22-202ENST00000440946 1160 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
CHAF1AQ13111 HRAT17-201ENST00000447785 547 ntTSL 4 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CHAF1AQ13111 HMGB3P21-201ENST00000452483 547 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CHAF1AQ13111 MRPL42P4-201ENST00000453267 443 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CHAF1AQ13111 AC010469.1-201ENST00000463864 576 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CHAF1AQ13111 AC012158.1-204ENST00000483430 465 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CHAF1AQ13111 AL365273.2-201ENST00000491114 492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CHAF1AQ13111 AC113420.1-201ENST00000507903 571 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CHAF1AQ13111 AC109464.3-201ENST00000509456 204 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CHAF1AQ13111 AC110760.3-202ENST00000515177 371 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CHAF1AQ13111 AC015771.1-201ENST00000527283 554 ntTSL 4 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CHAF1AQ13111 AC055878.1-201ENST00000531858 281 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CHAF1AQ13111 AP000462.1-201ENST00000535704 818 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CHAF1AQ13111 AC095350.2-201ENST00000544034 201 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CHAF1AQ13111 AC025265.1-201ENST00000551299 497 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CHAF1AQ13111 FOPNL-208ENST00000575744 565 ntTSL 4 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CHAF1AQ13111 AC090181.2-201ENST00000602975 672 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CHAF1AQ13111 AL592148.2-201ENST00000612210 372 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CHAF1AQ13111 AC010975.3-201ENST00000618727 978 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CHAF1AQ13111 AL023881.1-201ENST00000621088 301 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CHAF1AQ13111 AP001002.2-201ENST00000625137 386 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CHAF1AQ13111 AC087821.2-201ENST00000637086 450 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CHAF1AQ13111 CNTD1-205ENST00000588527 1308 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CHAF1AQ13111 MUC15-204ENST00000527569 1386 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
CHAF1AQ13111 AL158163.1-201ENST00000603915 1649 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CHAF1AQ13111 NT5C3A-203ENST00000396152 1788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
CHAF1AQ13111 LGI1-228ENST00000637689 1802 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CHAF1AQ13111 OR4S2-202ENST00000641692 2211 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CHAF1AQ13111 LINC02432-202ENST00000509161 2839 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CHAF1AQ13111 PCDH11X-206ENST00000373097 9146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
CHAF1AQ13111 PATJ-202ENST00000316485 3657 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CHAF1AQ13111 NFIB-211ENST00000606230 2311 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CHAF1AQ13111 SLC35A1-201ENST00000369552 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
CHAF1AQ13111 MNDA-201ENST00000368141 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
CHAF1AQ13111 POU1F1-202ENST00000350375 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
CHAF1AQ13111 IL23R-202ENST00000395227 1459 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CHAF1AQ13111 RMDN2-207ENST00000417700 1426 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
CHAF1AQ13111 TAS2R3-201ENST00000247879 1101 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CHAF1AQ13111 OR5K1-201ENST00000332650 1097 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CHAF1AQ13111 MIR383-201ENST00000362257 73 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CHAF1AQ13111 CARD6-202ENST00000381677 1094 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
CHAF1AQ13111 RPS26P8-201ENST00000393490 348 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CHAF1AQ13111 AL079342.2-201ENST00000403367 482 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CHAF1AQ13111 SNX10-203ENST00000409367 746 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CHAF1AQ13111 RN7SKP263-201ENST00000411194 309 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CHAF1AQ13111 AL133480.1-201ENST00000411561 638 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CHAF1AQ13111 AL160275.2-201ENST00000412010 394 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CHAF1AQ13111 AC004022.2-201ENST00000413824 193 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CHAF1AQ13111 AC073641.1-201ENST00000425192 429 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CHAF1AQ13111 MOBP-206ENST00000428261 561 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CHAF1AQ13111 AP000695.2-201ENST00000428667 715 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CHAF1AQ13111 AL645634.2-201ENST00000431956 411 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CHAF1AQ13111 AC002378.1-201ENST00000432360 298 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CHAF1AQ13111 AC105402.2-201ENST00000438503 358 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CHAF1AQ13111 UBE2V1P3-201ENST00000439651 417 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CHAF1AQ13111 AL139230.1-201ENST00000440094 425 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CHAF1AQ13111 RPL23AP15-201ENST00000450202 459 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CHAF1AQ13111 AC004872.1-201ENST00000456062 469 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CHAF1AQ13111 AC078883.3-201ENST00000458314 512 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CHAF1AQ13111 RPL21P71-201ENST00000465598 459 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CHAF1AQ13111 AC016687.2-201ENST00000504795 541 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CHAF1AQ13111 LINC02428-201ENST00000508099 527 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CHAF1AQ13111 RNU6-488P-201ENST00000515918 99 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CHAF1AQ13111 MTND2P32-201ENST00000521584 1038 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CHAF1AQ13111 AC022790.1-201ENST00000522872 204 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CHAF1AQ13111 AP003730.1-201ENST00000524605 285 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CHAF1AQ13111 AC004801.3-201ENST00000547602 962 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
CHAF1AQ13111 LINC02326-201ENST00000552028 540 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CHAF1AQ13111 AC074029.1-201ENST00000552531 1044 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CHAF1AQ13111 AC091178.1-203ENST00000584586 279 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CHAF1AQ13111 AP005230.1-201ENST00000585072 675 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CHAF1AQ13111 DTNA-232ENST00000599844 853 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
CHAF1AQ13111 AL020997.3-201ENST00000602843 359 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CHAF1AQ13111 AP005137.2-201ENST00000609238 400 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CHAF1AQ13111 AC015813.4-201ENST00000610469 179 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CHAF1AQ13111 YWHAEP7-201ENST00000617508 639 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CHAF1AQ13111 KBTBD2-208ENST00000621876 1196 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CHAF1AQ13111 AC140479.6-201ENST00000633535 357 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CHAF1AQ13111 AF067845.5-201ENST00000633906 437 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CHAF1AQ13111 LINC01709-202ENST00000635702 1204 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CHAF1AQ13111 RBBP6-203ENST00000381039 3384 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
CHAF1AQ13111 PRKACB-208ENST00000394839 4200 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CHAF1AQ13111 ARHGAP21-218ENST00000636789 4210 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CHAF1AQ13111 EMSY-207ENST00000525919 4074 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
CHAF1AQ13111 LINC01102-204ENST00000451400 3778 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CHAF1AQ13111 PARP15-206ENST00000493645 1311 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
CHAF1AQ13111 CFHR1-202ENST00000367424 1070 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
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