Protein–RNA interactions for Protein: Q13085

ACACA, Acetyl-CoA carboxylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACACAQ13085 RPS29P31-201ENST00000446147 164 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
ACACAQ13085 AC010374.2-201ENST00000512933 535 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
ACACAQ13085 LINC02112-202ENST00000512976 464 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
ACACAQ13085 AC124242.1-205ENST00000517798 646 ntTSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
ACACAQ13085 IGLV3-26-201ENST00000520756 302 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
ACACAQ13085 AP002404.1-201ENST00000532005 451 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
ACACAQ13085 AC138965.3-201ENST00000623875 498 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
ACACAQ13085 AC003985.2-201ENST00000562268 1669 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
ACACAQ13085 ABCA6-206ENST00000590645 1511 ntTSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
ACACAQ13085 EPS8-207ENST00000540613 2204 ntTSL 2 BASIC3.12□□□□□ -1.91
ACACAQ13085 KNTC1-204ENST00000436959 2412 ntTSL 2 BASIC3.12□□□□□ -1.91
ACACAQ13085 AC018529.3-201ENST00000624212 2254 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
ACACAQ13085 STAU2-201ENST00000355780 4061 ntTSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
ACACAQ13085 DPP10-AS3-201ENST00000417844 665 ntTSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
ACACAQ13085 AC087857.1-201ENST00000425894 467 ntTSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
ACACAQ13085 Z93242.1-201ENST00000427102 353 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
ACACAQ13085 TEX41-209ENST00000451478 452 ntTSL 2 BASIC3.11□□□□□ -1.91
ACACAQ13085 TRBV12-2-201ENST00000489763 344 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
ACACAQ13085 FO393419.2-201ENST00000492975 428 ntTSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
ACACAQ13085 AC009097.3-201ENST00000563557 1018 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
ACACAQ13085 AL773545.4-201ENST00000637262 310 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
ACACAQ13085 AL513478.4-201ENST00000641636 310 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
ACACAQ13085 MARCH1-201ENST00000274056 5367 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.11□□□□□ -1.91
ACACAQ13085 MBNL1-211ENST00000463374 5092 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
ACACAQ13085 AL645568.2-201ENST00000432815 1337 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
ACACAQ13085 CR383658.2-201ENST00000547576 1525 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
ACACAQ13085 GTDC1-206ENST00000409214 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
ACACAQ13085 BMP5-201ENST00000370830 3952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
ACACAQ13085 KCNRG-202ENST00000360473 1623 ntTSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
ACACAQ13085 KIAA1107-203ENST00000637221 4337 ntTSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
ACACAQ13085 PUS7L-207ENST00000551923 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
ACACAQ13085 CRISP1-203ENST00000505118 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
ACACAQ13085 AC017037.1-201ENST00000508460 471 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
ACACAQ13085 NDUFB9P3-201ENST00000521269 501 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
ACACAQ13085 AL139174.1-201ENST00000531489 886 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
ACACAQ13085 MRPS35P3-201ENST00000603189 709 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
ACACAQ13085 ATP1B3P1-201ENST00000605365 821 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
ACACAQ13085 AC026979.4-201ENST00000606555 645 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
ACACAQ13085 AC105227.2-201ENST00000615075 605 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
ACACAQ13085 SNORD39.4-201ENST00000620099 78 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
ACACAQ13085 DLD-214ENST00000639772 421 ntTSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
ACACAQ13085 ADGRL2-211ENST00000370730 6173 ntTSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
ACACAQ13085 RNF219-AS1-214ENST00000607862 6001 ntTSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
ACACAQ13085 RNF38-210ENST00000611646 5185 ntTSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
ACACAQ13085 RAD17-206ENST00000358030 2648 ntTSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
ACACAQ13085 RABL3-201ENST00000273375 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
ACACAQ13085 RANBP6-201ENST00000259569 4576 ntAPPRIS P1 BASIC3.11□□□□□ -1.91
ACACAQ13085 AK9-202ENST00000355283 2499 ntTSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
ACACAQ13085 IQCH-201ENST00000335894 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
ACACAQ13085 MTTP-201ENST00000265517 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
ACACAQ13085 SLFN12L-205ENST00000628453 1767 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
ACACAQ13085 RNA5SP42-201ENST00000364278 115 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
ACACAQ13085 SNORA18.3-201ENST00000384122 132 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
ACACAQ13085 LINC01445-201ENST00000426205 812 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
ACACAQ13085 AC073508.1-201ENST00000428866 656 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
ACACAQ13085 AC005189.1-201ENST00000431286 310 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
ACACAQ13085 RAB28P3-201ENST00000448325 597 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
ACACAQ13085 ZFPM2-AS1-207ENST00000524045 987 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
ACACAQ13085 UBTFL9-201ENST00000534504 1148 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
ACACAQ13085 AC087888.1-201ENST00000550884 1254 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
ACACAQ13085 AC092868.3-201ENST00000560515 784 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
ACACAQ13085 AC127024.3-201ENST00000582841 460 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
ACACAQ13085 AC087241.4-201ENST00000612441 480 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
ACACAQ13085 CYCSP41-201ENST00000616920 296 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
ACACAQ13085 AGTPBP1-205ENST00000376083 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
ACACAQ13085 IPCEF1-210ENST00000519344 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
ACACAQ13085 ADAM28-201ENST00000265769 7052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
ACACAQ13085 SLC39A10-201ENST00000359634 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
ACACAQ13085 AC011124.1-201ENST00000521221 1762 ntTSL 2 BASIC3.1□□□□□ -1.91
ACACAQ13085 NBPF20-201ENST00000369373 18760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
ACACAQ13085 RNU4-47P-201ENST00000410876 114 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
ACACAQ13085 AL021026.1-201ENST00000422841 658 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
ACACAQ13085 ARL4AP3-201ENST00000441452 574 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
ACACAQ13085 RPS3AP43-201ENST00000479743 781 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
ACACAQ13085 LINC2194-201ENST00000567127 454 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
ACACAQ13085 ERBIN-204ENST00000380943 6410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
ACACAQ13085 MYOT-201ENST00000239926 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
ACACAQ13085 UBA6-201ENST00000322244 9564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
ACACAQ13085 ZNF28-203ENST00000438150 5171 ntTSL 2 BASIC3.1□□□□□ -1.91
ACACAQ13085 MAPK10-373ENST00000641983 6772 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
ACACAQ13085 OR5J1P-201ENST00000313544 939 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
ACACAQ13085 Z99755.1-201ENST00000414048 380 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
ACACAQ13085 EEF1A1P41-201ENST00000414667 207 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
ACACAQ13085 HMGB3P20-201ENST00000417997 600 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
ACACAQ13085 LINC01376-204ENST00000449124 626 ntTSL 2 BASIC3.09□□□□□ -1.91
ACACAQ13085 AL109933.2-201ENST00000452651 260 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
ACACAQ13085 SETP4-201ENST00000455717 868 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
ACACAQ13085 AL034349.1-201ENST00000458367 549 ntTSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.91
ACACAQ13085 AL121576.1-201ENST00000556055 276 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
ACACAQ13085 AC067852.4-201ENST00000590314 478 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
ACACAQ13085 AL162713.1-201ENST00000604480 262 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
ACACAQ13085 HNRNPDLP4-201ENST00000605144 301 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
ACACAQ13085 OR51C1P-201ENST00000608504 942 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
ACACAQ13085 GLCE-202ENST00000559420 4840 ntTSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
ACACAQ13085 AC011912.1-201ENST00000623483 5819 ntTSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
ACACAQ13085 TBC1D15-210ENST00000485960 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
ACACAQ13085 ADGRG4-201ENST00000370652 9820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.92
ACACAQ13085 RNF111-206ENST00000559209 5278 ntTSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.92
ACACAQ13085 DNAJC2-201ENST00000249270 1846 ntTSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.92
ACACAQ13085 ZNF483-201ENST00000309235 3655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.1 ms