Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 AC126323.6-201ENST00000561701 451 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
PTPREP23469 AC040977.1-201ENST00000573222 343 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
PTPREP23469 MIR6862-1-201ENST00000613016 70 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
PTPREP23469 MIR6862-2-201ENST00000614755 70 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
PTPREP23469 AC091953.5-201ENST00000622919 233 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
PTPREP23469 AC127459.3-201ENST00000624328 466 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
PTPREP23469 U6.104-201ENST00000637979 90 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
PTPREP23469 UOX-205ENST00000640983 544 ntTSL 4 BASIC7.59□□□□□ -1.19
PTPREP23469 ERLIN2-211ENST00000523887 2347 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
PTPREP23469 NXF2B-202ENST00000602195 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
PTPREP23469 NXF2-202ENST00000625106 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
PTPREP23469 CAST-202ENST00000325674 3356 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
PTPREP23469 RNF14-202ENST00000356143 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
PTPREP23469 CTNND1-236ENST00000533667 4990 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
PTPREP23469 ARL17A-202ENST00000336125 3945 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
PTPREP23469 TCN1-201ENST00000257264 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
PTPREP23469 RBM22-202ENST00000447771 1386 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.2
PTPREP23469 IBTK-201ENST00000306270 6054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
PTPREP23469 AC016251.2-201ENST00000623393 3089 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
PTPREP23469 ZBTB25-204ENST00000608382 10372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
PTPREP23469 IGF2BP2-AS1-202ENST00000456447 1531 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
PTPREP23469 GJC1-207ENST00000590758 7566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
PTPREP23469 STK32A-202ENST00000397936 5393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
PTPREP23469 AC093311.1-201ENST00000506586 2021 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
PTPREP23469 AC005618.1-201ENST00000606901 3148 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
PTPREP23469 AC130304.1-201ENST00000622942 2385 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
PTPREP23469 OR56A5-201ENST00000340110 738 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
PTPREP23469 TSACC-205ENST00000368255 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
PTPREP23469 AC117402.1-202ENST00000383686 820 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
PTPREP23469 Y_RNA.464-201ENST00000384282 110 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
PTPREP23469 EIF4E2P1-201ENST00000393781 255 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
PTPREP23469 RPA3-204ENST00000406109 434 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
PTPREP23469 Y_RNA.594-201ENST00000410373 140 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
PTPREP23469 RN7SKP108-201ENST00000411367 328 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
PTPREP23469 PVALB-204ENST00000417718 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
PTPREP23469 LINC01638-201ENST00000418271 552 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
PTPREP23469 AL590385.1-201ENST00000419446 462 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
PTPREP23469 PMS2P3-203ENST00000422064 567 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
PTPREP23469 TRBV29-1-201ENST00000422143 402 ntAPPRIS P1 BASIC7.58□□□□□ -1.2
PTPREP23469 AL031663.1-201ENST00000437445 219 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
PTPREP23469 AC073910.1-201ENST00000445047 438 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
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PTPREP23469 RPL21P71-201ENST00000465598 459 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
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PTPREP23469 OR56A5-202ENST00000532411 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.58□□□□□ -1.2
PTPREP23469 AC092746.1-201ENST00000542819 562 ntTSL 4 BASIC7.58□□□□□ -1.2
PTPREP23469 AC018552.3-201ENST00000567416 561 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
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PTPREP23469 AC009779.6-201ENST00000603972 165 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
PTPREP23469 SDR42E1P2-201ENST00000614861 481 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
PTPREP23469 AL138726.1-201ENST00000614873 333 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
PTPREP23469 MILR1-204ENST00000616498 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
PTPREP23469 SDR42E1P4-201ENST00000620894 481 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
PTPREP23469 PCBP1-AS1-360ENST00000630377 598 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
PTPREP23469 AC073488.9-201ENST00000631601 754 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
PTPREP23469 AL807742.1-203ENST00000637444 759 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
PTPREP23469 GNRHR-201ENST00000226413 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
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PTPREP23469 CD86-204ENST00000469710 1604 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
PTPREP23469 ANGEL2-201ENST00000360506 4323 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
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PTPREP23469 TNPO1P2-201ENST00000426249 2665 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
PTPREP23469 MATR3-215ENST00000510056 3040 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
PTPREP23469 MTHFD1P1-201ENST00000413059 2764 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
PTPREP23469 ZNF528-201ENST00000360465 3978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
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PTPREP23469 AL359195.2-201ENST00000623657 4412 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
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PTPREP23469 HSDL2-201ENST00000398803 2983 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
PTPREP23469 TRIM34-204ENST00000514226 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
PTPREP23469 AC104966.1-201ENST00000467010 1464 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
PTPREP23469 CDC42SE2-201ENST00000360515 3591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
PTPREP23469 ARL6-204ENST00000463745 4231 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
PTPREP23469 NFIA-201ENST00000357977 3200 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
PTPREP23469 FAM13A-AS1-201ENST00000500765 3210 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
PTPREP23469 NUMB-229ENST00000557597 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
PTPREP23469 Y_RNA.39-201ENST00000362620 98 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
PTPREP23469 RN7SKP275-201ENST00000364626 301 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
PTPREP23469 DSTNP4-201ENST00000399472 474 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
PTPREP23469 SNORA77.2-201ENST00000408571 112 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
PTPREP23469 RN7SKP296-201ENST00000411185 341 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
PTPREP23469 AC011752.1-203ENST00000417609 582 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
PTPREP23469 AC068533.1-201ENST00000418542 415 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
PTPREP23469 E2F6P2-201ENST00000420708 748 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
PTPREP23469 AC236972.1-201ENST00000433225 199 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
PTPREP23469 RPL23AP19-201ENST00000436229 369 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
PTPREP23469 RPL5P7-201ENST00000444235 813 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
PTPREP23469 RPS3AP41-201ENST00000462701 778 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
PTPREP23469 PABPC1P3-201ENST00000469174 459 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
PTPREP23469 AC092824.1-201ENST00000483524 576 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
PTPREP23469 EEF1A1P25-201ENST00000495704 1267 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
PTPREP23469 HIGD1AP13-201ENST00000509878 289 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
PTPREP23469 Y_RNA.715-201ENST00000517082 110 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
PTPREP23469 AC145350.2-201ENST00000561541 821 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
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