Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 DNAH10-201ENST00000409039 14473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
TRHP20396 LINC02535-201ENST00000455071 2513 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
TRHP20396 PLEKHS1-202ENST00000361048 3249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
TRHP20396 LINC01772-201ENST00000457898 3245 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
TRHP20396 PLEKHS1-207ENST00000619563 3247 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
TRHP20396 PSG8-203ENST00000404209 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
TRHP20396 NOX4-214ENST00000532825 2039 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
TRHP20396 LINC02547-201ENST00000531559 3308 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
TRHP20396 UBE4B-202ENST00000343090 5267 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
TRHP20396 LAX1-203ENST00000442561 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
TRHP20396 RNU1-150P-201ENST00000362491 162 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
TRHP20396 SNORD81.1-201ENST00000363064 77 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
TRHP20396 SNORA70.3-201ENST00000365075 132 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
TRHP20396 CD209-205ENST00000394161 507 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
TRHP20396 AL359643.1-201ENST00000404109 423 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
TRHP20396 AP001086.1-201ENST00000494882 321 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
TRHP20396 AC091180.4-201ENST00000511322 245 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
TRHP20396 SCARNA6.1-201ENST00000516989 238 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
TRHP20396 OR5AP2-201ENST00000544374 1006 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
TRHP20396 AC027288.1-203ENST00000552167 567 ntTSL 4 BASIC10.09□□□□□ -0.79
TRHP20396 AL359219.2-201ENST00000555184 348 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
TRHP20396 RN7SL208P-201ENST00000577964 296 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
TRHP20396 DAB1-AS1-208ENST00000586465 748 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
TRHP20396 ZRANB2-AS2-213ENST00000591654 719 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
TRHP20396 MIR6127-201ENST00000614019 109 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
TRHP20396 ITGA2-201ENST00000296585 7869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
TRHP20396 ZNF195-230ENST00000620374 3342 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
TRHP20396 TENM4-201ENST00000278550 14000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
TRHP20396 ZFX-204ENST00000379188 7513 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
TRHP20396 NIPBL-202ENST00000448238 8729 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
TRHP20396 TTC26-202ENST00000430935 4198 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
TRHP20396 MAP9-201ENST00000311277 7333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
TRHP20396 TCN1-201ENST00000257264 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
TRHP20396 COPB1-202ENST00000439561 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
TRHP20396 ZNF273-204ENST00000476120 2000 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
TRHP20396 CAST-236ENST00000511782 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
TRHP20396 SIRPG-AS1-202ENST00000456177 2795 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
TRHP20396 CPA3-201ENST00000296046 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
TRHP20396 ZNF200-201ENST00000396868 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
TRHP20396 TTC6-202ENST00000382320 1972 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
TRHP20396 RAD23B-202ENST00000416373 3835 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
TRHP20396 XRCC6P4-201ENST00000518193 2067 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
TRHP20396 AC139426.3-201ENST00000605648 2059 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
TRHP20396 OLFM3-201ENST00000338858 2189 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
TRHP20396 VNN2-206ENST00000525270 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
TRHP20396 ARHGAP42P5-201ENST00000548856 2936 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
TRHP20396 IL16-204ENST00000394660 9616 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
TRHP20396 DTNA-228ENST00000597674 1732 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
TRHP20396 OPALIN-206ENST00000611913 3115 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
TRHP20396 GGCX-201ENST00000233838 7569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
TRHP20396 SLC37A3-202ENST00000340308 2955 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
TRHP20396 snoU2_19.2-201ENST00000363024 80 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
TRHP20396 RNU6-1020P-201ENST00000363684 107 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
TRHP20396 AC024619.1-202ENST00000426489 495 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
TRHP20396 SMG7-AS1-202ENST00000432837 466 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
TRHP20396 OR2AO1P-201ENST00000476497 403 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
TRHP20396 AC096577.1-203ENST00000506386 541 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
TRHP20396 RNU6-1338P-201ENST00000516328 91 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
TRHP20396 AC034114.1-201ENST00000520293 285 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
TRHP20396 AP001922.2-201ENST00000530435 390 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
TRHP20396 AP002754.2-201ENST00000542121 462 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
TRHP20396 AC023813.1-201ENST00000565055 306 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
TRHP20396 RN7SL475P-201ENST00000583379 298 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
TRHP20396 MAGOH2P-202ENST00000584384 429 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
TRHP20396 U6.114-201ENST00000636407 96 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
TRHP20396 BAAT-201ENST00000259407 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
TRHP20396 ADAM3A-202ENST00000460383 2528 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
TRHP20396 CCT8P1-201ENST00000413611 1657 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
TRHP20396 PCDH9-202ENST00000377865 5709 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
TRHP20396 DHX40P1-201ENST00000588725 1412 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
TRHP20396 AC060780.1-202ENST00000590740 5084 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
TRHP20396 CCDC150-202ENST00000409270 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
TRHP20396 AC007993.1-201ENST00000621298 2430 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
TRHP20396 CA1-225ENST00000626824 2405 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
TRHP20396 TRMT13-202ENST00000370141 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
TRHP20396 C9orf131-201ENST00000312292 3409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
TRHP20396 EPS15L1-214ENST00000602009 3915 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
TRHP20396 CHD8-201ENST00000399982 8229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
TRHP20396 AC113615.1-201ENST00000507424 4121 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
TRHP20396 RNU6-641P-201ENST00000384006 107 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
TRHP20396 AL354868.1-201ENST00000417077 482 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
TRHP20396 AL356134.1-201ENST00000419815 373 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
TRHP20396 AL121902.1-201ENST00000426963 459 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
TRHP20396 RPL23AP25-201ENST00000430973 463 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
TRHP20396 TPT1P13-201ENST00000449760 499 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
TRHP20396 FPGT-203ENST00000467578 601 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
TRHP20396 AC007686.1-201ENST00000488511 463 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
TRHP20396 AC055855.1-201ENST00000489563 579 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
TRHP20396 KHDC1P1-201ENST00000511053 508 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
TRHP20396 MRPS18CP4-201ENST00000535821 231 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
TRHP20396 CLEC2D-216ENST00000545918 288 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
TRHP20396 AL157911.1-202ENST00000554123 502 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
TRHP20396 MIR4436B2-201ENST00000581415 91 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
TRHP20396 MIR4436B1-201ENST00000583272 91 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
TRHP20396 AC024592.1-202ENST00000590441 341 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
TRHP20396 Six3os1_4.1-201ENST00000615706 324 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
TRHP20396 BANCR-201ENST00000624238 473 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
TRHP20396 RUVBL2-214ENST00000640699 153 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
TRHP20396 NEDD4L-209ENST00000456986 8436 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
TRHP20396 CTNNA1-210ENST00000518825 3536 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93 ms