Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 RNA5SP388-201ENST00000362584 119 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
CTF1Q16619 RN7SKP269-201ENST00000365545 319 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
CTF1Q16619 SMARCA2-207ENST00000382186 955 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
CTF1Q16619 TRAV9-1-201ENST00000390431 338 ntAPPRIS P1 BASIC4.07□□□□□ -1.76
CTF1Q16619 DSTNP4-201ENST00000399472 474 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
CTF1Q16619 AL121978.1-201ENST00000402778 359 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
CTF1Q16619 MIR4435-2HG-203ENST00000409569 514 ntTSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
CTF1Q16619 C1D-204ENST00000410067 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
CTF1Q16619 RPS23P10-201ENST00000416185 486 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
CTF1Q16619 AC105399.1-201ENST00000422418 418 ntTSL 2 BASIC4.07□□□□□ -1.76
CTF1Q16619 DDX39BP1-205ENST00000422507 192 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
CTF1Q16619 RPL23AP25-201ENST00000430973 463 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
CTF1Q16619 CASP12-204ENST00000433738 709 ntTSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
CTF1Q16619 AL161935.3-201ENST00000433770 347 ntTSL 2 BASIC4.07□□□□□ -1.76
CTF1Q16619 AC004824.1-201ENST00000439577 311 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
CTF1Q16619 AL360091.3-201ENST00000442146 387 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
CTF1Q16619 TIMM8BP2-201ENST00000445940 251 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
CTF1Q16619 AL121760.1-201ENST00000447206 346 ntTSL 2 BASIC4.07□□□□□ -1.76
CTF1Q16619 AL646090.1-201ENST00000449928 492 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
CTF1Q16619 SNRPG-206ENST00000454893 527 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
CTF1Q16619 SH2D1A-203ENST00000477673 461 ntTSL 2 BASIC4.07□□□□□ -1.76
CTF1Q16619 NCOR1P1-202ENST00000486162 291 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
CTF1Q16619 SUB1-203ENST00000502897 562 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.07□□□□□ -1.76
CTF1Q16619 LINC02500-201ENST00000512547 493 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
CTF1Q16619 SUB1-211ENST00000512913 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.07□□□□□ -1.76
CTF1Q16619 AC025766.1-201ENST00000514061 409 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
CTF1Q16619 SMARCE1P4-201ENST00000523647 241 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
CTF1Q16619 SLC2A13P1-201ENST00000531560 322 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
CTF1Q16619 PRH1-206ENST00000543626 710 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
CTF1Q16619 JKAMP-212ENST00000556985 592 ntTSL 2 BASIC4.07□□□□□ -1.76
CTF1Q16619 AC090371.2-202ENST00000582239 644 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
CTF1Q16619 SNORD39.3-201ENST00000584451 71 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
CTF1Q16619 AC040904.1-201ENST00000590850 223 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
CTF1Q16619 AC095055.1-201ENST00000603472 1113 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
CTF1Q16619 AC010738.1-201ENST00000604970 987 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
CTF1Q16619 HSPE1P14-201ENST00000605812 302 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
CTF1Q16619 AC245297.2-201ENST00000610119 565 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
CTF1Q16619 AC004223.4-201ENST00000612426 332 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
CTF1Q16619 AL354976.1-201ENST00000613843 387 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
CTF1Q16619 MIR6774-201ENST00000614651 70 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
CTF1Q16619 Metazoa_SRP.181-201ENST00000616636 288 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
CTF1Q16619 AL590227.1-201ENST00000622616 315 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
CTF1Q16619 AC098679.5-201ENST00000624394 571 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
CTF1Q16619 AC011139.1-202ENST00000637744 563 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
CTF1Q16619 PDCD1LG2-201ENST00000397747 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
CTF1Q16619 XPOTP1-201ENST00000443317 2398 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
CTF1Q16619 ZNF28-204ENST00000457749 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
CTF1Q16619 ADAM7-201ENST00000175238 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
CTF1Q16619 AC104662.3-202ENST00000507794 4055 ntTSL 2 BASIC4.07□□□□□ -1.76
CTF1Q16619 CFHR3-205ENST00000471440 1965 ntTSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
CTF1Q16619 TBC1D31-210ENST00000521676 3256 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
CTF1Q16619 AADAC-201ENST00000232892 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
CTF1Q16619 AC011493.1-201ENST00000596753 1632 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CTF1Q16619 IFI16-208ENST00000448393 2245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
CTF1Q16619 PRLR-220ENST00000620785 11063 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
CTF1Q16619 SLCO1B7-201ENST00000421593 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
CTF1Q16619 FAM49B-212ENST00000519110 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
CTF1Q16619 Y_RNA.25-201ENST00000362528 102 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CTF1Q16619 RNA5SP502-201ENST00000362694 119 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CTF1Q16619 SNORA4.1-201ENST00000364263 144 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CTF1Q16619 RNU6-921P-201ENST00000384361 107 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CTF1Q16619 ATP5F1P4-201ENST00000397288 746 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CTF1Q16619 ZNF603P-201ENST00000405613 487 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CTF1Q16619 PIGPP2-201ENST00000411569 458 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CTF1Q16619 TRAPPC2P10-201ENST00000415662 323 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CTF1Q16619 AC108681.1-202ENST00000417384 589 ntTSL 4 BASIC4.06□□□□□ -1.76
CTF1Q16619 AC009299.3-201ENST00000421122 1072 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
CTF1Q16619 DNAJA1P2-201ENST00000421360 1197 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CTF1Q16619 AL391219.1-201ENST00000422570 483 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CTF1Q16619 RPL12P34-201ENST00000424532 479 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CTF1Q16619 AL139819.1-201ENST00000429420 471 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
CTF1Q16619 AC069154.1-201ENST00000432914 542 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CTF1Q16619 AL353597.2-202ENST00000434901 373 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CTF1Q16619 AC110602.1-201ENST00000437414 318 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CTF1Q16619 AL139237.2-201ENST00000438454 493 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
CTF1Q16619 LINC01891-201ENST00000439798 538 ntTSL 4 BASIC4.06□□□□□ -1.76
CTF1Q16619 AC009299.3-202ENST00000445372 538 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
CTF1Q16619 AP003774.4-201ENST00000447028 672 ntTSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
CTF1Q16619 AC090142.1-201ENST00000465776 462 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CTF1Q16619 AC007370.1-201ENST00000503163 316 ntTSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
CTF1Q16619 HMGB1P28-201ENST00000507778 552 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CTF1Q16619 MRPS5P3-201ENST00000515577 166 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CTF1Q16619 RN7SKP260-201ENST00000516907 149 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CTF1Q16619 AF186190.1-201ENST00000517470 480 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CTF1Q16619 AC069113.2-201ENST00000517735 359 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
CTF1Q16619 AC062004.1-201ENST00000518706 686 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
CTF1Q16619 CTHRC1-204ENST00000520880 560 ntTSL 4 BASIC4.06□□□□□ -1.76
CTF1Q16619 NPM1P6-201ENST00000521088 871 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CTF1Q16619 MAL2-208ENST00000523307 556 ntTSL 4 BASIC4.06□□□□□ -1.76
CTF1Q16619 MTCO1P49-201ENST00000523429 802 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CTF1Q16619 AC055878.1-201ENST00000531858 281 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
CTF1Q16619 AC093025.1-201ENST00000547795 569 ntTSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
CTF1Q16619 AC084756.1-201ENST00000558237 606 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
CTF1Q16619 LINC02131-201ENST00000563289 419 ntTSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
CTF1Q16619 AC013565.1-201ENST00000565938 597 ntTSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
CTF1Q16619 LINC01630-204ENST00000582689 539 ntTSL 4 BASIC4.06□□□□□ -1.76
CTF1Q16619 AC090415.2-201ENST00000584078 374 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
CTF1Q16619 AC018761.4-201ENST00000585742 272 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
CTF1Q16619 SATB1-AS1-222ENST00000600177 751 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
CTF1Q16619 AC004542.1-201ENST00000602955 264 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.9 ms