Protein–RNA interactions for Protein: Q15651

HMGN3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3Q15651 SIRPD-201ENST00000381621 823 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
HMGN3Q15651 RN7SKP53-201ENST00000411337 315 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
HMGN3Q15651 ITCH-IT1-201ENST00000418598 208 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
HMGN3Q15651 AC106873.1-201ENST00000420664 459 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
HMGN3Q15651 LINC01389-201ENST00000420876 483 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
HMGN3Q15651 AC012498.1-201ENST00000424037 437 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
HMGN3Q15651 AC090952.1-201ENST00000424242 446 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
HMGN3Q15651 AC024619.1-202ENST00000426489 495 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
HMGN3Q15651 AL157359.2-201ENST00000440372 784 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
HMGN3Q15651 NEGR1-IT1-201ENST00000453121 534 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
HMGN3Q15651 AL138737.1-201ENST00000456896 1252 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
HMGN3Q15651 SNRPGP3-201ENST00000469405 227 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
HMGN3Q15651 AC104831.1-201ENST00000470024 444 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
HMGN3Q15651 RN7SL132P-201ENST00000478131 296 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
HMGN3Q15651 AC021205.2-201ENST00000480069 347 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
HMGN3Q15651 GAPDHP36-201ENST00000480688 918 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
HMGN3Q15651 RNU6-964P-201ENST00000516524 69 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
HMGN3Q15651 C8orf22-203ENST00000517663 788 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
HMGN3Q15651 IGHV3-76-201ENST00000522465 295 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
HMGN3Q15651 C11orf74-210ENST00000534635 801 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
HMGN3Q15651 ARL6IP1P1-201ENST00000545836 610 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
HMGN3Q15651 PARP1P2-201ENST00000556806 195 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
HMGN3Q15651 AC091117.2-201ENST00000560324 542 ntTSL 4 BASIC2.95□□□□□ -1.94
HMGN3Q15651 MIR5685-201ENST00000579080 79 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
HMGN3Q15651 MIR6748-201ENST00000610433 71 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
HMGN3Q15651 AC069209.1-201ENST00000619282 651 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
HMGN3Q15651 PACRG-211ENST00000621363 360 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
HMGN3Q15651 AL451142.2-201ENST00000429076 2090 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
HMGN3Q15651 KNTC1-205ENST00000450485 3655 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
HMGN3Q15651 CLOCK-201ENST00000309964 10304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
HMGN3Q15651 TFEC-203ENST00000393485 2704 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
HMGN3Q15651 PCDH15-208ENST00000395432 6901 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
HMGN3Q15651 GPR18-203ENST00000397473 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
HMGN3Q15651 SLC38A9-223ENST00000515629 2673 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
HMGN3Q15651 CLHC1-201ENST00000401408 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
HMGN3Q15651 AP001148.1-201ENST00000624124 2359 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
HMGN3Q15651 RNMT-203ENST00000543302 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
HMGN3Q15651 ATP2C1-202ENST00000359644 3401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
HMGN3Q15651 COX7B2-201ENST00000355591 542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
HMGN3Q15651 TRPM3-206ENST00000377097 554 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
HMGN3Q15651 AC007066.1-201ENST00000392902 381 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
HMGN3Q15651 AL445189.1-201ENST00000405722 338 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
HMGN3Q15651 AC009505.1-201ENST00000413151 424 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
HMGN3Q15651 AL365277.2-201ENST00000415255 551 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
HMGN3Q15651 AL391704.2-201ENST00000418379 981 ntTSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
HMGN3Q15651 C21orf91-OT1-202ENST00000430815 717 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
HMGN3Q15651 AC010890.1-202ENST00000432414 535 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
HMGN3Q15651 RPS29P7-201ENST00000439662 171 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
HMGN3Q15651 AL357552.1-201ENST00000445254 415 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
HMGN3Q15651 AL161912.1-201ENST00000448475 524 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
HMGN3Q15651 AP000563.1-201ENST00000490865 758 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
HMGN3Q15651 SCOC-205ENST00000502535 679 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
HMGN3Q15651 AC025187.1-201ENST00000506305 686 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
HMGN3Q15651 ZCCHC10-206ENST00000509008 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
HMGN3Q15651 AC104027.1-201ENST00000521887 300 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
HMGN3Q15651 AC006518.2-202ENST00000544947 297 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
HMGN3Q15651 OR4H12P-201ENST00000556269 907 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
HMGN3Q15651 HSPE1P5-201ENST00000561489 272 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
HMGN3Q15651 AC022916.3-201ENST00000592961 742 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
HMGN3Q15651 ZNF283-207ENST00000593164 1260 ntTSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
HMGN3Q15651 NMD3P1-201ENST00000439704 1488 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
HMGN3Q15651 PTPN22-211ENST00000538253 3575 ntTSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
HMGN3Q15651 GPRC6A-202ENST00000368549 2622 ntTSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
HMGN3Q15651 C12orf4-201ENST00000261250 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
HMGN3Q15651 THEMIS-201ENST00000368248 3866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
HMGN3Q15651 SYT14P1-202ENST00000600441 1448 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
HMGN3Q15651 AC092111.2-201ENST00000611627 1414 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
HMGN3Q15651 DSG2-AS1-202ENST00000583706 2024 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
HMGN3Q15651 PTPN12-206ENST00000435495 2526 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
HMGN3Q15651 AC008264.2-201ENST00000610193 3731 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
HMGN3Q15651 AC005183.1-201ENST00000603687 1979 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
HMGN3Q15651 AL138828.1-203ENST00000419926 1570 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
HMGN3Q15651 TCEAL7-201ENST00000332431 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
HMGN3Q15651 SNORD56.3-201ENST00000363507 71 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
HMGN3Q15651 SNORA51.4-201ENST00000364993 124 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
HMGN3Q15651 GSTA12P-201ENST00000402398 508 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
HMGN3Q15651 HMGB3P18-201ENST00000406327 590 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
HMGN3Q15651 AL022329.2-201ENST00000413494 660 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
HMGN3Q15651 NEK4P1-201ENST00000433383 879 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
HMGN3Q15651 AC007967.1-201ENST00000455422 1159 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
HMGN3Q15651 RPS20P32-201ENST00000456044 356 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
HMGN3Q15651 AC111000.4-201ENST00000504301 569 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
HMGN3Q15651 AC010265.1-201ENST00000513509 211 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
HMGN3Q15651 TBCA-206ENST00000518338 551 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
HMGN3Q15651 TPT1-AS1-216ENST00000522845 403 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
HMGN3Q15651 SAMD15-202ENST00000533095 412 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
HMGN3Q15651 OR8X1P-201ENST00000534542 869 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
HMGN3Q15651 AL160191.1-201ENST00000555480 566 ntTSL 4 BASIC2.93□□□□□ -1.94
HMGN3Q15651 AC068875.1-201ENST00000561054 463 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
HMGN3Q15651 AC006270.1-201ENST00000582889 478 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
HMGN3Q15651 AL357559.1-201ENST00000622228 274 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
HMGN3Q15651 hsa-mir-4776-1.1-201ENST00000636364 80 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
HMGN3Q15651 OR2M2-202ENST00000641211 1229 ntAPPRIS P1 BASIC2.93□□□□□ -1.94
HMGN3Q15651 OR2M2-203ENST00000641836 1151 ntAPPRIS P1 BASIC2.93□□□□□ -1.94
HMGN3Q15651 PTBP2-211ENST00000609116 12014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
HMGN3Q15651 KNTC1-204ENST00000436959 2412 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
HMGN3Q15651 POSTN-203ENST00000379747 3373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
HMGN3Q15651 AC091152.2-201ENST00000591628 2569 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
HMGN3Q15651 MME-216ENST00000615825 5523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
HMGN3Q15651 ATP2B1-203ENST00000393164 3127 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
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