Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 NCOR1P1-201ENST00000478176 406 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 RPL5P22-201ENST00000480199 884 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 AC005674.1-201ENST00000503493 459 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 BNIP3P41-201ENST00000503774 571 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 AC016687.2-201ENST00000504795 541 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 AC093809.1-201ENST00000509155 340 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 RFPL4AP5-201ENST00000514977 504 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 MTND1P5-201ENST00000517906 940 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 MOCS2-208ENST00000527216 707 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 AC022240.1-201ENST00000532065 684 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 TRDV3-201ENST00000535880 425 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 AC011509.1-201ENST00000589512 164 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 AP000403.1-201ENST00000603349 851 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 AC097468.3-201ENST00000607956 456 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 AC006566.1-201ENST00000608943 513 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 AC108747.1-201ENST00000609508 535 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 AC087241.4-201ENST00000612441 480 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 AC025574.2-201ENST00000615621 514 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 AL357080.1-201ENST00000617394 239 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 AC068722.2-201ENST00000618734 544 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 PLCE1-AS2-213ENST00000620469 432 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 SNORA17.5-201ENST00000630429 132 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 PSG7-201ENST00000406070 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 DPP10-204ENST00000409163 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 SDC2-204ENST00000519914 1318 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 INTU-201ENST00000335251 13233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 DNAAF4-CCPG1-201ENST00000565113 4589 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 ANKRD49-208ENST00000544253 3002 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 RNMT-203ENST00000543302 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 CDH19-201ENST00000262150 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 RIMS1-212ENST00000517827 3065 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 AC010127.1-209ENST00000447809 2305 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 ANXA1-201ENST00000257497 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 VCAM1-203ENST00000370115 2475 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 SNX10-202ENST00000396376 2491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 ANKRD62P1-201ENST00000434304 1623 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 ANAPC1P1-201ENST00000426186 2145 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 LMNTD1-204ENST00000458174 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 SESN1-201ENST00000302071 2718 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 ADAM29-203ENST00000445694 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 CASC19-201ENST00000500112 5735 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 P2RY12-201ENST00000302632 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 RNU5E-5P-201ENST00000365379 116 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 AL139095.4-201ENST00000379928 500 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 RNU6-1042P-201ENST00000384204 107 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 RNU6-348P-201ENST00000384386 107 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 OR6C69P-201ENST00000394268 893 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 AC016769.3-201ENST00000396562 315 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 DHFRP6-201ENST00000401776 268 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 RNA5SP178-201ENST00000410380 128 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 RN7SKP56-201ENST00000410513 331 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 AC069218.2-201ENST00000411665 344 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 BMS1P17-202ENST00000416720 316 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 RPL21P32-201ENST00000419877 477 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 OFD1P18Y-201ENST00000420889 959 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 AC093843.1-201ENST00000424395 512 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 AL353693.1-201ENST00000429567 442 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 C8orf59P1-201ENST00000429930 303 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 ALG13-AS1-201ENST00000430794 195 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 LINC02038-201ENST00000439074 702 ntTSL 4 BASIC4.87□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 TRIM31-AS1-204ENST00000440874 549 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 GEMIN8P3-201ENST00000445417 720 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 VPS29-202ENST00000447578 996 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 RPL7P31-201ENST00000450192 724 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 AL589935.1-212ENST00000450998 525 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 AC026410.2-201ENST00000460281 156 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 AC117430.1-201ENST00000474711 801 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 AC104763.1-201ENST00000475274 360 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 RN7SL814P-201ENST00000487715 300 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 RPL7P51-201ENST00000490532 749 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 SATB1-216ENST00000491519 1000 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 AC008517.1-201ENST00000502383 585 ntTSL 4 BASIC4.87□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 PRELID3BP7-201ENST00000503606 469 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 AC021678.1-201ENST00000505195 936 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 LINC01957-201ENST00000506392 751 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 AC010460.1-201ENST00000507087 466 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 POU5F1P7-201ENST00000508759 541 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 GYPA-209ENST00000512789 258 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 AC011389.1-203ENST00000513790 573 ntTSL 4 BASIC4.87□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 RN7SKP46-201ENST00000515942 234 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 RNA5SP228-201ENST00000516232 133 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 ZNF706-202ENST00000517844 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 AC104986.1-201ENST00000517978 436 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 AC105031.1-201ENST00000518550 476 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 AC084116.2-201ENST00000520171 415 ntTSL 4 BASIC4.87□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 AC090809.1-201ENST00000524132 570 ntTSL 4 BASIC4.87□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 AP002748.2-201ENST00000528671 348 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 AP004247.1-201ENST00000531556 1289 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 AC068587.4-201ENST00000533893 186 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 AC027544.3-201ENST00000535082 757 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 AC078962.4-201ENST00000546135 254 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 OR6C73P-201ENST00000546432 358 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 AC009803.3-201ENST00000548457 540 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 AC096558.1-203ENST00000550516 574 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 AC107023.1-201ENST00000552757 356 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 AC026992.1-201ENST00000558269 571 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 AC066612.2-201ENST00000559875 695 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 EIF1P4-201ENST00000572664 335 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 RNASEH2B-AS1-202ENST00000593369 648 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 DAOA-AS1_2.2-201ENST00000610818 204 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.1 ms