Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 ELOCP18-201ENST00000434209 337 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
PTPRGP23470 RPL7P28-201ENST00000437739 740 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
PTPRGP23470 AC005008.2-202ENST00000447776 439 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
PTPRGP23470 AC099313.1-201ENST00000568437 452 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
PTPRGP23470 AC087749.2-201ENST00000583910 352 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
PTPRGP23470 ACYP2-208ENST00000606865 674 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
PTPRGP23470 ATP5A1P2-202ENST00000616464 443 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
PTPRGP23470 AL732372.2-225ENST00000642124 456 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
PTPRGP23470 TNPO1P3-201ENST00000436471 2662 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
PTPRGP23470 SGIP1-206ENST00000435165 3646 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
PTPRGP23470 DLD-204ENST00000437604 1859 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
PTPRGP23470 LINC02475-202ENST00000512678 2622 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
PTPRGP23470 IPCEF1-210ENST00000519344 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
PTPRGP23470 UBE2D3-233ENST00000618836 3472 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
PTPRGP23470 TMCO5A-203ENST00000558158 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
PTPRGP23470 ADAM5-201ENST00000359790 1663 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
PTPRGP23470 TEX30-201ENST00000376019 1689 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
PTPRGP23470 AC004982.1-201ENST00000608770 1655 ntTSL 4 BASIC5.38□□□□□ -1.55
PTPRGP23470 LBR-202ENST00000338179 3812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
PTPRGP23470 VNN2-201ENST00000326499 2118 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
PTPRGP23470 AC011503.2-201ENST00000594230 1500 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
PTPRGP23470 STXBP4-203ENST00000405898 2229 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
PTPRGP23470 PHF6-201ENST00000332070 4759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
PTPRGP23470 OR5H2-201ENST00000355273 945 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
PTPRGP23470 OR5H2-202ENST00000356526 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.38□□□□□ -1.55
PTPRGP23470 DPP10-AS3-201ENST00000417844 665 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
PTPRGP23470 PLCE1-AS2-201ENST00000419353 459 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
PTPRGP23470 AC078993.1-203ENST00000435789 1037 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
PTPRGP23470 RPS6P2-201ENST00000454208 705 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
PTPRGP23470 KC877373.1-201ENST00000479066 408 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
PTPRGP23470 AC027801.4-201ENST00000518420 395 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
PTPRGP23470 AC018442.3-201ENST00000523025 183 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
PTPRGP23470 AC005828.3-201ENST00000583552 591 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
PTPRGP23470 AC006557.5-201ENST00000603126 811 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
PTPRGP23470 AL137078.2-201ENST00000615740 318 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
PTPRGP23470 AC097478.4-201ENST00000615968 522 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
PTPRGP23470 AC244517.3-201ENST00000616254 1235 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
PTPRGP23470 AC091905.1-201ENST00000624400 311 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
PTPRGP23470 PLCB4-204ENST00000378501 5833 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
PTPRGP23470 POLK-201ENST00000241436 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
PTPRGP23470 ABCB5-201ENST00000258738 2906 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
PTPRGP23470 ADGRL3-203ENST00000506700 4838 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
PTPRGP23470 RNU1-18P-201ENST00000363062 164 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
PTPRGP23470 TRAV14DV4-201ENST00000390440 425 ntAPPRIS P1 BASIC5.37□□□□□ -1.55
PTPRGP23470 RN7SKP247-201ENST00000411094 308 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
PTPRGP23470 AL160272.1-201ENST00000421509 521 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
PTPRGP23470 AL353705.1-201ENST00000433468 480 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
PTPRGP23470 OR4R3P-201ENST00000525084 838 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
PTPRGP23470 AC087276.1-201ENST00000529659 480 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
PTPRGP23470 AC022080.3-201ENST00000544433 482 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
PTPRGP23470 AL160191.1-201ENST00000555480 566 ntTSL 4 BASIC5.37□□□□□ -1.55
PTPRGP23470 MIR3945-201ENST00000581853 98 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
PTPRGP23470 AC007998.5-201ENST00000622938 237 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
PTPRGP23470 MTCO1P22-201ENST00000604619 1360 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
PTPRGP23470 NMD3P1-201ENST00000439704 1488 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
PTPRGP23470 VPS13D-214ENST00000620676 16320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
PTPRGP23470 APC-207ENST00000508376 10619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
PTPRGP23470 AC000123.3-201ENST00000624029 4975 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
PTPRGP23470 TIGD2-201ENST00000317005 2083 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
PTPRGP23470 OR2X1P-201ENST00000421144 687 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
PTPRGP23470 RPL23AP69-201ENST00000431134 458 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
PTPRGP23470 HMGB1P5-202ENST00000451497 985 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
PTPRGP23470 Z84488.1-201ENST00000476099 530 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
PTPRGP23470 AC004924.1-201ENST00000480160 781 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
PTPRGP23470 AC093722.1-201ENST00000504882 489 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
PTPRGP23470 RNU4ATAC6P-201ENST00000516592 126 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
PTPRGP23470 AC083923.2-202ENST00000517773 498 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
PTPRGP23470 IGHV3-29-201ENST00000604817 344 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
PTPRGP23470 RNVU1-4-201ENST00000612985 164 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
PTPRGP23470 OR5B12-202ENST00000641921 1807 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
PTPRGP23470 KIAA0586-202ENST00000354386 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
PTPRGP23470 AL365214.2-201ENST00000433684 1365 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
PTPRGP23470 CEP170P1-201ENST00000502249 4587 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
PTPRGP23470 PTAR1-202ENST00000377200 9876 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
PTPRGP23470 BCL2A1-201ENST00000267953 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
PTPRGP23470 MIR449A-201ENST00000362113 91 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
PTPRGP23470 RNA5SP432-201ENST00000362480 116 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
PTPRGP23470 CRP-203ENST00000368111 512 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
PTPRGP23470 SPRR2E-201ENST00000368750 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
PTPRGP23470 IARS-201ENST00000375627 697 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
PTPRGP23470 TNFRSF17-202ENST00000396495 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
PTPRGP23470 AC022537.1-201ENST00000435271 446 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
PTPRGP23470 HMGB3P22-202ENST00000451823 572 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
PTPRGP23470 AC123023.1-201ENST00000455974 555 ntTSL 4 BASIC5.35□□□□□ -1.55
PTPRGP23470 NRG1-IT1-202ENST00000521463 742 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
PTPRGP23470 AL132819.1-201ENST00000555595 208 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
PTPRGP23470 AC011270.1-201ENST00000558606 583 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
PTPRGP23470 SULT1C2P2-201ENST00000562517 294 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
PTPRGP23470 AC079298.2-201ENST00000623885 459 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
PTPRGP23470 SLC16A10-201ENST00000368850 10051 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
PTPRGP23470 CNOT10-206ENST00000454516 2760 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
PTPRGP23470 AC116158.1-201ENST00000560231 2129 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
PTPRGP23470 SLCO1A2-201ENST00000307378 7682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
PTPRGP23470 STK31-205ENST00000433467 3085 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
PTPRGP23470 TENM1-202ENST00000422452 12891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
PTPRGP23470 TARID-205ENST00000607033 2960 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
PTPRGP23470 LINC02471-203ENST00000641941 4752 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
PTPRGP23470 EMB-205ENST00000514111 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
PTPRGP23470 BMPR1B-203ENST00000440890 5388 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
PTPRGP23470 FAM169A-201ENST00000389156 5990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.2 ms