Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYP9

MIS18A, Protein Mis18-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIS18AQ9NYP9 AC073063.1-201ENST00000434352 607 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
MIS18AQ9NYP9 AL157359.2-201ENST00000440372 784 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
MIS18AQ9NYP9 PRDX3P3-201ENST00000447765 522 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
MIS18AQ9NYP9 CALM1P2-201ENST00000452941 448 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
MIS18AQ9NYP9 TFEC-208ENST00000484212 1245 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
MIS18AQ9NYP9 AC104009.1-203ENST00000531304 571 ntTSL 4 BASIC4.74□□□□□ -1.65
MIS18AQ9NYP9 OR8X1P-201ENST00000534542 869 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
MIS18AQ9NYP9 AC025265.2-201ENST00000551905 478 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
MIS18AQ9NYP9 AL357172.1-201ENST00000556016 593 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
MIS18AQ9NYP9 HMGB3P26-201ENST00000560051 582 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
MIS18AQ9NYP9 AC005242.1-201ENST00000585658 438 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
MIS18AQ9NYP9 MAPKAPK5-AS1-205ENST00000590479 543 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
MIS18AQ9NYP9 AC092316.1-201ENST00000598703 297 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
MIS18AQ9NYP9 AC015813.4-201ENST00000610469 179 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
MIS18AQ9NYP9 AC233309.1-201ENST00000619522 751 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
MIS18AQ9NYP9 AL356490.1-201ENST00000623079 479 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
MIS18AQ9NYP9 GAB1-203ENST00000505913 2477 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
MIS18AQ9NYP9 MYOZ2-201ENST00000307128 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
MIS18AQ9NYP9 AC007342.7-201ENST00000624610 2337 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
MIS18AQ9NYP9 KC6-201ENST00000592302 1713 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
MIS18AQ9NYP9 ENPP3-202ENST00000358229 3026 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
MIS18AQ9NYP9 CSNK1G3-203ENST00000361991 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
MIS18AQ9NYP9 GPRC6A-201ENST00000310357 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
MIS18AQ9NYP9 TPTE2-201ENST00000255310 1562 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
MIS18AQ9NYP9 PIGN-229ENST00000638936 4233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
MIS18AQ9NYP9 TIMM9-202ENST00000395159 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
MIS18AQ9NYP9 AC097504.1-201ENST00000515103 2415 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
MIS18AQ9NYP9 NEDD4-201ENST00000338963 7019 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
MIS18AQ9NYP9 OFD1P6Y-201ENST00000432335 1637 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
MIS18AQ9NYP9 TTTY9B-201ENST00000433794 1637 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
MIS18AQ9NYP9 MBNL1-211ENST00000463374 5092 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
MIS18AQ9NYP9 MGST1-201ENST00000010404 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
MIS18AQ9NYP9 SNORD46.1-201ENST00000364139 104 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
MIS18AQ9NYP9 Y_RNA.333-201ENST00000365274 102 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
MIS18AQ9NYP9 RNU6-31P-201ENST00000384388 108 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
MIS18AQ9NYP9 MIR7-3-201ENST00000384898 110 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
MIS18AQ9NYP9 MGST1-203ENST00000396207 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
MIS18AQ9NYP9 HLFP1-201ENST00000402375 499 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
MIS18AQ9NYP9 MTATP6P19-201ENST00000413797 659 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
MIS18AQ9NYP9 PTP4A1P3-201ENST00000433661 420 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
MIS18AQ9NYP9 LINC01757-201ENST00000435552 480 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
MIS18AQ9NYP9 AC006480.1-201ENST00000449887 378 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
MIS18AQ9NYP9 PPIAP3-201ENST00000450588 505 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
MIS18AQ9NYP9 HMGB3P22-202ENST00000451823 572 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
MIS18AQ9NYP9 RPS6P4-201ENST00000494693 758 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
MIS18AQ9NYP9 AC110768.1-201ENST00000509222 400 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
MIS18AQ9NYP9 LINC02480-201ENST00000511875 612 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
MIS18AQ9NYP9 AC090281.1-201ENST00000523019 276 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
MIS18AQ9NYP9 NOP56P3-201ENST00000549457 385 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
MIS18AQ9NYP9 CKS1BP1-201ENST00000555221 240 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
MIS18AQ9NYP9 FOPNL-208ENST00000575744 565 ntTSL 4 BASIC4.73□□□□□ -1.65
MIS18AQ9NYP9 AP005131.3-201ENST00000590042 665 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
MIS18AQ9NYP9 LINC00649-214ENST00000609132 668 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
MIS18AQ9NYP9 AC019176.2-201ENST00000611579 315 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
MIS18AQ9NYP9 CR589904.2-201ENST00000612533 440 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
MIS18AQ9NYP9 GTDC1-206ENST00000409214 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
MIS18AQ9NYP9 PLS3-203ENST00000420625 3150 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
MIS18AQ9NYP9 AL627171.1-201ENST00000618845 1308 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
MIS18AQ9NYP9 MTCO1P12-201ENST00000414273 1543 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
MIS18AQ9NYP9 ANKRD20A10P-201ENST00000457591 1515 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
MIS18AQ9NYP9 APC-207ENST00000508376 10619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
MIS18AQ9NYP9 G2E3-201ENST00000206595 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
MIS18AQ9NYP9 ZBBX-202ENST00000392764 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
MIS18AQ9NYP9 FAM111B-202ENST00000411426 3344 ntTSL 4 BASIC4.72□□□□□ -1.65
MIS18AQ9NYP9 TSPAN8-201ENST00000247829 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
MIS18AQ9NYP9 QKI-202ENST00000361195 1063 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
MIS18AQ9NYP9 RANP4-201ENST00000413361 655 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
MIS18AQ9NYP9 AC017079.2-201ENST00000416102 485 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
MIS18AQ9NYP9 HIGD1AP12-201ENST00000427832 281 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
MIS18AQ9NYP9 RPL21P23-201ENST00000446654 460 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
MIS18AQ9NYP9 AL157827.1-201ENST00000447622 132 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
MIS18AQ9NYP9 AL500527.1-201ENST00000448532 255 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
MIS18AQ9NYP9 AP000302.1-201ENST00000450928 666 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
MIS18AQ9NYP9 RPS4XP10-201ENST00000465034 731 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
MIS18AQ9NYP9 RPL23AP12-201ENST00000467573 473 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
MIS18AQ9NYP9 AC105924.1-201ENST00000504057 339 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
MIS18AQ9NYP9 AC106864.1-201ENST00000510655 640 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
MIS18AQ9NYP9 RNU6-1308P-201ENST00000516817 103 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
MIS18AQ9NYP9 AC008802.1-201ENST00000519121 791 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
MIS18AQ9NYP9 DUXAP2-201ENST00000519198 589 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
MIS18AQ9NYP9 AL355432.1-201ENST00000522960 564 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
MIS18AQ9NYP9 AC091814.1-201ENST00000545258 719 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
MIS18AQ9NYP9 LINC00557-201ENST00000563184 1279 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
MIS18AQ9NYP9 RN7SL339P-201ENST00000580597 296 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
MIS18AQ9NYP9 AC040174.2-201ENST00000602701 465 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
MIS18AQ9NYP9 U3.45-201ENST00000607547 219 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
MIS18AQ9NYP9 AC023813.4-201ENST00000607580 580 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
MIS18AQ9NYP9 AL355802.4-201ENST00000607635 548 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
MIS18AQ9NYP9 BMS1P21-201ENST00000634565 365 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
MIS18AQ9NYP9 CASC1-203ENST00000395987 2363 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
MIS18AQ9NYP9 FAT3-204ENST00000525166 18699 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
MIS18AQ9NYP9 MBD5-212ENST00000627651 5610 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
MIS18AQ9NYP9 LRMP-201ENST00000354454 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
MIS18AQ9NYP9 DOCK7-202ENST00000340370 6731 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
MIS18AQ9NYP9 ASAH2-201ENST00000329428 2184 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.65
MIS18AQ9NYP9 TRDN-206ENST00000628709 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
MIS18AQ9NYP9 RBBP6-203ENST00000381039 3384 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
MIS18AQ9NYP9 SKIL-201ENST00000259119 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
MIS18AQ9NYP9 GKN2-201ENST00000328895 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
MIS18AQ9NYP9 MIR218-2-201ENST00000385006 110 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.9 ms