Protein–RNA interactions for Protein: Q14C86

GAPVD1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPVD1Q14C86 ELOCP8-201ENST00000439309 332 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
GAPVD1Q14C86 HMGB3P9-201ENST00000441799 583 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
GAPVD1Q14C86 ELOCP15-201ENST00000442090 332 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
GAPVD1Q14C86 AC098851.1-201ENST00000476561 570 ntTSL 4 BASIC5.64□□□□□ -1.51
GAPVD1Q14C86 AC021678.1-201ENST00000505195 936 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
GAPVD1Q14C86 AC055720.1-201ENST00000539552 475 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
GAPVD1Q14C86 AC009019.1-202ENST00000568410 405 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
GAPVD1Q14C86 DSCR9-205ENST00000585273 751 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
GAPVD1Q14C86 HNRNPDLP4-201ENST00000605144 301 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
GAPVD1Q14C86 AC097478.4-201ENST00000615968 522 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
GAPVD1Q14C86 POSTN-202ENST00000379743 3196 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
GAPVD1Q14C86 ORC4-216ENST00000540442 6472 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
GAPVD1Q14C86 NKTR-219ENST00000617821 7319 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
GAPVD1Q14C86 ZNF445-201ENST00000396077 18299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
GAPVD1Q14C86 HNMT-202ENST00000280097 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
GAPVD1Q14C86 VPS13C-202ENST00000261517 13400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
GAPVD1Q14C86 OR10AG1-202ENST00000641071 2807 ntAPPRIS P1 BASIC5.64□□□□□ -1.51
GAPVD1Q14C86 RNU1-18P-201ENST00000363062 164 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
GAPVD1Q14C86 ZFY-AS1-202ENST00000431145 419 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
GAPVD1Q14C86 AC005002.1-201ENST00000447458 540 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
GAPVD1Q14C86 CCDC75P1-201ENST00000469247 791 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
GAPVD1Q14C86 PDLIM1P4-201ENST00000504327 1006 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
GAPVD1Q14C86 LINC02112-202ENST00000512976 464 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
GAPVD1Q14C86 snoU109.6-201ENST00000516831 118 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
GAPVD1Q14C86 AP001318.2-201ENST00000533378 492 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
GAPVD1Q14C86 OR2AS2P-201ENST00000606902 342 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
GAPVD1Q14C86 AP003392.5-201ENST00000607857 415 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
GAPVD1Q14C86 AL669942.2-201ENST00000620352 697 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
GAPVD1Q14C86 HSPA8P17-201ENST00000427029 1382 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
GAPVD1Q14C86 AL365214.2-201ENST00000433684 1365 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
GAPVD1Q14C86 CHD9-221ENST00000615216 10603 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
GAPVD1Q14C86 ADGRL2-201ENST00000319517 5479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
GAPVD1Q14C86 OR4S2-202ENST00000641692 2211 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
GAPVD1Q14C86 AL022311.1-201ENST00000623726 19416 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
GAPVD1Q14C86 SCN2A-202ENST00000375427 8553 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
GAPVD1Q14C86 AC097634.1-201ENST00000604491 2467 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
GAPVD1Q14C86 TNPO1P3-201ENST00000436471 2662 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
GAPVD1Q14C86 CNOT10-206ENST00000454516 2760 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
GAPVD1Q14C86 MIR422A-201ENST00000362286 90 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
GAPVD1Q14C86 RNA5SP306-201ENST00000411087 107 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
GAPVD1Q14C86 HMGN1P24-201ENST00000412282 298 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
GAPVD1Q14C86 AL353705.1-201ENST00000433468 480 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
GAPVD1Q14C86 BX119904.2-201ENST00000446495 512 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
GAPVD1Q14C86 AC123023.1-201ENST00000455974 555 ntTSL 4 BASIC5.63□□□□□ -1.51
GAPVD1Q14C86 Y_RNA.638-201ENST00000459374 113 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
GAPVD1Q14C86 COX6B1P6-201ENST00000522347 255 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
GAPVD1Q14C86 AC009623.2-201ENST00000522524 465 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
GAPVD1Q14C86 AC099313.1-201ENST00000568437 452 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
GAPVD1Q14C86 AC002546.2-201ENST00000585537 584 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
GAPVD1Q14C86 ATP5A1P2-202ENST00000616464 443 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
GAPVD1Q14C86 OTUD4P1-201ENST00000237841 3067 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
GAPVD1Q14C86 SMARCA2-201ENST00000302401 2242 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
GAPVD1Q14C86 MTFR1-203ENST00000458689 2500 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
GAPVD1Q14C86 OTOGL-202ENST00000458043 8083 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
GAPVD1Q14C86 ODAM-201ENST00000396094 1319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
GAPVD1Q14C86 ABI3BP-206ENST00000471714 6783 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
GAPVD1Q14C86 CCNH-206ENST00000508855 2391 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
GAPVD1Q14C86 TMEM106B-201ENST00000396667 12539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
GAPVD1Q14C86 RNA5SP42-201ENST00000364278 115 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
GAPVD1Q14C86 RNA5-8SP4-201ENST00000365096 150 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
GAPVD1Q14C86 MIR1261-201ENST00000408659 82 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
GAPVD1Q14C86 LINC01709-201ENST00000415532 634 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
GAPVD1Q14C86 AL353678.1-201ENST00000422735 741 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
GAPVD1Q14C86 BX276092.4-201ENST00000452056 248 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
GAPVD1Q14C86 SEC22A-207ENST00000481965 673 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
GAPVD1Q14C86 RFPL4AP5-201ENST00000514977 504 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
GAPVD1Q14C86 AP006245.1-201ENST00000522549 120 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
GAPVD1Q14C86 AC018442.3-201ENST00000523025 183 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
GAPVD1Q14C86 AC006518.2-202ENST00000544947 297 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
GAPVD1Q14C86 RNVU1-4-201ENST00000612985 164 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
GAPVD1Q14C86 AL139220.2-223ENST00000625982 921 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
GAPVD1Q14C86 PDE10A-201ENST00000366882 8233 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
GAPVD1Q14C86 TET2-203ENST00000380013 9679 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
GAPVD1Q14C86 ARHGAP11A-207ENST00000565905 3318 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
GAPVD1Q14C86 CCDC82-201ENST00000278520 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
GAPVD1Q14C86 CRB1-201ENST00000367397 9023 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
GAPVD1Q14C86 LRP6-201ENST00000261349 10020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
GAPVD1Q14C86 CFTR-201ENST00000003084 6132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
GAPVD1Q14C86 AC093274.1-201ENST00000503488 5454 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
GAPVD1Q14C86 MS4A1-212ENST00000534668 3475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
GAPVD1Q14C86 CRP-203ENST00000368111 512 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
GAPVD1Q14C86 AC007271.1-201ENST00000428188 382 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
GAPVD1Q14C86 AL121890.1-201ENST00000435457 205 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
GAPVD1Q14C86 KLKP1-201ENST00000595979 403 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
GAPVD1Q14C86 IGHV3-29-201ENST00000604817 344 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
GAPVD1Q14C86 AL732372.2-225ENST00000642124 456 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
GAPVD1Q14C86 OR8D1-202ENST00000641015 8286 ntAPPRIS P1 BASIC5.61□□□□□ -1.51
GAPVD1Q14C86 GHR-209ENST00000612626 4524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
GAPVD1Q14C86 ZFHX4-207ENST00000521891 14019 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
GAPVD1Q14C86 FAM35BP-202ENST00000497389 3337 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
GAPVD1Q14C86 GCSAML-202ENST00000366489 4030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
GAPVD1Q14C86 PTPRC-209ENST00000442510 5164 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
GAPVD1Q14C86 ATP13A3-211ENST00000619199 5227 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
GAPVD1Q14C86 TIGD2-201ENST00000317005 2083 ntAPPRIS P1 BASIC5.6□□□□□ -1.51
GAPVD1Q14C86 TATDN1-201ENST00000276692 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
GAPVD1Q14C86 Z97206.2-201ENST00000423489 589 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
GAPVD1Q14C86 RPL23AP69-201ENST00000431134 458 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
GAPVD1Q14C86 AC084357.1-201ENST00000473404 255 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
GAPVD1Q14C86 AC112198.1-201ENST00000505369 1220 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
GAPVD1Q14C86 AC026888.1-201ENST00000553348 559 ntTSL 4 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 147.4 ms