Protein–RNA interactions for Protein: Q13772

NCOA4, Nuclear receptor coactivator 4, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA4Q13772 GRIK1-201ENST00000327783 3179 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
NCOA4Q13772 GPR65-201ENST00000267549 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
NCOA4Q13772 AC018628.1-201ENST00000624147 3819 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
NCOA4Q13772 ZNF724-201ENST00000418100 2764 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
NCOA4Q13772 SERPINI2-201ENST00000264677 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
NCOA4Q13772 AC019197.1-201ENST00000638199 3611 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
NCOA4Q13772 CLASP2-205ENST00000461133 4814 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
NCOA4Q13772 SPATA1-206ENST00000490879 2888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
NCOA4Q13772 C3orf14-201ENST00000232519 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
NCOA4Q13772 TSLP-201ENST00000344895 736 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
NCOA4Q13772 SNORA63C-201ENST00000364578 129 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
NCOA4Q13772 AC117402.1-202ENST00000383686 820 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
NCOA4Q13772 RNU6-1207P-201ENST00000384343 107 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
NCOA4Q13772 SNORA75.4-201ENST00000391278 119 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
NCOA4Q13772 AL360271.1-201ENST00000395679 510 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
NCOA4Q13772 RNU6-193P-201ENST00000410977 107 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
NCOA4Q13772 RPL35AP31-201ENST00000418340 337 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
NCOA4Q13772 MS4A6A-202ENST00000420732 863 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
NCOA4Q13772 AC012065.2-201ENST00000421295 375 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
NCOA4Q13772 AC078960.1-201ENST00000422160 177 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
NCOA4Q13772 NCOA7-AS1-201ENST00000429007 501 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
NCOA4Q13772 AL590233.1-201ENST00000430017 456 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
NCOA4Q13772 AL683807.1-202ENST00000432272 382 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
NCOA4Q13772 ERLEC1P1-201ENST00000433806 578 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
NCOA4Q13772 H3F3BP1-201ENST00000440551 403 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
NCOA4Q13772 HCG14-201ENST00000444986 413 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
NCOA4Q13772 LARGE-IT1-201ENST00000445391 558 ntTSL 4 BASIC6.59□□□□□ -1.35
NCOA4Q13772 OR7E116P-201ENST00000448529 957 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
NCOA4Q13772 AC007557.1-201ENST00000451711 541 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
NCOA4Q13772 snoU13.8-201ENST00000458890 104 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
NCOA4Q13772 AC006512.1-201ENST00000468816 291 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
NCOA4Q13772 AC087879.1-201ENST00000474343 374 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
NCOA4Q13772 AC055855.1-201ENST00000489563 579 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
NCOA4Q13772 AC114797.1-201ENST00000514003 728 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
NCOA4Q13772 AC105417.1-201ENST00000514691 285 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
NCOA4Q13772 RNU4-29P-201ENST00000515943 174 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
NCOA4Q13772 AC026765.1-201ENST00000547876 435 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
NCOA4Q13772 AC090651.1-201ENST00000567865 634 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
NCOA4Q13772 AC002128.2-201ENST00000604161 618 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
NCOA4Q13772 AL662844.3-201ENST00000606909 517 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
NCOA4Q13772 uc_338.12-201ENST00000616344 181 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
NCOA4Q13772 FAM27E2-201ENST00000619668 403 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
NCOA4Q13772 AC079597.1-201ENST00000624306 508 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
NCOA4Q13772 UOX-205ENST00000640983 544 ntTSL 4 BASIC6.59□□□□□ -1.35
NCOA4Q13772 BICRAL-202ENST00000394168 6515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
NCOA4Q13772 LNX2-201ENST00000316334 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
NCOA4Q13772 SLC2A14-221ENST00000616981 3366 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
NCOA4Q13772 STYX-202ENST00000442123 4554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
NCOA4Q13772 ICE2-201ENST00000261520 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
NCOA4Q13772 SV2B-202ENST00000394232 11279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
NCOA4Q13772 VNN3-207ENST00000425515 1761 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
NCOA4Q13772 SATB1-209ENST00000454909 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
NCOA4Q13772 OR6Y1-202ENST00000641282 3702 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.36
NCOA4Q13772 ZCCHC6-201ENST00000277141 5724 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.36
NCOA4Q13772 RNF17-204ENST00000339524 2203 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
NCOA4Q13772 FABP2-201ENST00000274024 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
NCOA4Q13772 NXF3-201ENST00000395065 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
NCOA4Q13772 FAM114A2-210ENST00000520313 1394 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
NCOA4Q13772 UTP15-208ENST00000543251 4922 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
NCOA4Q13772 WDCP-201ENST00000295148 3817 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
NCOA4Q13772 ASNSP3-201ENST00000451989 1306 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
NCOA4Q13772 ST7-203ENST00000393443 2360 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
NCOA4Q13772 DMD-228ENST00000541735 7080 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
NCOA4Q13772 NAPEPLD-203ENST00000417955 4988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
NCOA4Q13772 AC073343.1-201ENST00000328239 651 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
NCOA4Q13772 RNU1-134P-201ENST00000362935 165 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
NCOA4Q13772 Y_RNA.216-201ENST00000364205 93 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
NCOA4Q13772 Y_RNA.259-201ENST00000364619 101 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
NCOA4Q13772 CRP-204ENST00000368112 787 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
NCOA4Q13772 LINC00587-201ENST00000374801 590 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
NCOA4Q13772 RNU6-1160P-201ENST00000384546 104 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
NCOA4Q13772 U3.20-201ENST00000390909 217 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
NCOA4Q13772 AC099535.1-201ENST00000408928 371 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
NCOA4Q13772 AL031674.1-202ENST00000413070 465 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
NCOA4Q13772 AL096829.1-201ENST00000413677 457 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
NCOA4Q13772 AF064858.3-201ENST00000419664 509 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
NCOA4Q13772 MTCO2P27-201ENST00000420740 428 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
NCOA4Q13772 AL451054.2-201ENST00000420896 202 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
NCOA4Q13772 NMD3P2-201ENST00000421815 761 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
NCOA4Q13772 AL157786.1-206ENST00000424422 551 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
NCOA4Q13772 GTF2IP13-201ENST00000438487 386 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
NCOA4Q13772 Z80107.2-201ENST00000445127 392 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
NCOA4Q13772 LINC01645-201ENST00000451341 491 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
NCOA4Q13772 MTND3P16-201ENST00000452205 344 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
NCOA4Q13772 AL358612.1-201ENST00000452911 481 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
NCOA4Q13772 AL109763.1-201ENST00000455391 461 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
NCOA4Q13772 RN7SL741P-201ENST00000482473 289 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
NCOA4Q13772 RN7SL649P-201ENST00000496974 275 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
NCOA4Q13772 AC027613.1-201ENST00000508414 457 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
NCOA4Q13772 RNU4ATAC8P-201ENST00000516196 109 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
NCOA4Q13772 SNORD27.1-201ENST00000516319 72 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
NCOA4Q13772 RNA5SP473-201ENST00000516402 125 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
NCOA4Q13772 CCND2-AS2-201ENST00000537370 495 ntTSL 4 BASIC6.58□□□□□ -1.36
NCOA4Q13772 RERG-IT1-201ENST00000539734 301 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
NCOA4Q13772 AC087477.4-201ENST00000560586 542 ntTSL 4 BASIC6.58□□□□□ -1.36
NCOA4Q13772 AC010325.1-202ENST00000562076 279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
NCOA4Q13772 AP005119.1-201ENST00000580956 292 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
NCOA4Q13772 AC011476.3-202ENST00000586845 553 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
NCOA4Q13772 LINC01999-201ENST00000592917 646 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
NCOA4Q13772 LINC01198-204ENST00000594153 552 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
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