Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 RNU4-55P-201ENST00000410731 137 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 LINC01312-201ENST00000412745 775 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 FO393401.1-203ENST00000416260 486 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 ODF2-AS1-201ENST00000420801 407 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 AL132796.1-201ENST00000421617 479 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 AC003084.1-201ENST00000427030 435 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 BX890604.2-201ENST00000427883 474 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 UBXN7-204ENST00000428095 1173 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 BX323845.3-201ENST00000428215 527 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 NPM1P34-201ENST00000428821 893 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 AC109583.1-201ENST00000432156 268 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 AL358934.1-201ENST00000432346 324 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 TCF7L1-IT1-201ENST00000433581 458 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 GAPDHP48-201ENST00000436626 961 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 RPL7P11-201ENST00000437586 658 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 SKP1P1-201ENST00000438081 489 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 AC092162.2-201ENST00000438143 532 ntTSL 4 BASIC5.12□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 AL137186.1-201ENST00000440436 480 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 PGBD4P3-201ENST00000440731 581 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 DPP10-AS2-201ENST00000446992 624 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 ACA64.1-201ENST00000459171 127 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 RPL23AP12-201ENST00000467573 473 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 RPL7P6-201ENST00000480903 738 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 RN7SL273P-201ENST00000481561 299 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 AC093809.1-201ENST00000509155 340 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 AC107396.1-201ENST00000509641 735 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 AC069272.1-201ENST00000514843 680 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 Y_RNA.667-201ENST00000516212 107 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 RNA5SP438-201ENST00000516561 112 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 RNU6-358P-201ENST00000516564 75 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 IGLVVI-25-1-201ENST00000521893 249 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 AP006245.2-201ENST00000522004 300 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 UQCRB-209ENST00000523920 695 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 AK6P1-201ENST00000540219 478 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 AC008083.3-201ENST00000547777 329 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 AC009803.2-201ENST00000550378 665 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 PCED1B-AS1-210ENST00000552975 378 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 LINC02563-201ENST00000579474 277 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 AC090616.5-202ENST00000582111 297 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 MIR4260-201ENST00000583107 67 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 H3F3BP2-201ENST00000583907 357 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 AL157938.2-204ENST00000589667 826 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 ZNF528-211ENST00000598192 625 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 AC092364.1-201ENST00000598561 471 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 AC104785.1-201ENST00000603220 588 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 AL022238.2-202ENST00000607915 658 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 AL359091.2-201ENST00000609303 556 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 AC126175.1-201ENST00000617041 758 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 AP003400.3-201ENST00000624904 346 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 AC092329.4-204ENST00000639327 549 ntTSL 4 BASIC5.12□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 MYBPC1-202ENST00000361685 3871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 ZNF347-202ENST00000452676 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 ZNF83-204ENST00000545872 2633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 PATE4-201ENST00000457514 1983 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 ZNF652P1-201ENST00000442420 1309 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 CDC14A-206ENST00000635056 2056 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 OBSCN-214ENST00000636875 23907 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 AC022893.1-201ENST00000517664 3549 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 HSFY2-201ENST00000304790 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 HSFY1-201ENST00000307393 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 AL022578.1-201ENST00000439330 1433 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 CUL3-216ENST00000617432 1426 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 AC131971.1-201ENST00000332881 1482 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 MTUS1-201ENST00000262102 6160 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 PCGEM1-201ENST00000454040 1590 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 PTK2-206ENST00000517712 3351 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 ZNF107-201ENST00000344930 5174 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 AC000374.1-201ENST00000434698 1745 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 PIGK-203ENST00000445065 4318 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 AC100757.1-201ENST00000616872 1835 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 ATRX-201ENST00000373344 11220 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 IFI16-201ENST00000295809 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 PLEKHG7-201ENST00000344636 3868 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 PKHD1-202ENST00000371117 16282 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 IQCH-202ENST00000358767 3062 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 ERP27-201ENST00000266397 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 VNN2-201ENST00000326499 2118 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 RIF1-203ENST00000428287 7722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 KLHL4-202ENST00000373119 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 PIGA-206ENST00000542278 3626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 EDDM3A-201ENST00000326842 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 RNA5SP273-201ENST00000362484 113 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 RNA5SP477-201ENST00000362639 119 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 SPANXN1-201ENST00000370493 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 RNU6-225P-201ENST00000384613 103 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 RNU6-1009P-201ENST00000390996 107 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 snosnR66.1-201ENST00000391095 99 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 C1GALT1-202ENST00000402468 930 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 RNU2-28P-201ENST00000410457 189 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 AC098820.3-201ENST00000414135 976 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 EEF1A1P29-201ENST00000416082 1096 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 HAO2-IT1-201ENST00000419144 311 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 AL513174.1-201ENST00000423182 629 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 RWDD4P2-201ENST00000426392 563 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 AP000695.2-201ENST00000428667 715 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 DYNLL1P7-201ENST00000429273 258 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 AC076966.1-201ENST00000435560 351 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 GAPDHP17-201ENST00000449858 1001 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 AL672138.1-201ENST00000450604 1015 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 AL035409.1-201ENST00000454305 497 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 144.7 ms