Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 AL732323.1-201ENST00000445897 456 ntTSL 3 BASIC4.41□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 AL031313.1-201ENST00000448435 256 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 AC068492.1-201ENST00000448672 469 ntTSL 3 BASIC4.41□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 AL121718.1-201ENST00000449463 387 ntTSL 3 BASIC4.41□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 AC112492.1-201ENST00000449607 712 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 ARL13A-202ENST00000450049 1102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 GJE1-201ENST00000450456 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 AC013460.1-205ENST00000450695 518 ntTSL 4 BASIC4.41□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 RBBP6-204ENST00000452655 854 ntTSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 FO393401.1-201ENST00000453914 600 ntTSL 3 BASIC4.41□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 AL356981.1-201ENST00000454879 684 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 BTBD11-206ENST00000494235 811 ntTSL 2 BASIC4.41□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 AC012170.1-201ENST00000495139 359 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 AC112198.3-201ENST00000505950 441 ntTSL 3 BASIC4.41□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 AC011396.2-202ENST00000511390 375 ntTSL 3 BASIC4.41□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 AC002428.2-201ENST00000522973 414 ntTSL 3 BASIC4.41□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 AP001330.2-201ENST00000523121 979 ntTSL 2 BASIC4.41□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 PRB1-204ENST00000546254 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 AC091073.1-201ENST00000559620 666 ntTSL 3 BASIC4.41□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 AC093249.4-201ENST00000564755 259 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 RN7SL652P-201ENST00000577769 300 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 AC105094.2-203ENST00000590357 555 ntTSL 4 BASIC4.41□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 BNIP3P40-201ENST00000596017 556 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 AL020997.2-201ENST00000602607 184 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 GAS5-AS1-201ENST00000602767 694 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 AC083899.3-201ENST00000603413 594 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 AL009028.1-201ENST00000604895 802 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 AL356218.2-201ENST00000605264 187 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 RNA5SP108-201ENST00000605921 117 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 AC026979.4-201ENST00000606555 645 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 PLCE1-AS2-213ENST00000620469 432 ntTSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 SLC38A2-209ENST00000551374 2802 ntTSL 2 BASIC4.41□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 CCDC68-201ENST00000337363 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.41□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 IMPG2-201ENST00000193391 8337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 RNMT-209ENST00000592764 4108 ntTSL 2 BASIC4.41□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 PIK3C3-217ENST00000639914 2722 ntTSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 PATJ-213ENST00000613764 4172 ntTSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 DLD-204ENST00000437604 1859 ntTSL 2 BASIC4.41□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 AL592148.3-201ENST00000608771 2646 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 MACF1-203ENST00000361689 17538 ntTSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 STXBP4-204ENST00000434978 2807 ntTSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 ADNP-201ENST00000349014 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 AP005901.5-201ENST00000545779 1796 ntBASIC4.4□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 AC100778.3-201ENST00000580060 1750 ntBASIC4.4□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 C4orf17-204ENST00000514652 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 KIF15-203ENST00000425755 3460 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 CHD9-221ENST00000615216 10603 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 MPDZ-211ENST00000536827 6176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 CUL3-216ENST00000617432 1426 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 LINC01847-201ENST00000522627 5607 ntTSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 YWHAZ-201ENST00000353245 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.7
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CHAF1BQ13112 SNORD65.1-201ENST00000390889 71 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 RNU6-1300P-201ENST00000391046 108 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 RN7SKP267-201ENST00000410381 285 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 ELOCP19-201ENST00000411919 318 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 RPL17P36-201ENST00000420302 549 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 AC104333.2-201ENST00000422630 192 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 BBIP1-203ENST00000423273 492 ntTSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 GTF2IP7-202ENST00000436677 309 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 AC241584.1-201ENST00000438469 1241 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 AC004854.1-201ENST00000440356 349 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 GTF3AP5-201ENST00000442645 697 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 AL590399.6-201ENST00000446396 307 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 BBIP1-206ENST00000447005 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.4□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 VPS29-202ENST00000447578 996 ntTSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 AC002383.1-201ENST00000448260 671 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 AC079168.2-201ENST00000453977 416 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 RPL7AP28-201ENST00000464513 571 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 APOA2-207ENST00000470459 416 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 RN7SL41P-201ENST00000476144 297 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 AC096734.1-201ENST00000511279 1128 ntTSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
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CHAF1BQ13112 RNU4-60P-201ENST00000517239 135 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 AC108515.1-201ENST00000517407 525 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
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CHAF1BQ13112 AF233439.1-201ENST00000526235 401 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 AL353699.1-201ENST00000529078 365 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 RAD51AP1-213ENST00000544927 787 ntTSL 4 BASIC4.4□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 AC092470.1-201ENST00000546187 132 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
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CHAF1BQ13112 AC103739.1-201ENST00000558389 474 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 AC069061.3-201ENST00000582254 823 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 OR4G1P-201ENST00000588632 938 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 AC245884.10-201ENST00000597355 337 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 AC005962.2-201ENST00000611427 652 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 AL121895.2-201ENST00000619558 447 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 AL049536.1-201ENST00000625043 744 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 AC026634.1-201ENST00000634369 198 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 Z99496.1-201ENST00000469424 1477 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 CTSS-201ENST00000368985 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 CDH8-205ENST00000577730 8009 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 ARHGAP28-202ENST00000314319 5415 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 FAP-203ENST00000443424 2598 ntTSL 2 BASIC4.4□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 AL672167.1-204ENST00000641875 3017 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 AL445487.1-201ENST00000415694 1580 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 MTCO1P24-201ENST00000515438 1558 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 TJP1-204ENST00000400011 6764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 AC139713.2-215ENST00000641428 5037 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 OXR1-201ENST00000297447 1944 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
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