Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 RNU1-6P-201ENST00000516290 144 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
GPS1Q13098 RNU6-1261P-201ENST00000517194 104 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
GPS1Q13098 AC027309.2-201ENST00000520566 192 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
GPS1Q13098 AC013714.1-201ENST00000524707 747 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
GPS1Q13098 NAP1L1P1-201ENST00000524793 1063 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
GPS1Q13098 GSTP1P1-201ENST00000548078 319 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
GPS1Q13098 NOVA1-AS1-203ENST00000552101 468 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
GPS1Q13098 LINC02345-201ENST00000557883 766 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
GPS1Q13098 NR2F2-AS1-208ENST00000560395 441 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
GPS1Q13098 AL032819.1-201ENST00000568554 379 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
GPS1Q13098 AC130371.1-204ENST00000576197 401 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
GPS1Q13098 AC011824.2-203ENST00000579975 633 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
GPS1Q13098 AC023394.2-201ENST00000581987 792 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
GPS1Q13098 AL163642.2-201ENST00000604722 1019 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
GPS1Q13098 AC124312.4-201ENST00000605533 310 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
GPS1Q13098 FAM27B-201ENST00000610601 213 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
GPS1Q13098 ZNF75A-210ENST00000617839 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
GPS1Q13098 C2orf83-206ENST00000642055 453 ntAPPRIS P3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
GPS1Q13098 ING3-205ENST00000445699 1723 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
GPS1Q13098 PTRH2-203ENST00000470557 4114 ntAPPRIS P3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
GPS1Q13098 GABRG2-217ENST00000639384 5360 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
GPS1Q13098 CUL2-209ENST00000537177 4271 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
GPS1Q13098 SMAD5-212ENST00000545620 6937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
GPS1Q13098 SOS1-203ENST00000426016 8517 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
GPS1Q13098 CDR1-202ENST00000625883 1485 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
GPS1Q13098 AL031119.1-201ENST00000404707 1879 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
GPS1Q13098 JCHAIN-206ENST00000543780 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
GPS1Q13098 USP26-203ENST00000511190 3665 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
GPS1Q13098 PRUNE2-208ENST00000443509 12356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
GPS1Q13098 AL158212.2-201ENST00000369391 460 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
GPS1Q13098 TXNDC8-202ENST00000374510 455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
GPS1Q13098 BANF2-202ENST00000377805 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
GPS1Q13098 OR1A2-201ENST00000381951 930 ntAPPRIS P1 BASIC4.81□□□□□ -1.64
GPS1Q13098 DEFB113-201ENST00000398718 249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
GPS1Q13098 DEFB115-201ENST00000400552 267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
GPS1Q13098 AL589647.1-201ENST00000402485 466 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
GPS1Q13098 AL121978.1-201ENST00000402778 359 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
GPS1Q13098 TPT1P2-201ENST00000413105 503 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
GPS1Q13098 RBMS3-AS1-201ENST00000414547 554 ntTSL 4 BASIC4.81□□□□□ -1.64
GPS1Q13098 SPATA17-AS1-201ENST00000415765 420 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
GPS1Q13098 TRBV24OR9-2-201ENST00000416632 435 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
GPS1Q13098 AC009299.3-201ENST00000421122 1072 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
GPS1Q13098 TXNDC8-204ENST00000423740 356 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
GPS1Q13098 KCNIP1-205ENST00000434108 726 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
GPS1Q13098 AC008072.1-201ENST00000434254 824 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
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GPS1Q13098 AC112498.1-201ENST00000444401 332 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
GPS1Q13098 AC009299.3-202ENST00000445372 538 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
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GPS1Q13098 MFAP5-211ENST00000540087 492 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
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GPS1Q13098 uc_338.18-201ENST00000615451 175 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
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GPS1Q13098 PPP1R9A-205ENST00000424654 4058 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
GPS1Q13098 ACKR4-201ENST00000249887 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
GPS1Q13098 EOGT-210ENST00000615922 1931 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
GPS1Q13098 DAZ1-205ENST00000540248 3268 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
GPS1Q13098 RAG2-209ENST00000618712 2818 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.81□□□□□ -1.64
GPS1Q13098 NCLP2-201ENST00000416078 1462 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
GPS1Q13098 AC007681.1-201ENST00000604271 3438 ntTSL 4 BASIC4.81□□□□□ -1.64
GPS1Q13098 TDO2-208ENST00000536354 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
GPS1Q13098 ATP2C1-212ENST00000507488 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
GPS1Q13098 CFHR3-205ENST00000471440 1965 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
GPS1Q13098 C2CD6-204ENST00000450242 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
GPS1Q13098 DDX20-202ENST00000475700 4332 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
GPS1Q13098 FLJ46284-201ENST00000504861 3421 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
GPS1Q13098 AL442639.1-201ENST00000625030 1899 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
GPS1Q13098 MTRNR2L11-201ENST00000604646 1552 ntAPPRIS P1 BASIC4.8□□□□□ -1.64
GPS1Q13098 SOBP-204ENST00000618129 1550 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
GPS1Q13098 SAMMSON-226ENST00000642089 1582 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
GPS1Q13098 AC011155.1-201ENST00000316512 456 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
GPS1Q13098 ANK3-202ENST00000355288 3811 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
GPS1Q13098 ARGLU1-202ENST00000375926 821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
GPS1Q13098 TRAJ58-201ENST00000390481 63 ntAPPRIS P1 BASIC4.8□□□□□ -1.64
GPS1Q13098 AC093162.1-201ENST00000419682 124 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
GPS1Q13098 AC006076.1-201ENST00000423233 345 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
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