Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 AC107023.1-201ENST00000552757 356 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 CFL2-206ENST00000556161 546 ntTSL 4 BASIC4.54□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 CLMN-206ENST00000556441 452 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 AC022196.1-202ENST00000559570 462 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 AL032819.1-201ENST00000568554 379 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 MYLK-221ENST00000583087 678 ntTSL 4 BASIC4.54□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 AC007448.2-201ENST00000583452 380 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 MIR7853-201ENST00000584820 132 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 AC002546.2-201ENST00000585537 584 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 SLC14A2-AS1-203ENST00000592286 528 ntTSL 4 BASIC4.54□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 AC044792.1-201ENST00000593294 196 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 AC105254.2-201ENST00000603636 436 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 AC087045.1-201ENST00000605856 382 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 MIR6748-201ENST00000610433 71 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 AC010632.3-201ENST00000611377 369 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 AC087385.3-201ENST00000620477 187 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 AC073348.1-201ENST00000623002 331 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 LINC01361-202ENST00000452834 1526 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 AP001029.2-203ENST00000589795 4910 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 PPARGC1A-201ENST00000264867 6318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 KLHL28-201ENST00000355081 2177 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 EXPH5-201ENST00000265843 10187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 PRPF4B-201ENST00000337659 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 PABPC1P9-201ENST00000426076 1612 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 AC008691.1-207ENST00000636819 4154 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 MAP2-205ENST00000392194 5303 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 SCN1A-209ENST00000635750 8299 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 SAGE1-203ENST00000537770 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 FASTKD2-201ENST00000236980 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 BX088651.2-201ENST00000425493 3614 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 MNDA-201ENST00000368141 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 APAF1-205ENST00000547045 3744 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 KIAA0408-204ENST00000483725 3284 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 COPB2-205ENST00000507777 3034 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 SPAG11A-202ENST00000326625 445 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 Y_RNA.302-201ENST00000364997 102 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 CFAP126-201ENST00000367974 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 GEN1-202ENST00000381254 6367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 MIR217-201ENST00000384817 110 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 IGLJ6-201ENST00000390328 70 ntAPPRIS P1 BASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 TRAJ35-201ENST00000390502 59 ntAPPRIS P1 BASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 CIR1P3-201ENST00000405137 479 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 AL590002.1-201ENST00000406554 418 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 LINC00364-201ENST00000415120 611 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 CHEK2P3-201ENST00000416118 248 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 USP9YP20-201ENST00000419224 558 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 MTCYBP24-201ENST00000420387 1106 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 DYDC1-203ENST00000421924 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 AC233728.2-201ENST00000425348 757 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 LINC01799-202ENST00000426260 625 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 BLOC1S2P1-201ENST00000428431 301 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 RPL31P54-201ENST00000429803 370 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 HTR2A-AS1-201ENST00000430913 429 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 AL049745.1-201ENST00000433953 286 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 FKBP7-205ENST00000434643 666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 LINC01423-202ENST00000436845 423 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 AL121957.1-201ENST00000441532 338 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 AL354794.1-201ENST00000442103 516 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 AC098824.1-201ENST00000453565 980 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 BX248409.1-201ENST00000455497 255 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 AC092832.2-201ENST00000456621 389 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 ARPC3P2-201ENST00000457786 533 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 AP000852.1-201ENST00000472460 573 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 RN7SL814P-201ENST00000487715 300 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 RPS4XP15-201ENST00000489210 795 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 RN7SL244P-201ENST00000493405 297 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 AC108941.1-201ENST00000502853 530 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 AC092546.1-202ENST00000505628 499 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 LINC02064-202ENST00000507876 403 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 AC002456.2-201ENST00000509356 380 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 AC107396.1-201ENST00000509641 735 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 COX6B1P5-201ENST00000509843 249 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 AC022483.1-201ENST00000514020 567 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 UBE2Q2P10-201ENST00000514854 900 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 AC097460.1-204ENST00000515026 764 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 RNU4ATAC18P-201ENST00000516179 126 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 SNORA20.3-201ENST00000516880 132 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 CDH12P4-201ENST00000517835 295 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 CDH12P3-201ENST00000517935 295 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 CDH12P1-201ENST00000518435 295 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 LINC01608-201ENST00000523557 544 ntTSL 4 BASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 AC008033.2-201ENST00000542626 177 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 AP002383.3-201ENST00000545958 593 ntTSL 4 BASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 PSMB7P1-201ENST00000556349 514 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 MIR548AB-201ENST00000584917 84 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 AC024592.1-202ENST00000590441 341 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 AC011487.3-201ENST00000593607 453 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 DARS-AS1-211ENST00000595061 720 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 INTS6-AS1-210ENST00000595424 301 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 MEMO1P5-201ENST00000604810 406 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 AP005432.2-201ENST00000608162 586 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 TTBK2-201ENST00000267890 10905 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 FCRL2-203ENST00000368181 1669 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 ZNF224-201ENST00000336976 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 IL31RA-204ENST00000396834 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 NHSL2-204ENST00000631375 12593 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 CEP295-206ENST00000531700 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 AL157700.1-201ENST00000561973 1432 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 AC011287.1-206ENST00000638774 2642 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 AC007996.1-201ENST00000620414 2821 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
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