Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 963 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 AC073348.1-201ENST00000623002 331 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 AC015871.5-202ENST00000623252 701 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 AC016717.3-201ENST00000624730 554 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 SMIM18-202ENST00000626298 114 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 AC092192.1-201ENST00000633154 1018 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 MYCT1-201ENST00000367245 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 ZNF12-203ENST00000404360 4474 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 SCN1A-220ENST00000641603 12506 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 AL033384.1-202ENST00000431554 3104 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 MED12L-201ENST00000273432 6401 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 MAPK6PS3-201ENST00000403865 2162 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 AC000123.3-201ENST00000624029 4975 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 PGM3-211ENST00000512866 2013 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 GRIK2-201ENST00000318991 4317 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 EIF4E3-202ENST00000389826 6083 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 MAPK10-208ENST00000395169 4049 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 ZFPM2-203ENST00000517361 3300 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 TEX43-201ENST00000357147 464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 RN7SKP224-201ENST00000364140 325 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.311-201ENST00000365068 96 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 AL078599.1-201ENST00000402075 293 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 AL512422.1-201ENST00000407033 553 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 MRPL30-202ENST00000409145 562 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 AC019064.1-201ENST00000414796 499 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 AL353608.1-201ENST00000419576 416 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 LINC01646-201ENST00000420522 682 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 CYCSP46-201ENST00000423569 204 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 MTCYBP5-201ENST00000423752 1135 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 CHEK2P5-201ENST00000423877 246 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 Z93242.1-201ENST00000427102 353 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 AL450992.2-201ENST00000434182 506 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 AC068533.3-201ENST00000435524 404 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 AL450023.3-201ENST00000440592 271 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 USP9YP29-201ENST00000445112 563 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 AC068492.1-201ENST00000448672 469 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 AC239809.1-201ENST00000450470 217 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 RPL5P32-201ENST00000454085 879 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 BX248409.1-201ENST00000455497 255 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 AC112204.2-201ENST00000503269 374 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 AC113347.4-201ENST00000506032 685 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 RNA5SP249-201ENST00000516127 99 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 RN7SKP260-201ENST00000516907 149 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 NRON-201ENST00000517270 370 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 RPL23AP53-201ENST00000521854 457 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 COX6B1P6-201ENST00000522347 255 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 AC118942.1-202ENST00000529081 578 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 AL139174.1-201ENST00000531489 886 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 SDHAF2-208ENST00000543265 438 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 MRPL42-203ENST00000547098 701 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 AC078880.2-201ENST00000547948 843 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 AC123905.1-201ENST00000552098 541 ntTSL 4 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 AC073591.1-201ENST00000552736 597 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 AC016526.2-201ENST00000554225 520 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 AC012181.3-201ENST00000565861 601 ntTSL 4 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 AC016747.2-201ENST00000605902 364 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 AC092354.1-201ENST00000606057 376 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 AL022238.2-202ENST00000607915 658 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 AC025594.3-201ENST00000613068 790 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 AC010678.1-201ENST00000614118 713 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 5_8S_rRNA.1-201ENST00000614365 152 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 RUVBL2-214ENST00000640699 153 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 AC134882.1-201ENST00000603738 1676 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 DCDC1-211ENST00000597505 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 LINC01419-201ENST00000522365 1521 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 XIST-204ENST00000429829 19275 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 ATP2C1-205ENST00000504381 3498 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 CLEC1B-204ENST00000428126 3054 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 LYST-202ENST00000389794 12985 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 ADGRG4-201ENST00000370652 9820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 RAP1B-201ENST00000250559 13438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 C9orf153-204ENST00000613665 1738 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 ALCAM-207ENST00000486979 1818 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 GABRA2-211ENST00000514090 3401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 LINC01619-203ENST00000549802 2169 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 RDH10-AS1-201ENST00000514599 3261 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 GBE1-205ENST00000489715 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 ZNF645-201ENST00000323684 1519 ntAPPRIS P1 BASIC4.74□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 HMGB1P5-201ENST00000255320 642 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 SNORA73.1-201ENST00000363107 205 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 SNORA75-201ENST00000384158 137 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 MIR1286-201ENST00000408112 78 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 Z86062.2-201ENST00000411442 380 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 AC068483.1-201ENST00000413403 660 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 AL136368.1-201ENST00000416249 401 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 AC114814.2-201ENST00000419195 485 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 MYCBP2-AS2-201ENST00000428716 428 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 AC092839.2-201ENST00000431130 377 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 OFD1P13Y-201ENST00000431179 1232 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 SEPT7P5-201ENST00000434048 306 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 RPS20P1-201ENST00000434853 354 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 LINC00415-201ENST00000439079 435 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 ACTR3P2-201ENST00000439585 1257 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 AL137845.2-201ENST00000444292 988 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 AL354714.3-201ENST00000447284 493 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 TCEA1P1-201ENST00000449716 880 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 AC092647.2-201ENST00000452998 253 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 AC016751.1-201ENST00000458254 306 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 TPT1P7-201ENST00000458300 517 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 TSACC-207ENST00000470342 601 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 AC006511.1-201ENST00000470614 315 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104 ms